本文關(guān)鍵詞：ChIP-seq比較分析人體心臟和脾臟的H3K9三甲基化差異

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【摘要】：目的分析人體器官心臟和脾臟的H3K9me3的全基因圖譜,以期發(fā)現(xiàn)H3K9三甲基化的修飾與組織特異性的表達(dá)、功能和發(fā)育具有相關(guān)性。方法通過(guò)染色質(zhì)免疫共沉淀的方法獲取各標(biāo)本DNA,通過(guò)q PCR驗(yàn)證ChIP結(jié)果,然后構(gòu)建ChIP Sequencing文庫(kù),與目的基因組序列比對(duì),獲取比對(duì)Reads,接著進(jìn)行全基因組的Peak分析,GO功能富集分析peak相關(guān)基因的生物學(xué)功能。結(jié)果心臟和脾臟間有169個(gè)基因有顯著地H3K9me3差異,其中心臟中H3K9me3的基因中有64個(gè)特殊基因,脾臟中H3K9me3的基因中有87個(gè)特殊基因。從這些基因中,挑選出8個(gè)表現(xiàn)H3K9me3明顯的基因,然后再?gòu)倪@8個(gè)基因中挑選出兩個(gè)心臟和脾臟間表現(xiàn)H3K9me3差異最明顯的基因,分別是PTPN3和RBMS。結(jié)論 H3K9me3差異可作為一個(gè)潛在的生物標(biāo)志物或是表觀遺傳疾病的治療靶點(diǎn)。
【作者單位】： 中國(guó)人民解放軍第181醫(yī)院
【基金】：廣西自然科學(xué)基金(2012GXNSFDA053017) 廣西科技基礎(chǔ)設(shè)施建設(shè)項(xiàng)目(11-031-33) 廣西重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室建設(shè)項(xiàng)目(12-071-32)
【分類號(hào)】：R394;Q78
【正文快照】： 在哺乳動(dòng)物基因組中,組蛋白則可以有很多修飾形式。包括組蛋白末端的乙�；�,甲基化,磷酸化,泛素化以及ADP核糖基化等等,這些修飾都會(huì)影響基因的轉(zhuǎn)錄活性。在不同的組織和生物中已廣泛研究并證實(shí)組蛋白H3K9三甲基化(H3K9me3)與異染色質(zhì)形成,基因的表達(dá)和轉(zhuǎn)錄伸長(zhǎng)率具有關(guān)聯(lián)性[1

【共引文獻(xiàn)】

中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前3條

1 顧斌;胚胎干細(xì)胞特征性標(biāo)志物Aire的發(fā)現(xiàn)和功能研究[D];浙江大學(xué);2013年

2 侯靜;間充質(zhì)干細(xì)胞在輻射損傷后干性維持的機(jī)制研究[D];第二軍醫(yī)大學(xué);2013年

3 陳娜;STAT3介導(dǎo)microRNAs調(diào)控的IL-9過(guò)表達(dá)在慢性淋巴細(xì)胞性白血病免疫調(diào)節(jié)機(jī)制中的研究[D];山東大學(xué);2014年

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

1 王琳軼;田杰;鐘立霖;呂鐵偉;吳曉云;朱靜;;姜黃素干預(yù)酒精對(duì)心肌祖細(xì)胞H3K9的高乙�；Ш饧捌浔硗蛔冏饔肹A];第十三次全國(guó)心血管病學(xué)術(shù)會(huì)議論文集[C];2011年

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

1 王琳軼;姜黃素干預(yù)酒精對(duì)心肌祖細(xì)胞H3K9高乙�；Ш饧盎虮磉_(dá)失衡[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2011年

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本文編號(hào)：1168499