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草菇SSR標記遺傳連鎖圖譜的構建

發(fā)布時間:2016-11-10 14:38

  本文關鍵詞:寧波市高校體育舞蹈教學開展的影響因素與發(fā)展對策研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】草菇Volvariavolvacea是原產(chǎn)于熱帶、亞熱帶地區(qū)的重要食用菌,由于其能在高溫季節(jié)出菇且生長周期短的特點,因而在食用菌生產(chǎn)中占據(jù)重要地位。人們對草菇遺傳背景的認識還十分有限,極大地影響了草菇品種改良工作。草菇種質資源的遺傳背景較為狹窄,難以獲得多態(tài)性的分子標記,也阻礙了高密度遺傳圖譜的構建和應用。本研究基于草菇基因組序列開發(fā)SSR標記,構建了草菇遺傳連鎖圖譜。主要結果如下:1.以草菇的兩個栽培菌株屏優(yōu)一號和V23為作圖親本,通過交配型分子標記篩選孢子同核體:將不同交配型的孢子同核體進行雜交,采用交配型分子標記檢測及出菇試驗進行雜交子鑒定;從中隨機選擇一個雜交子PV19進行單孢分離,挑選同核體孢子,建立了包含96個同核體單孢的分離作圖群體。2.基于草菇V23-1基因組序列信息開發(fā)了1346個SSR標記,發(fā)現(xiàn)草菇的SSR位點以單堿基重復為主,其次是三堿基重復和二堿基重復,其它重復類型所占比例較小。利用電子PCR對SSR標記兩作圖親本間的多態(tài)性進行分析,發(fā)現(xiàn)在4020對SSR引物中,1367對引物的電子PCR產(chǎn)物長度存在差異,其中1242對引物的長度差異值小于30bp。選擇658對引物對電子PCR分析結果進行PCR驗證,結果發(fā)現(xiàn)大部分SSR標記在兩親本間的多態(tài)性結果與分析結果相一致,表明應用電子PCR分析將有利于提高多態(tài)性SSR標記的篩選效率。3.選擇在兩親本間具有多態(tài)性的SSR標記在作圖群體中進行檢測,統(tǒng)計標記在群體中的分型情況,利用JoinMap4.0構建草菇遺傳連鎖圖譜。在檢測的123個SSR標記中有118個SSR標記存在連鎖關系,與交配型標記共同構成19個連鎖群。連鎖群的總長度為1287.9cM,平均圖距為10.8cM。在本研究中所構建的草菇遺傳圖譜將為草菇的基因定位與克隆、QTL分析、分子輔助育種、物理圖譜構建乃至比較基因組學研究奠定重要的基礎。
【作者】熊登坤;
【導師】邊銀丙;鮑大鵬;
【作者基本信息】華中農(nóng)業(yè)大學,,特種植物育種與栽培,2014,碩士
【關鍵詞】草菇;遺傳連鎖圖譜;SSR;

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本文編號:170008

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