茶園周邊景觀格局對茶小綠葉蟬種群遺傳結(jié)構(gòu)的影響
發(fā)布時(shí)間:2020-12-13 00:25
【目的】研究不同茶園茶小綠葉蟬Empoasca onukii種群的遺傳分化和基因流格局,探究其種群遺傳結(jié)構(gòu)差異和擴(kuò)散特點(diǎn)及其與茶園景觀格局的關(guān)系!痉椒ā恳愿=ㄊ“蚕h為研究區(qū)域,在運(yùn)用ArcMap10.5和R軟件包raster分析研究區(qū)域景觀組成和結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上,選取周邊景觀格局不同的18個(gè)茶園采集茶小綠葉蟬(530個(gè)個(gè)體),基于23個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)對這些個(gè)體進(jìn)行PCR擴(kuò)增和基因型測定,采用ARLEQUIN 3.5.2, FSTAT 2.9.3和R軟件包adegenet 2.0.0分析其遺傳多樣性和遺傳分化情況;采用STRUCTURE 2.3.4和R軟件包adegenet 2.0.0中的DAPC程序分析其種群遺傳分化;利用BAYESASS 3.0.4估算種群間最近幾代的遷移率;同時(shí)利用景觀遺傳學(xué)的統(tǒng)計(jì)方法Mantel、距離矩陣多元回歸模型(MRM)和一般線性模型(GLMM)將茶小綠葉蟬種群遺傳分化與景觀組成和景觀結(jié)構(gòu)的空間數(shù)據(jù)進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析。【結(jié)果】供試18個(gè)茶小綠葉蟬種群的23個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)的等位基因數(shù)為9~52,等位基因豐富度(AR)為3.686~4.397,基因多樣...
【文章來源】:昆蟲學(xué)報(bào). 2020年10期 北大核心
【文章頁數(shù)】:18 頁
【部分圖文】:
一般線性模型分析茶小綠葉蟬種群Provesti氏遺傳距離(A, D)、Nei氏遺傳距離(B, E)和遺傳分化指數(shù)(C, F)與地理距離和采樣點(diǎn)周圍半徑1 000 m范圍內(nèi)草地面積占比的線性關(guān)系
Simple Mantel分析顯示地理距離(geo)與Provesti氏遺傳距離(r=0.2938, P=0.0088)、Nei氏遺傳距離(r=0.2015, P=0.0455)以及遺傳分化指數(shù)(r=0.2052, P=0.0301)之間均存在顯著的相關(guān)性(表8)。在排除了地理距離(geo)的影響后,Partial Mantel分析顯示,11個(gè)景觀組成因子均與Provesti氏遺傳距離、Nei氏遺傳距離和遺傳分化指數(shù)顯著相關(guān),而海拔(elevation)和與景觀結(jié)構(gòu)有關(guān)的所有因子均沒有檢測到與Provesti氏遺傳距離、Nei氏遺傳距離和遺傳分化指數(shù)有顯著相關(guān)性。表5 茶小綠葉蟬不同種群之間的Nei氏遺傳距離(下三角)和Provesti氏遺傳距離(上三角)值Table 5 Nei’s genetic distance (below diagonal) and Provesti’s genetic distance (above diagonal)values among different populations of Empoasca onukii 種群Populations FX MB SL SG HL XH HM WZ HZ XG JD FQ JB YY LT MS XD JY FX 0.394 0.371 0.378 0.356 0.246 0.363 0.397 0.337 0.236 0.322 0.532 0.350 0.348 0.367 0.339 0.355 0.340 MB 0.300 0.526 0.491 0.258 0.387 0.459 0.296 0.358 0.367 0.368 0.448 0.393 0.422 0.449 0.436 0.398 0.405 SL 0.259 0.664 0.275 0.496 0.395 0.286 0.535 0.422 0.403 0.425 0.650 0.402 0.305 0.312 0.316 0.398 0.405 SG 0.298 0.614 0.091 0.447 0.392 0.243 0.509 0.407 0.386 0.421 0.640 0.372 0.286 0.310 0.302 0.435 0.421 HL 0.250 0.066 0.555 0.507 0.353 0.436 0.284 0.336 0.342 0.320 0.467 0.374 0.380 0.413 0.410 0.388 0.376 XH 0.059 0.323 0.279 0.319 0.245 0.367 0.373 0.300 0.265 0.327 0.533 0.374 0.349 0.369 0.345 0.340 0.357 HM 0.248 0.510 0.096 0.060 0.434 0.257 0.478 0.397 0.384 0.413 0.619 0.358 0.274 0.287 0.264 0.377 0.375 WZ 0.314 0.093 0.645 0.606 0.115 0.306 0.533 0.348 0.377 0.404 0.425 0.417 0.444 0.461 0.437 0.399 0.398 HZ 0.141 0.245 0.347 0.344 0.198 0.125 0.305 0.208 0.352 0.294 0.529 0.411 0.348 0.410 0.385 0.391 0.406 XG 0.045 0.282 0.285 0.307 0.238 0.072 0.265 0.304 0.169 0.354 0.549 0.362 0.342 0.371 0.355 0.351 0.364 JD 0.146 0.270 0.335 0.363 0.210 0.149 0.308 0.303 0.101 0.192 0.552 0.433 0.381 0.411 0.402 0.433 0.453 FQ 0.536 0.236 0.984 0.927 0.279 0.548 0.848 0.201 0.436 0.541 0.546 0.549 0.593 0.592 0.593 0.537 0.536 JB 0.202 0.265 0.282 0.253 0.223 0.227 0.221 0.295 0.281 0.187 0.378 0.484 0.340 0.351 0.362 0.261 0.241 YY 0.199 0.411 0.100 0.106 0.334 0.214 0.092 0.433 0.226 0.206 0.263 0.708 0.177 0.248 0.255 0.359 0.380 LT 0.230 0.445 0.114 0.141 0.367 0.249 0.100 0.459 0.304 0.243 0.316 0.727 0.217 0.070 0.207 0.387 0.378 MS 0.208 0.442 0.115 0.128 0.371 0.221 0.092 0.441 0.276 0.222 0.303 0.724 0.220 0.069 0.042 0.363 0.377 XD 0.206 0.279 0.372 0.318 0.222 0.191 0.278 0.297 0.271 0.179 0.381 0.468 0.072 0.239 0.290 0.278 0.248 JY 0.184 0.270 0.351 0.295 0.225 0.211 0.288 0.263 0.256 0.180 0.380 0.434 0.069 0.239 0.259 0.262 0.075
圖3 一般線性模型分析茶小綠葉蟬種群Provesti氏遺傳距離(A, D)、Nei氏遺傳距離(B, E)和遺傳分化指數(shù)(C, F)與地理距離和采樣點(diǎn)周圍半徑1 000 m范圍內(nèi)草地面積占比的線性關(guān)系一般線性模型分析顯示,采樣點(diǎn)周圍半徑1 000 m范圍內(nèi)草地面積占比和地理距離與茶小綠葉蟬種群Provesti氏遺傳距離、Nei氏遺傳距離和遺傳分化指數(shù)線性關(guān)系顯著(圖3),種群遺傳距離隨著地理距離的增加而顯著變大(r=0.2015~0.2938, P=0.0002~0.0120)(圖3: A, B, C),也隨著采樣點(diǎn)周圍半徑1 000 m范圍內(nèi)草地面積占比的變大而顯著變大(r=0.1866~0.2604, P=0.0015~0.0226)(圖3: D, E, F)。同時(shí),采樣點(diǎn)周圍半徑1 000 m范圍內(nèi)草地面積占比與茶小綠葉蟬種群He和DIV之間的線性關(guān)系也是顯著的(圖4: A, C),茶小綠葉蟬種群遺傳多樣性水平隨著采樣點(diǎn)周圍半徑1 000 m范圍內(nèi)草地面積占比的變大而變大(r=0.4829~0.5222, P=0.0267~0.0426)。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]茶園間作功能植物對茶小綠葉蟬的調(diào)控作用[J]. 陳李林,陳平,王優(yōu),馬旭,林金科,趙紫華. 植物保護(hù)學(xué)報(bào). 2019(05)
[2]基于地理加權(quán)回歸的茶葉種植專業(yè)化空間格局及影響因素——以福建省安溪縣為例[J]. 稅偉,杜勇,陳毅萍,簡小枚,范冰雄. 應(yīng)用生態(tài)學(xué)報(bào). 2017(04)
[3]假眼小綠葉蟬微衛(wèi)星位點(diǎn)的生物信息學(xué)分析[J]. 李倩,陳學(xué)新,韓寶瑜. 昆蟲學(xué)報(bào). 2016(04)
[4]基于16S rRNA基因序列的11個(gè)假眼小綠葉蟬地理種群遺傳分化研究[J]. 陳世春,王曉慶,彭萍,胡翔,段小鳳,林強(qiáng). 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2015(02)
[5]假眼小綠葉蟬的日飛行活動(dòng)性及成蟲飛行能力的研究[J]. 邊磊,孫曉玲,陳宗懋. 茶葉科學(xué). 2014(03)
[6]不同農(nóng)業(yè)景觀結(jié)構(gòu)對麥蚜種群動(dòng)態(tài)的影響[J]. 趙紫華,石云,賀達(dá)漢,杭佳,趙映書,王穎. 生態(tài)學(xué)報(bào). 2010(23)
[7]假眼小綠葉蟬卵纓小蜂的生物學(xué)特性研究[J]. 李慧玲,林乃銓. 茶葉科學(xué). 2008(06)
[8]假眼小綠葉蟬卵的寄生蜂種類及種群動(dòng)態(tài)[J]. 毛迎新,鄒武,馬新華,高明清,林乃銓. 昆蟲知識. 2008(03)
[9]茶園病蟲區(qū)系的構(gòu)成和演替[J]. 陳宗懋. 中國茶葉. 1979(01)
碩士論文
[1]基于線粒體CO Ⅰ和CO Ⅱ基因的茶園假眼小綠葉蟬地理種群的遺傳分化研究[D]. 周寧寧.中國計(jì)量學(xué)院 2014
[2]基于線粒體基因的假眼小綠葉蟬遺傳多樣性研究[D]. 李樂.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2012
本文編號:2913534
【文章來源】:昆蟲學(xué)報(bào). 2020年10期 北大核心
【文章頁數(shù)】:18 頁
【部分圖文】:
一般線性模型分析茶小綠葉蟬種群Provesti氏遺傳距離(A, D)、Nei氏遺傳距離(B, E)和遺傳分化指數(shù)(C, F)與地理距離和采樣點(diǎn)周圍半徑1 000 m范圍內(nèi)草地面積占比的線性關(guān)系
Simple Mantel分析顯示地理距離(geo)與Provesti氏遺傳距離(r=0.2938, P=0.0088)、Nei氏遺傳距離(r=0.2015, P=0.0455)以及遺傳分化指數(shù)(r=0.2052, P=0.0301)之間均存在顯著的相關(guān)性(表8)。在排除了地理距離(geo)的影響后,Partial Mantel分析顯示,11個(gè)景觀組成因子均與Provesti氏遺傳距離、Nei氏遺傳距離和遺傳分化指數(shù)顯著相關(guān),而海拔(elevation)和與景觀結(jié)構(gòu)有關(guān)的所有因子均沒有檢測到與Provesti氏遺傳距離、Nei氏遺傳距離和遺傳分化指數(shù)有顯著相關(guān)性。表5 茶小綠葉蟬不同種群之間的Nei氏遺傳距離(下三角)和Provesti氏遺傳距離(上三角)值Table 5 Nei’s genetic distance (below diagonal) and Provesti’s genetic distance (above diagonal)values among different populations of Empoasca onukii 種群Populations FX MB SL SG HL XH HM WZ HZ XG JD FQ JB YY LT MS XD JY FX 0.394 0.371 0.378 0.356 0.246 0.363 0.397 0.337 0.236 0.322 0.532 0.350 0.348 0.367 0.339 0.355 0.340 MB 0.300 0.526 0.491 0.258 0.387 0.459 0.296 0.358 0.367 0.368 0.448 0.393 0.422 0.449 0.436 0.398 0.405 SL 0.259 0.664 0.275 0.496 0.395 0.286 0.535 0.422 0.403 0.425 0.650 0.402 0.305 0.312 0.316 0.398 0.405 SG 0.298 0.614 0.091 0.447 0.392 0.243 0.509 0.407 0.386 0.421 0.640 0.372 0.286 0.310 0.302 0.435 0.421 HL 0.250 0.066 0.555 0.507 0.353 0.436 0.284 0.336 0.342 0.320 0.467 0.374 0.380 0.413 0.410 0.388 0.376 XH 0.059 0.323 0.279 0.319 0.245 0.367 0.373 0.300 0.265 0.327 0.533 0.374 0.349 0.369 0.345 0.340 0.357 HM 0.248 0.510 0.096 0.060 0.434 0.257 0.478 0.397 0.384 0.413 0.619 0.358 0.274 0.287 0.264 0.377 0.375 WZ 0.314 0.093 0.645 0.606 0.115 0.306 0.533 0.348 0.377 0.404 0.425 0.417 0.444 0.461 0.437 0.399 0.398 HZ 0.141 0.245 0.347 0.344 0.198 0.125 0.305 0.208 0.352 0.294 0.529 0.411 0.348 0.410 0.385 0.391 0.406 XG 0.045 0.282 0.285 0.307 0.238 0.072 0.265 0.304 0.169 0.354 0.549 0.362 0.342 0.371 0.355 0.351 0.364 JD 0.146 0.270 0.335 0.363 0.210 0.149 0.308 0.303 0.101 0.192 0.552 0.433 0.381 0.411 0.402 0.433 0.453 FQ 0.536 0.236 0.984 0.927 0.279 0.548 0.848 0.201 0.436 0.541 0.546 0.549 0.593 0.592 0.593 0.537 0.536 JB 0.202 0.265 0.282 0.253 0.223 0.227 0.221 0.295 0.281 0.187 0.378 0.484 0.340 0.351 0.362 0.261 0.241 YY 0.199 0.411 0.100 0.106 0.334 0.214 0.092 0.433 0.226 0.206 0.263 0.708 0.177 0.248 0.255 0.359 0.380 LT 0.230 0.445 0.114 0.141 0.367 0.249 0.100 0.459 0.304 0.243 0.316 0.727 0.217 0.070 0.207 0.387 0.378 MS 0.208 0.442 0.115 0.128 0.371 0.221 0.092 0.441 0.276 0.222 0.303 0.724 0.220 0.069 0.042 0.363 0.377 XD 0.206 0.279 0.372 0.318 0.222 0.191 0.278 0.297 0.271 0.179 0.381 0.468 0.072 0.239 0.290 0.278 0.248 JY 0.184 0.270 0.351 0.295 0.225 0.211 0.288 0.263 0.256 0.180 0.380 0.434 0.069 0.239 0.259 0.262 0.075
圖3 一般線性模型分析茶小綠葉蟬種群Provesti氏遺傳距離(A, D)、Nei氏遺傳距離(B, E)和遺傳分化指數(shù)(C, F)與地理距離和采樣點(diǎn)周圍半徑1 000 m范圍內(nèi)草地面積占比的線性關(guān)系一般線性模型分析顯示,采樣點(diǎn)周圍半徑1 000 m范圍內(nèi)草地面積占比和地理距離與茶小綠葉蟬種群Provesti氏遺傳距離、Nei氏遺傳距離和遺傳分化指數(shù)線性關(guān)系顯著(圖3),種群遺傳距離隨著地理距離的增加而顯著變大(r=0.2015~0.2938, P=0.0002~0.0120)(圖3: A, B, C),也隨著采樣點(diǎn)周圍半徑1 000 m范圍內(nèi)草地面積占比的變大而顯著變大(r=0.1866~0.2604, P=0.0015~0.0226)(圖3: D, E, F)。同時(shí),采樣點(diǎn)周圍半徑1 000 m范圍內(nèi)草地面積占比與茶小綠葉蟬種群He和DIV之間的線性關(guān)系也是顯著的(圖4: A, C),茶小綠葉蟬種群遺傳多樣性水平隨著采樣點(diǎn)周圍半徑1 000 m范圍內(nèi)草地面積占比的變大而變大(r=0.4829~0.5222, P=0.0267~0.0426)。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]茶園間作功能植物對茶小綠葉蟬的調(diào)控作用[J]. 陳李林,陳平,王優(yōu),馬旭,林金科,趙紫華. 植物保護(hù)學(xué)報(bào). 2019(05)
[2]基于地理加權(quán)回歸的茶葉種植專業(yè)化空間格局及影響因素——以福建省安溪縣為例[J]. 稅偉,杜勇,陳毅萍,簡小枚,范冰雄. 應(yīng)用生態(tài)學(xué)報(bào). 2017(04)
[3]假眼小綠葉蟬微衛(wèi)星位點(diǎn)的生物信息學(xué)分析[J]. 李倩,陳學(xué)新,韓寶瑜. 昆蟲學(xué)報(bào). 2016(04)
[4]基于16S rRNA基因序列的11個(gè)假眼小綠葉蟬地理種群遺傳分化研究[J]. 陳世春,王曉慶,彭萍,胡翔,段小鳳,林強(qiáng). 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2015(02)
[5]假眼小綠葉蟬的日飛行活動(dòng)性及成蟲飛行能力的研究[J]. 邊磊,孫曉玲,陳宗懋. 茶葉科學(xué). 2014(03)
[6]不同農(nóng)業(yè)景觀結(jié)構(gòu)對麥蚜種群動(dòng)態(tài)的影響[J]. 趙紫華,石云,賀達(dá)漢,杭佳,趙映書,王穎. 生態(tài)學(xué)報(bào). 2010(23)
[7]假眼小綠葉蟬卵纓小蜂的生物學(xué)特性研究[J]. 李慧玲,林乃銓. 茶葉科學(xué). 2008(06)
[8]假眼小綠葉蟬卵的寄生蜂種類及種群動(dòng)態(tài)[J]. 毛迎新,鄒武,馬新華,高明清,林乃銓. 昆蟲知識. 2008(03)
[9]茶園病蟲區(qū)系的構(gòu)成和演替[J]. 陳宗懋. 中國茶葉. 1979(01)
碩士論文
[1]基于線粒體CO Ⅰ和CO Ⅱ基因的茶園假眼小綠葉蟬地理種群的遺傳分化研究[D]. 周寧寧.中國計(jì)量學(xué)院 2014
[2]基于線粒體基因的假眼小綠葉蟬遺傳多樣性研究[D]. 李樂.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2012
本文編號:2913534
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