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黃櫨的親緣地理學(xué)和景觀遺傳學(xué)研究

發(fā)布時(shí)間:2019-07-25 19:26
【摘要】:黃櫨(Cotinus coggygria Scop.)為漆樹科(Anacardiaceae)植物,落葉灌木或小喬木。在中國主要分布在河北,河南,湖北,陜西,山東和山西省,基本上覆蓋了中國落葉闊葉林的分布區(qū)。本次研究中,我們選用了在中國暖溫帶地區(qū)廣布的物種黃櫨為研究對(duì)象,對(duì)其親緣地理結(jié)構(gòu)和景觀遺傳格局進(jìn)行了研究,結(jié)果如下:1我們選用了一個(gè)葉綠體非編碼片段(trnL-F)和生態(tài)位模型來檢測(cè)黃櫨的親緣地理結(jié)構(gòu)。通過對(duì)葉綠體數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,我們將黃櫨15個(gè)種群分為兩個(gè)遺傳類群(南群和北群),這個(gè)結(jié)果與地理區(qū)域相一致。對(duì)兩個(gè)遺傳類群分化時(shí)間分析可知:兩個(gè)類群的分化時(shí)間大概在147000年,這個(gè)時(shí)間正好和黃河下游的形成時(shí)間比較一致,說明黃河對(duì)這個(gè)物種的傳播有一定的地理阻隔作用,但是阻隔作用相對(duì)較弱。本研究通過分子數(shù)據(jù)和生態(tài)位模型分析顯示黃櫨在冰期過后并沒有經(jīng)歷種群的擴(kuò)增。本研究認(rèn)為黃櫨在第四紀(jì)冰期受到影響較小,多數(shù)種群在原地存活,以本地適應(yīng)的方式應(yīng)對(duì)氣候變化。該發(fā)現(xiàn)與暖溫帶植被在第四紀(jì)冰期受到較大影響后通過長(zhǎng)距離遷徙被壓縮到幾個(gè)大的主要避難所的假說相反。2我們采用SSR標(biāo)記進(jìn)行景觀遺傳學(xué)分析。首先,運(yùn)用Shotgun454焦磷酸測(cè)序技術(shù)對(duì)黃櫨的基因組進(jìn)行微衛(wèi)星標(biāo)記的開發(fā)。從40074個(gè)序列中,鑒定出了349個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn),并為這些位點(diǎn)設(shè)計(jì)了引物。我們從349位點(diǎn)中選出50對(duì)引物進(jìn)行多態(tài)性驗(yàn)證,其中8對(duì)引物具有多態(tài)性。8個(gè)位點(diǎn)的等位基因數(shù)目平均每個(gè)位點(diǎn)3.5個(gè),等位基因數(shù)從2到5,近交系數(shù)從-0.478到0.222,觀察雜合度和預(yù)期雜合度分別是從0.167到0.750,0.163到0.222。其次,我們用開發(fā)的這8個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記進(jìn)行黃櫨的適應(yīng)性遺傳變異的檢驗(yàn)。從16個(gè)野生居群的142個(gè)個(gè)體植物通過基因分型分離出43個(gè)微衛(wèi)星等位基因。通過數(shù)據(jù)分析可知:在黃櫨群體中存在顯著的遺傳分化,導(dǎo)致其分化的原因有地理距離,人類活動(dòng),降雨。通過相關(guān)的分析,我們找到了與降水相關(guān)的5個(gè)生態(tài)位相關(guān)的微衛(wèi)星等位基因。我們的結(jié)果表明,降雨是促進(jìn)黃櫨發(fā)生適應(yīng)性遺傳分化的一個(gè)重要因素。
【學(xué)位授予單位】:河南農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:S687

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):2519305

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