發(fā)布時間：2021-04-29 06:27

　　目的對EgRad54基因進行生物信息學分析,并對細粒棘球絳蟲不同發(fā)育階段的表達情況進行檢測分析。方法克隆EgRad54基因并對編碼產(chǎn)物的理化性質(zhì)、二、三維結(jié)構(gòu)進行預(yù)測和分析;采用MEGA5.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)進化樹并進行分析;采用qRT-PCR檢測細粒棘球絳蟲不同發(fā)育階段的EgRad54 mRNA的表達水平。結(jié)果 EgRad54基因開放閱讀框長度為1 714 bp,NCBI blast比對顯示其序列與原始序列相似性為100%,DNAMAN比對相似性為95.40%;EgRad54蛋白含有581個氨基酸,相對分子質(zhì)量為65.520 45×10³,理論等電點為8.91;在EgRad54蛋白二級結(jié)構(gòu)中,ɑ-螺旋占44.41%,β-折疊占13.25%,β-轉(zhuǎn)角占6.37%,無規(guī)則卷曲占35.97%;三級結(jié)構(gòu)選擇123i.A模型,GMQE為0.78,QMEAN為-3.51,序列相似度為69.33%,覆蓋率為85.20%;進化樹顯示EgRad54基因與多房棘球蚴親緣關(guān)系較近;以未消化原頭蚴組作為對照組,qRT-PCR檢測胃蛋白酶消化原頭蚴組和囊泡組Rad54基因相對表達量分別為1.... 

【文章來源】：中國病原生物學雜志. 2019,14(11)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：6 頁

【文章目錄】：
材料與方法
    1 材料
    2 方法
        2.1 標本收集
        2.2 總RNA提取及cDNA逆轉(zhuǎn)錄
        2.3 基因克隆與測序
        2.4 EgRad54基因編碼蛋白生物信息學分析
            2.4.1 理化性質(zhì)預(yù)測
            2.4.2 二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu)分析[5]
            2.4.3 EgRad54蛋白多序列比對與進化樹的構(gòu)建[6-7]
            2.4.4 不同發(fā)育階段Rad54基因表達檢測
        2.5 統(tǒng)計學分析
結(jié) 果
    1 EgRad54基因克隆
    2 EgRad54蛋白理化性質(zhì)
    3 EgRad54蛋白結(jié)構(gòu)
    4 Rad54蛋白多序列比對和進化樹分析
    5 Rad54基因表達分析
討 論


【參考文獻】：
期刊論文
[1]Veliparib聯(lián)合青蒿琥酯體外抗細粒棘球蚴作用機制的研究[J]. 李亞芬,趙軍,呂國棟,鄭海亞,盧帥,鄭璇,木扎拜爾·木合塔爾,文麗梅,王建華.  中國病原生物學雜志. 2018(07)
[2]甘氨鵝脫氧膽酸對體外細粒棘球蚴原頭節(jié)活力及ROS影響[J]. 湯光耀,姜玉峰,呂海龍,李佳潔,楊仁坦,秦文娟,馬斌,馬容基,王麟堯,陳琳,許雅.  中國人獸共患病學報. 2018(07)
[3]核糖體蛋白S6激酶β1的分子結(jié)構(gòu)和理化性質(zhì)分析[J]. 劉暢,劉安.  生物信息學. 2018(01)
[4]HCV NS2對細胞凋亡及DNA損傷應(yīng)答信號的影響[J]. 趙玫,任來峰,王艷峰,楊萬霞,宋靜,陳思思,任云青,蘇文.  中國病原生物學雜志. 2018(01)
[5]青蒿琥酯體外抗細粒棘球蚴活性氧對DNA作用機制影響的研究[J]. 鄭海亞,文麗梅,呂國棟,盧帥,李亞芬,鄭璇,木扎拜爾·木合地爾,趙軍,王建華.  中國病原生物學雜志. 2017(08)
[6]包蟲病病原在我國的流行現(xiàn)狀及成因分析[J]. 劉平,李金花,李印,康京麗,戴琪,趙娜,孫向東.  中國動物檢疫. 2016(01)
[7]DNA雙鏈斷裂與同源重組修復(fù)的研究進展[J]. 董雋,張?zhí)?文碧秀.  中國醫(yī)學創(chuàng)新. 2015(03)
[8]細粒棘球絳蟲核糖體蛋白S9基因克隆鑒定及其在不同發(fā)育階段表達分析[J]. 肖云峰,劉輝,呂國棟,趙軍,高惠靜,李娟,王建華.  中國病原生物學雜志. 2014(02)

博士論文
[1]DNA雙鏈斷裂修復(fù)信號通路選擇的分子機制研究[D]. 婁江曼.浙江大學 2018

碩士論文
[1]我國棘球蚴病疾病負擔分析[D]. 張夢媛.中國疾病預(yù)防控制中心 2017



本文編號：3167027