目的對EgRad54基因進(jìn)行生物信息學(xué)分析,并對細(xì)粒棘球絳蟲不同發(fā)育階段的表達(dá)情況進(jìn)行檢測分析。方法克隆EgRad54基因并對編碼產(chǎn)物的理化性質(zhì)、二、三維結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測和分析;采用MEGA5.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹并進(jìn)行分析;采用qRT-PCR檢測細(xì)粒棘球絳蟲不同發(fā)育階段的EgRad54 mRNA的表達(dá)水平。結(jié)果 EgRad54基因開放閱讀框長度為1 714 bp,NCBI blast比對顯示其序列與原始序列相似性為100%,DNAMAN比對相似性為95.40%;EgRad54蛋白含有581個氨基酸,相對分子質(zhì)量為65.520 45×10³,理論等電點(diǎn)為8.91;在EgRad54蛋白二級結(jié)構(gòu)中,ɑ-螺旋占44.41%,β-折疊占13.25%,β-轉(zhuǎn)角占6.37%,無規(guī)則卷曲占35.97%;三級結(jié)構(gòu)選擇123i.A模型,GMQE為0.78,QMEAN為-3.51,序列相似度為69.33%,覆蓋率為85.20%;進(jìn)化樹顯示EgRad54基因與多房棘球蚴親緣關(guān)系較近;以未消化原頭蚴組作為對照組,qRT-PCR檢測胃蛋白酶消化原頭蚴組和囊泡組Rad54基因相對表達(dá)量分別為1.... 

【文章來源】：中國病原生物學(xué)雜志. 2019,14(11)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：6 頁

【文章目錄】：
材料與方法
    1 材料
    2 方法
        2.1 標(biāo)本收集
        2.2 總RNA提取及cDNA逆轉(zhuǎn)錄
        2.3 基因克隆與測序
        2.4 EgRad54基因編碼蛋白生物信息學(xué)分析
            2.4.1 理化性質(zhì)預(yù)測
            2.4.2 二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu)分析[5]
            2.4.3 EgRad54蛋白多序列比對與進(jìn)化樹的構(gòu)建[6-7]
            2.4.4 不同發(fā)育階段Rad54基因表達(dá)檢測
        2.5 統(tǒng)計學(xué)分析
結(jié) 果
    1 EgRad54基因克隆
    2 EgRad54蛋白理化性質(zhì)
    3 EgRad54蛋白結(jié)構(gòu)
    4 Rad54蛋白多序列比對和進(jìn)化樹分析
    5 Rad54基因表達(dá)分析
討 論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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[5]青蒿琥酯體外抗細(xì)粒棘球蚴活性氧對DNA作用機(jī)制影響的研究[J]. 鄭海亞,文麗梅,呂國棟,盧帥,李亞芬,鄭璇,木扎拜爾·木合地爾,趙軍,王建華.  中國病原生物學(xué)雜志. 2017(08)
[6]包蟲病病原在我國的流行現(xiàn)狀及成因分析[J]. 劉平,李金花,李印,康京麗,戴琪,趙娜,孫向東.  中國動物檢疫. 2016(01)
[7]DNA雙鏈斷裂與同源重組修復(fù)的研究進(jìn)展[J]. 董雋,張?zhí)?文碧秀.  中國醫(yī)學(xué)創(chuàng)新. 2015(03)
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博士論文
[1]DNA雙鏈斷裂修復(fù)信號通路選擇的分子機(jī)制研究[D]. 婁江曼.浙江大學(xué) 2018

碩士論文
[1]我國棘球蚴病疾病負(fù)擔(dān)分析[D]. 張夢媛.中國疾病預(yù)防控制中心 2017



本文編號：3167027