本文關(guān)鍵詞：大理地區(qū)結(jié)核分枝桿菌MIRU-VNTR位點(diǎn)的多態(tài)性分析

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【摘要】：目的了解大理地區(qū)結(jié)核分枝桿菌基因組中的數(shù)目可變串聯(lián)重復(fù)序列(variable number tandem repeat,VNTR)即MIRU(mycobacterium interspersed repetitive unit)基因多態(tài)性,探討MIRU-VNTR位點(diǎn)多態(tài)性的應(yīng)用價(jià)值。方法采用PCR和瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)大理地區(qū)臨床分離的60株結(jié)核分枝桿菌7個(gè)VNTR位點(diǎn),采用MIRU-VNTR技術(shù)進(jìn)行分型,利用Hunter-Gaston指數(shù)(HGI)對(duì)各MIRU進(jìn)行分辨力評(píng)價(jià),并應(yīng)用Quantity one軟件和BioNumerics6.6軟件進(jìn)行數(shù)字化和聚類(lèi)分析。結(jié)果 60株結(jié)核分枝桿菌分為5個(gè)基因群(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ群)52個(gè)基因型。Ⅰ群占56.77%,含有29個(gè)基因型;Ⅱ群占25.00%,含有13個(gè)基因型;Ⅲ群占8.33%,含有5個(gè)基因型;Ⅳ群占6.67%,含有3個(gè)基因型;Ⅴ群占3.33%,含有2個(gè)基因型。7位點(diǎn)組合總分辨力為0.900,最高ETR-E位點(diǎn)0.735,最低ETR-C位點(diǎn)0.455。結(jié)論大理地區(qū)分離株結(jié)核分枝桿菌存在基因多態(tài)性,7位點(diǎn)MIRU-VNTR分型簡(jiǎn)便快速,分辨力高,適合用于大理地區(qū)結(jié)核分枝桿菌的基因分型檢測(cè)。
【作者單位】： 大理學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院微生物學(xué)與免疫學(xué)教研室;
【關(guān)鍵詞】： 結(jié)核分枝桿菌 基因分型 多位點(diǎn)可變串聯(lián)重復(fù)序列 多態(tài)性 Hunter-Gaston指數(shù)
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(No.81260456)
【分類(lèi)號(hào)】：R378.911
【正文快照】： ***結(jié)核病是全球流行的傳染病之一,是由結(jié)核分枝桿菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)引起的慢性傳染病,可累及全身各器官。我國(guó)是22個(gè)結(jié)核病高負(fù)擔(dān)國(guó)家之一[1],追蹤傳染源,研究傳播情況是防止我國(guó)結(jié)核病流行的重要內(nèi)容。MTB基因組中的可變串聯(lián)重復(fù)序列(VNTR)即MIRU(mycobact

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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【相似文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：1044264