紅花檵木LcDRF1和LcDRF2基因克隆及亞細(xì)胞定位分析
發(fā)布時(shí)間:2023-05-19 01:53
【目的】克隆紅花檵木二氫黃酮醇-4-還原酶(DFR)基因(LcDFR1和LcDFR2),并對(duì)其進(jìn)行亞細(xì)胞定位,為揭示紅花檵木花青苷的分子合成機(jī)理提供理論依據(jù)!痉椒ā炕诩t花檵木轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),以紅花檵木葉片cDNA為模板,RT-PCR克隆LcDFR1和LcDFR2基因開(kāi)放閱讀框(ORF)序列,利用生物信息學(xué)軟件對(duì)其進(jìn)行分析,并通過(guò)煙草葉片瞬時(shí)表達(dá)方法觀察蛋白的亞細(xì)胞定位情況!窘Y(jié)果】克隆獲得的紅花檵木LcDFR1和LcDFR2基因ORF序列分別為1014和993 bp,分別編碼337和330個(gè)氨基酸殘基。LcDFR1與LcDFR2的氨基酸序列相似性為77%,二者與其他物種DFRs氨基酸序列的相似性均較高,其中與葡萄、山核桃、擬南芥等雙子葉植物的DFRs氨基酸序列相似性為64%~84%,而與單子葉植物玉米和水稻的DFRs氨基酸序列相似性為58%~61%,表明不同物種DFRs氨基酸序列具有較高的保守性。在基于DFRs氨基酸序列相似性構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹(shù)上,LcDFR1與牡丹和芍藥的DFRs聚為一類,而LcDFR2與煙草和番茄的DFRs聚為一類。結(jié)合前人研究結(jié)果推測(cè)LcDFR1和LcDFR2的...
【文章頁(yè)數(shù)】:10 頁(yè)
【文章目錄】:
0 引言
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.2 RNA提取和第一鏈c DNA合成
1.3 Lc DFR1和Lc DFR2基因克隆
1.4 生物信息學(xué)分析
1.5 植物表達(dá)載體構(gòu)建及亞細(xì)胞定位
2 結(jié)果與分析
2.1 Lc DFR1和Lc DFR2基因克隆及序列分析結(jié)果
2.2 同源性比對(duì)分析及系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建結(jié)果
2.3 Lc DFR1和Lc DFR2蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)結(jié)果
2.4 植物表達(dá)載體構(gòu)建及亞細(xì)胞定位結(jié)果
3 討論
4 結(jié)論
本文編號(hào):3819425
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0 引言
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.2 RNA提取和第一鏈c DNA合成
1.3 Lc DFR1和Lc DFR2基因克隆
1.4 生物信息學(xué)分析
1.5 植物表達(dá)載體構(gòu)建及亞細(xì)胞定位
2 結(jié)果與分析
2.1 Lc DFR1和Lc DFR2基因克隆及序列分析結(jié)果
2.2 同源性比對(duì)分析及系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建結(jié)果
2.3 Lc DFR1和Lc DFR2蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)結(jié)果
2.4 植物表達(dá)載體構(gòu)建及亞細(xì)胞定位結(jié)果
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