腫瘤細(xì)胞表型轉(zhuǎn)換的非線性隨機(jī)動(dòng)力學(xué)研究
發(fā)布時(shí)間:2020-12-07 05:32
腫瘤,特別是惡性腫瘤,是危害人類健康的重大疾病之一,其中結(jié)腸癌和乳腺癌分別是男性和女性癌癥患者發(fā)生率和死亡率較高的兩種癌癥。在臨床治療上,腫瘤異質(zhì)性一直是臨床醫(yī)生治療癌癥時(shí)面臨的一個(gè)重大問(wèn)題。大量實(shí)驗(yàn)表明:腫瘤的異質(zhì)性與腫瘤內(nèi)部存在多種不同的癌細(xì)胞表型及細(xì)胞表型之間存在隨機(jī)轉(zhuǎn)換的行為具有密切關(guān)系。因此,研究癌細(xì)胞不同表型之間的隨機(jī)轉(zhuǎn)換的生物學(xué)機(jī)制以及動(dòng)力學(xué)行為已成為生物物理學(xué)的前沿課題之一。本文主要利用隨機(jī)非線性理論以及數(shù)值模擬技術(shù),分別針對(duì)結(jié)腸隱窩中與結(jié)腸癌產(chǎn)生密切相關(guān)的三種細(xì)胞表型的單向轉(zhuǎn)換系統(tǒng)和乳腺腫瘤中三種細(xì)胞表型的雙向轉(zhuǎn)換系統(tǒng)展開(kāi)了細(xì)胞表型轉(zhuǎn)換的非線性隨機(jī)動(dòng)力學(xué)機(jī)制研究,取得了以下研究成果:(1)基于結(jié)腸隱窩的連續(xù)確定性模型,引入四種反饋機(jī)制(LL,LS,SL,SS),我們研究了噪聲對(duì)結(jié)腸隱窩中各細(xì)胞種群穩(wěn)態(tài)附近相對(duì)漲落的影響。利用Langevin理論,從理論上推導(dǎo)出系統(tǒng)在穩(wěn)態(tài)附近的Fano因子、協(xié)方差以及敏感性等理論公式;在合理的參數(shù)條件下,對(duì)不同反饋機(jī)制中三種細(xì)胞種群(干細(xì)胞、過(guò)渡細(xì)胞、完全分化細(xì)胞)隨時(shí)間的演化過(guò)程、各穩(wěn)態(tài)值隨凈增長(zhǎng)率的變化規(guī)律及穩(wěn)態(tài)附近的相對(duì)漲落大小進(jìn)...
【文章來(lái)源】:華中師范大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:119 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
Tomlinson和Bodmer隔室模型示意圖[[45]a
博i學(xué)位論文??\^^p/?DOCTORAL?DISSERTATION??(圖1.6左),其中圖中的Xi可以表示GATAK?OCT4或Nanog,而X2表示相對(duì)應(yīng)??的其它三個(gè)基因中另一個(gè)。??根據(jù)這一簡(jiǎn)單的唯象模型,可以寫出一個(gè)與之對(duì)應(yīng)的能夠描述該模型的動(dòng)力學(xué)??ODEs??(1.32)??dt?Sn+xn2?111?;??^?=?_35L?+?Ji^1__kx?=?F?(1.33)??dt?Sn+xn2?Sn?+?x^?2??其中Jd,&表示相應(yīng)地轉(zhuǎn)錄因子乂1和又2表達(dá)量隨時(shí)間的變化量,ai,?&表示兩個(gè)??因子的自刺激強(qiáng)度,Zn,&分別表示一個(gè)轉(zhuǎn)錄因子對(duì)另一個(gè)因子的抑制能力,幻,??分別表示兩因子的自身降解速率。參數(shù)S1為方程中階梯函數(shù)(希爾函數(shù))轉(zhuǎn)換的??臨界閾值,而《是希爾系數(shù),代表函數(shù)的變化的陡峭程度!对酱蟊硎鞠柡瘮(shù)變??化越陡峭。??一?:j;??d?i??-1?-1.5??X??圖1.6簡(jiǎn)單的兩基因互抑制調(diào)控模型(左)以及重建的Waddington的表觀遺傳景觀圖(右)??[62,63]?〇??考慮細(xì)胞內(nèi)部噪聲的影響,上述確定性常微分方程(1.32)和(1.33)可以寫?
四種反饋機(jī)制都可以用來(lái)描述正常狀態(tài)的結(jié)腸隱窩內(nèi)各細(xì)胞種群的動(dòng)力學(xué)行為,即??千細(xì)胞的大小始終很小且三種細(xì)胞表型在不同的初始條件下都可以達(dá)到一個(gè)固定??的動(dòng)態(tài)平衡狀態(tài)(圖3.2)。這些結(jié)果表明在描述健康的結(jié)腸隱窩細(xì)胞群體動(dòng)力學(xué)行??為時(shí),四種可能的反饋機(jī)制都是有效的,無(wú)法區(qū)分哪種反饋機(jī)制更加合理。??下面我們考慮含有隨機(jī)漲落的情況,三種細(xì)胞表型的細(xì)胞數(shù)隨時(shí)間的變化可以??用以下的隨機(jī)動(dòng)力學(xué)方程表示:??^?=?(ar3-a〇N0-(a2?+?k〇N〇?)N0+^0Ct)?(3.9)??at?l?+?m0N。??^?=?(A-?AW? ̄(A?+7^r)^i+(?2?)Ar°?+^>(/)?(3.10)??at?1?+?w^?l?+?mQN0??^+?^+^?(〇?〇.?id??at?1?+?mlNl??其中6(0?G_?=?0,l,2.)分別是三種細(xì)胞表型隨機(jī)噪聲項(xiàng)。這里,我們?cè)诖_定性方程??(3.1)?-?(3.3)右邊直接加入一個(gè)隨機(jī)噪聲項(xiàng)用來(lái)表示系統(tǒng)的內(nèi)噪聲,而三個(gè)內(nèi)??噪聲在穩(wěn)態(tài)附近的統(tǒng)計(jì)性質(zhì)可以利用Langevin理論的兩個(gè)基本假設(shè)得到[67]。它們??分別是:??48??
本文編號(hào):2902721
【文章來(lái)源】:華中師范大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:119 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
Tomlinson和Bodmer隔室模型示意圖[[45]a
博i學(xué)位論文??\^^p/?DOCTORAL?DISSERTATION??(圖1.6左),其中圖中的Xi可以表示GATAK?OCT4或Nanog,而X2表示相對(duì)應(yīng)??的其它三個(gè)基因中另一個(gè)。??根據(jù)這一簡(jiǎn)單的唯象模型,可以寫出一個(gè)與之對(duì)應(yīng)的能夠描述該模型的動(dòng)力學(xué)??ODEs??(1.32)??dt?Sn+xn2?111?;??^?=?_35L?+?Ji^1__kx?=?F?(1.33)??dt?Sn+xn2?Sn?+?x^?2??其中Jd,&表示相應(yīng)地轉(zhuǎn)錄因子乂1和又2表達(dá)量隨時(shí)間的變化量,ai,?&表示兩個(gè)??因子的自刺激強(qiáng)度,Zn,&分別表示一個(gè)轉(zhuǎn)錄因子對(duì)另一個(gè)因子的抑制能力,幻,??分別表示兩因子的自身降解速率。參數(shù)S1為方程中階梯函數(shù)(希爾函數(shù))轉(zhuǎn)換的??臨界閾值,而《是希爾系數(shù),代表函數(shù)的變化的陡峭程度!对酱蟊硎鞠柡瘮(shù)變??化越陡峭。??一?:j;??d?i??-1?-1.5??X??圖1.6簡(jiǎn)單的兩基因互抑制調(diào)控模型(左)以及重建的Waddington的表觀遺傳景觀圖(右)??[62,63]?〇??考慮細(xì)胞內(nèi)部噪聲的影響,上述確定性常微分方程(1.32)和(1.33)可以寫?
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