大花四照花是極具開發(fā)價值的觀賞性植物資源,合理開發(fā)和可持續(xù)利用其種質(zhì)資源十分必要。本研究以第二代高通量測序的轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)為基礎(chǔ),通過MISA軟件對大花四照花轉(zhuǎn)錄組的SSR位點進行篩選和分析。結(jié)果顯示,共獲得30 401個SSR位點,SSR的分布頻率為22.90%,平均每2.88 kb出現(xiàn)一個SSR位點;大花四照花SSR位點的重復類型以單核苷酸重復和二核苷酸重復為主,各占所有位點的45.73%和37.98%;重復基序類型較為豐富,共有196種,其中單核苷酸A/T重復類型的數(shù)量最多。SSR的重復次數(shù)主要以5～30次為主,長度分布在10～87 bp之間,平均長度為17.39 bp。隨機選取48對設(shè)計的SSR引物進行PCR檢測,共有35對引物能擴增出單一、清晰的條帶,有效擴增率為72.92%。大花四照花轉(zhuǎn)錄組中SSR位點的數(shù)量和種類比較豐富,分布密度較大,初步開發(fā)的SSR引物擴增率較好,具有潛在的多態(tài)性,可為后期的種質(zhì)資源開發(fā)與保護、遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建及分子標記輔助育種等提供基礎(chǔ)。 

【文章頁數(shù)】：7 頁

【文章目錄】：
1 結(jié)果與分析
    1.1 大花四照花轉(zhuǎn)錄組測序與組裝
    1.2 大花四照花轉(zhuǎn)錄組中SSR位點分布特征分析
        1.2.1 大花四照花轉(zhuǎn)錄組SSR位點基本分布特征
        1.2.2 大花四照花轉(zhuǎn)錄組中SSR重復類型
        1.2.3 大花四照花轉(zhuǎn)錄組SSR重復基序類型
        1.2.4 大花四照花SSR重復次數(shù)及長度分布
    1.3 大花四照花SSR引物設(shè)計與檢測
2 討論
3 材料與方法
    3.1 試驗材料
    3.2 轉(zhuǎn)錄組測序
    3.3 SSR位點的篩選
作者貢獻


【參考文獻】：
期刊論文
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本文編號：3707677