大花四照花是極具開(kāi)發(fā)價(jià)值的觀賞性植物資源,合理開(kāi)發(fā)和可持續(xù)利用其種質(zhì)資源十分必要。本研究以第二代高通量測(cè)序的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)為基礎(chǔ),通過(guò)MISA軟件對(duì)大花四照花轉(zhuǎn)錄組的SSR位點(diǎn)進(jìn)行篩選和分析。結(jié)果顯示,共獲得30 401個(gè)SSR位點(diǎn),SSR的分布頻率為22.90%,平均每2.88 kb出現(xiàn)一個(gè)SSR位點(diǎn);大花四照花SSR位點(diǎn)的重復(fù)類型以單核苷酸重復(fù)和二核苷酸重復(fù)為主,各占所有位點(diǎn)的45.73%和37.98%;重復(fù)基序類型較為豐富,共有196種,其中單核苷酸A/T重復(fù)類型的數(shù)量最多。SSR的重復(fù)次數(shù)主要以5～30次為主,長(zhǎng)度分布在10～87 bp之間,平均長(zhǎng)度為17.39 bp。隨機(jī)選取48對(duì)設(shè)計(jì)的SSR引物進(jìn)行PCR檢測(cè),共有35對(duì)引物能擴(kuò)增出單一、清晰的條帶,有效擴(kuò)增率為72.92%。大花四照花轉(zhuǎn)錄組中SSR位點(diǎn)的數(shù)量和種類比較豐富,分布密度較大,初步開(kāi)發(fā)的SSR引物擴(kuò)增率較好,具有潛在的多態(tài)性,可為后期的種質(zhì)資源開(kāi)發(fā)與保護(hù)、遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建及分子標(biāo)記輔助育種等提供基礎(chǔ)。 

【文章頁(yè)數(shù)】：7 頁(yè)

【文章目錄】：
1 結(jié)果與分析
    1.1 大花四照花轉(zhuǎn)錄組測(cè)序與組裝
    1.2 大花四照花轉(zhuǎn)錄組中SSR位點(diǎn)分布特征分析
        1.2.1 大花四照花轉(zhuǎn)錄組SSR位點(diǎn)基本分布特征
        1.2.2 大花四照花轉(zhuǎn)錄組中SSR重復(fù)類型
        1.2.3 大花四照花轉(zhuǎn)錄組SSR重復(fù)基序類型
        1.2.4 大花四照花SSR重復(fù)次數(shù)及長(zhǎng)度分布
    1.3 大花四照花SSR引物設(shè)計(jì)與檢測(cè)
2 討論
3 材料與方法
    3.1 試驗(yàn)材料
    3.2 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
    3.3 SSR位點(diǎn)的篩選
作者貢獻(xiàn)


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號(hào)：3707677