古田山花臭蛙和華南湍蛙比較景觀遺傳學研究
發(fā)布時間:2022-07-15 16:59
兩棲動物是森林生態(tài)系統(tǒng)中重要的組成部分,對生態(tài)系統(tǒng)的物質(zhì)循環(huán)和能量流動起到至關重要的作用;兩棲動物也是脊椎動物從水生到陸生的重要過渡類群,其生活史周期離不開水、皮膚通透性高等特點使其對棲息地環(huán)境變化極其敏感。因此,兩棲動物是森林生態(tài)環(huán)境質(zhì)量監(jiān)控的理想指示物種,其群落結構特征也是評價該地區(qū)生態(tài)系統(tǒng)質(zhì)量的重要參數(shù)。本研究以古田山國家級自然保護區(qū)內(nèi)同域分布的花臭蛙與華南湍蛙為研究對象,采用微衛(wèi)星分子標記的方法,對種群的遺傳多樣性和遺傳結構進行對比分析,并結合景觀遺傳學方法,優(yōu)化最小費用距離模型,實現(xiàn)景觀連接度的定量分析和潛在廊道的準確定位,在生物多樣性保護和自然保護區(qū)管理規(guī)劃方面提供更為可靠的科學依據(jù)。本文主要研究結果如下:1、利用高通量測序的方法,從華南湍蛙基因組中開發(fā)了12對具有多態(tài)性的微衛(wèi)星標記。使用一個華南湍蛙野生群體(26個)對通過篩選的微衛(wèi)星標記的種群遺傳學特征進行評價。共檢測到92個等位基因,等位基因數(shù)分布范圍為2~19,平均為7.67;觀測雜合度分布范圍為0.423~1.000,平均為0.808;期望雜合度分布范圍為0.510~0.945,平均0.755;多態(tài)信息含量分布范圍...
【文章頁數(shù)】:76 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻綜述
1 景觀遺傳學
1.1 背景
1.2 景觀遺傳學的概念
1.3 景觀遺傳學的研究方法
1.4 景觀遺傳學與連接度
1.5 景觀遺傳學在兩棲類中的研究現(xiàn)狀
1.6 景觀遺傳學在其他動物中的研究現(xiàn)狀
2 研究地與研究物種概述
2.1 研究地概述
2.2 研究物種概述
3 研究目的與意義
第二章 基于高通量測序的華南湍蛙微衛(wèi)星標記開發(fā)與評價
1 引言
2 實驗材料
2.1 樣本采集
2.2 主要實驗試劑和實驗儀器
3 實驗方法
3.1 DNA提取
3.2 高通量測序和微衛(wèi)星位點查找
3.3 引物的設計與篩選
3.4 微衛(wèi)星標記的種群遺傳學評價
4 實驗結果
4.1 華南湍蛙DNA的提取結果
4.2 引物的設計與篩選結果
4.3 微衛(wèi)星標記的種群遺傳學評價
5 討論
5.1 微衛(wèi)星引物的設計與篩選
5.2 華南湍蛙群體的種群遺傳學特征
5.3 高通量測序法獲取微衛(wèi)星序列的優(yōu)越性
第三章 古田山花臭蛙和華南湍蛙遺傳多樣性與遺傳結構
1 引言
2 實驗材料
2.1 樣本采集
2.2 主要實驗試劑和實驗儀器
3 實驗方法
3.1 DNA提取
3.2 PCR群體擴增
3.3 基因分型與數(shù)據(jù)讀取
3.4 數(shù)據(jù)分析
4 實驗結果
4.1 DNA提取與PCR擴增結果
4.2 基因分型與數(shù)據(jù)讀取結果
4.3 數(shù)據(jù)分析結果
5 討論
5.1 種群遺傳多樣性
5.2 種群遺傳分化和遺傳結構
第四章 古田山花臭蛙和華南湍蛙種群景觀連接度分析
1 引言
2 實驗材料
3 實驗方法
3.1 景觀數(shù)據(jù)
3.2 最小成本距離模型
3.3 遺傳數(shù)據(jù)
3.4 確定最佳模型
4 實驗結果
4.1 景觀數(shù)據(jù)
4.2 遺傳數(shù)據(jù)
4.3 最佳模型
4.4 生態(tài)廊道
5 討論
第五章 小結和展望
參考文獻
附錄
攻讀學位期間參加的科研項目及成果
致謝
本文編號:3662470
【文章頁數(shù)】:76 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻綜述
1 景觀遺傳學
1.1 背景
1.2 景觀遺傳學的概念
1.3 景觀遺傳學的研究方法
1.4 景觀遺傳學與連接度
1.5 景觀遺傳學在兩棲類中的研究現(xiàn)狀
1.6 景觀遺傳學在其他動物中的研究現(xiàn)狀
2 研究地與研究物種概述
2.1 研究地概述
2.2 研究物種概述
3 研究目的與意義
第二章 基于高通量測序的華南湍蛙微衛(wèi)星標記開發(fā)與評價
1 引言
2 實驗材料
2.1 樣本采集
2.2 主要實驗試劑和實驗儀器
3 實驗方法
3.1 DNA提取
3.2 高通量測序和微衛(wèi)星位點查找
3.3 引物的設計與篩選
3.4 微衛(wèi)星標記的種群遺傳學評價
4 實驗結果
4.1 華南湍蛙DNA的提取結果
4.2 引物的設計與篩選結果
4.3 微衛(wèi)星標記的種群遺傳學評價
5 討論
5.1 微衛(wèi)星引物的設計與篩選
5.2 華南湍蛙群體的種群遺傳學特征
5.3 高通量測序法獲取微衛(wèi)星序列的優(yōu)越性
第三章 古田山花臭蛙和華南湍蛙遺傳多樣性與遺傳結構
1 引言
2 實驗材料
2.1 樣本采集
2.2 主要實驗試劑和實驗儀器
3 實驗方法
3.1 DNA提取
3.2 PCR群體擴增
3.3 基因分型與數(shù)據(jù)讀取
3.4 數(shù)據(jù)分析
4 實驗結果
4.1 DNA提取與PCR擴增結果
4.2 基因分型與數(shù)據(jù)讀取結果
4.3 數(shù)據(jù)分析結果
5 討論
5.1 種群遺傳多樣性
5.2 種群遺傳分化和遺傳結構
第四章 古田山花臭蛙和華南湍蛙種群景觀連接度分析
1 引言
2 實驗材料
3 實驗方法
3.1 景觀數(shù)據(jù)
3.2 最小成本距離模型
3.3 遺傳數(shù)據(jù)
3.4 確定最佳模型
4 實驗結果
4.1 景觀數(shù)據(jù)
4.2 遺傳數(shù)據(jù)
4.3 最佳模型
4.4 生態(tài)廊道
5 討論
第五章 小結和展望
參考文獻
附錄
攻讀學位期間參加的科研項目及成果
致謝
本文編號:3662470
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