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霍亂弧菌基因表達(dá)分析中內(nèi)參基因的選擇

發(fā)布時間:2017-11-29 01:27

  本文關(guān)鍵詞:霍亂弧菌基因表達(dá)分析中內(nèi)參基因的選擇


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【摘要】:目的確定不同實驗條件下基因表達(dá)分析中的穩(wěn)定內(nèi)參基因。方法以霍亂弧菌O1群El Tor菌株為研究對象,利用qRT-PCR方法比較不同pH值(pH 8.0、pH 5.5)以及不同溫度(37℃、30℃)等多種生理、外界環(huán)境模擬培養(yǎng)條件下,thyA、recA、rpoA、gyrB、16SrRNA以及VCA0862 6個候選內(nèi)參基因的表達(dá)水平,利用geNorm軟件評價其穩(wěn)定性。結(jié)果不同培養(yǎng)條件下,6個候選內(nèi)參基因表達(dá)水平存在差異。不同pH值條件下最佳基因是recA;不同溫度條件下最佳基因是gyrB;不同pH值及溫度綜合評價時,最佳基因是recA。結(jié)論本研究評價和提出了細(xì)菌基因表達(dá)分析中內(nèi)參基因篩選的重要性,不同實驗條件下最穩(wěn)定內(nèi)參基因是不同的,針對不同條件下的基因轉(zhuǎn)錄定量分析,應(yīng)分別對內(nèi)參基因穩(wěn)定性進(jìn)行評價并選擇最穩(wěn)定基因。
【作者單位】: 中國疾病預(yù)防控制中心傳染病預(yù)防控制所;
【基金】:國家科技重大專項(No.2012ZX10004-215) 國家自然科學(xué)基金(No.30800987) 傳染病預(yù)防控制國家重點實驗室資助項目(No.2012SKLID203)~~
【分類號】:R378.3;R3416
【正文快照】: 基因表達(dá)的差異分析在生命科學(xué)研究領(lǐng)域中非 常重要。逆轉(zhuǎn)錄PCR定量分析(Quantitative re-verse transcription PCR,簡稱qRT-PCR)具有高靈敏度、高特異性、快速準(zhǔn)確、高通量等優(yōu)點,可作為基因表達(dá)分析的首選方法之一。然而很多因素能夠影響基因表達(dá)的分析,如樣本類型、實驗處

【參考文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 王海燕;閆梅英;趙英偉;闞飆;;霍亂弧菌甘露醇PTS操縱子中mtlR為轉(zhuǎn)錄抑制基因[J];微生物學(xué)報;2007年03期

【共引文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前6條

1 蔡文凱;胡金璐;李雙雙;單革;王高鴻;;輻射條件下微藻基因表達(dá)內(nèi)參基因的選擇[J];空間科學(xué)學(xué)報;2013年06期

2 魏毅東;陳玉;郭海萍;謝華安;張建福;王宗華;;水稻缺素脅迫下實時熒光定量RT-PCR的內(nèi)參基因的選擇[J];農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報;2013年11期

3 張琳;韓吉昌;楊官品;朱葆華;潘克厚;;Association of triacylglyceride content and transcript abundance of genes involving in lipid synthesis of nitrogen deficient Phaeodactylum tricornutum[J];Chinese Journal of Oceanology and Limnology;2014年02期

4 梁未麗;陳保立;趙萌;周妍妍;闞飆;;霍亂弧菌甘露醇-1-磷酸脫氫酶基因mtlD的克隆表達(dá)[J];疾病監(jiān)測;2014年03期

5 Fernanda Wisnieski;Danielle Queiroz Calcagno;Mariana Ferreira Leal;Leonardo Caires dos Santos;Carolina de Oliveira Gigek;Elizabeth Suchi Chen;Thaís Brilhante Pontes;Paulo Pimentel Assump,

本文編號:1235723


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