‘永泰’楊梅親本鑒定及其單核苷酸多態(tài)性遺傳變異分析
發(fā)布時(shí)間:2021-11-03 05:02
采用基因組重測(cè)序和單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism, SNP)系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建等方法,研究‘永泰’和9個(gè)相關(guān)品種的親緣關(guān)系,并開(kāi)發(fā)了4 025個(gè)SNP核心標(biāo)記用于遺傳和育種研究。根據(jù)SNP位點(diǎn)的變異性計(jì)算遺傳相似系數(shù)(genetic similarity, GS),得出‘永泰’與親本‘硬絲’的GS為0.997 83。系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建結(jié)果表明,10個(gè)品種分為2組,其中:‘黑晶’‘東岙早梅’‘烏紫’‘荸薺’‘木葉’5個(gè)品種聚為一組;‘早大梅’‘早佳’‘軟絲’‘永泰’‘硬絲’5個(gè)品種聚為一組,且‘硬絲’與變異品種‘永泰’聚為一小支。同時(shí),‘永泰’在葉片大小、葉緣、葉脈等形態(tài)學(xué)性狀和果實(shí)口感上與親本存在顯著差異。通過(guò)‘永泰’與參考基因組對(duì)比注釋,共得到4 660個(gè)單核苷酸變異位點(diǎn)。根據(jù)研究結(jié)果推斷,‘永泰’葉片和果實(shí)產(chǎn)生顯著形態(tài)變異的原因可能是SNP位點(diǎn)產(chǎn)生了轉(zhuǎn)換和顛換以及核苷酸序列發(fā)生了突變。由此可見(jiàn),‘永泰’既有親本‘硬絲’的基本特征,也有與其形態(tài)學(xué)和果實(shí)口感上存在的典型差異。
【文章來(lái)源】:浙江大學(xué)學(xué)報(bào)(農(nóng)業(yè)與生命科學(xué)版). 2020,46(06)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:10 頁(yè)
【部分圖文】:
核心SNP位點(diǎn)在楊梅染色體上的數(shù)量(A)及分布(B)
對(duì)來(lái)源于不同地方的10個(gè)楊梅品種(材料)的葉片形態(tài)進(jìn)行觀察,發(fā)現(xiàn)各個(gè)楊梅種質(zhì)間葉片形態(tài)學(xué)性狀存在顯著差異!捞~片縱橫徑最大,‘荸薺’縱橫徑均最;‘東岙早梅’‘早大梅’和‘軟絲’葉片色澤均為中綠,其余品種均為深綠(表5,圖3)。其中:‘黑晶’‘東岙早梅’‘早大梅’的原產(chǎn)地分別來(lái)自浙江省臺(tái)州市轄區(qū)的溫嶺、黃巖、臨海3地;‘早佳’和‘木葉’均來(lái)自浙江省蘭溪市;‘烏紫’和‘荸薺’分別來(lái)自浙江省寧波市的象山縣和余姚市;‘硬絲’和‘軟絲’均來(lái)自福建省龍海市。這些各自在同一地市級(jí)行政區(qū)域內(nèi)的楊梅品種葉片存在差異,說(shuō)明來(lái)源于同一地區(qū)的楊梅不一定是同一種質(zhì)!捞瘲蠲返膩(lái)源傾向于‘硬絲’,它是由后者的一個(gè)枝條突變而來(lái)的,在葉片大小、葉緣、葉脈與果實(shí)上的表現(xiàn)均不同,其他7項(xiàng)指標(biāo)相同或接近(表5,圖3)。與擬親本的‘荸薺’相比差異大,與浙江省臨海市的‘早大梅’、福建省龍海市的‘軟絲’差異較小?梢(jiàn),‘永泰’和‘硬絲’‘早大梅’親緣關(guān)系較近,GS數(shù)值大(表4)。這說(shuō)明品種間親緣關(guān)系的遠(yuǎn)近不一定與地理區(qū)域相一致。
‘永泰’‘荸薺’和‘硬絲’果實(shí)形態(tài)比較
本文編號(hào):3473099
【文章來(lái)源】:浙江大學(xué)學(xué)報(bào)(農(nóng)業(yè)與生命科學(xué)版). 2020,46(06)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:10 頁(yè)
【部分圖文】:
核心SNP位點(diǎn)在楊梅染色體上的數(shù)量(A)及分布(B)
對(duì)來(lái)源于不同地方的10個(gè)楊梅品種(材料)的葉片形態(tài)進(jìn)行觀察,發(fā)現(xiàn)各個(gè)楊梅種質(zhì)間葉片形態(tài)學(xué)性狀存在顯著差異!捞~片縱橫徑最大,‘荸薺’縱橫徑均最;‘東岙早梅’‘早大梅’和‘軟絲’葉片色澤均為中綠,其余品種均為深綠(表5,圖3)。其中:‘黑晶’‘東岙早梅’‘早大梅’的原產(chǎn)地分別來(lái)自浙江省臺(tái)州市轄區(qū)的溫嶺、黃巖、臨海3地;‘早佳’和‘木葉’均來(lái)自浙江省蘭溪市;‘烏紫’和‘荸薺’分別來(lái)自浙江省寧波市的象山縣和余姚市;‘硬絲’和‘軟絲’均來(lái)自福建省龍海市。這些各自在同一地市級(jí)行政區(qū)域內(nèi)的楊梅品種葉片存在差異,說(shuō)明來(lái)源于同一地區(qū)的楊梅不一定是同一種質(zhì)!捞瘲蠲返膩(lái)源傾向于‘硬絲’,它是由后者的一個(gè)枝條突變而來(lái)的,在葉片大小、葉緣、葉脈與果實(shí)上的表現(xiàn)均不同,其他7項(xiàng)指標(biāo)相同或接近(表5,圖3)。與擬親本的‘荸薺’相比差異大,與浙江省臨海市的‘早大梅’、福建省龍海市的‘軟絲’差異較小?梢(jiàn),‘永泰’和‘硬絲’‘早大梅’親緣關(guān)系較近,GS數(shù)值大(表4)。這說(shuō)明品種間親緣關(guān)系的遠(yuǎn)近不一定與地理區(qū)域相一致。
‘永泰’‘荸薺’和‘硬絲’果實(shí)形態(tài)比較
本文編號(hào):3473099
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