桃褐腐病菌對(duì)多菌靈抗性的AS-PCR檢測(cè)技術(shù)
發(fā)布時(shí)間:2021-10-24 20:37
由于殺菌劑的長(zhǎng)期大量使用,植物病原菌對(duì)殺菌劑抗性問(wèn)題日趨突出,嚴(yán)重影響病害防治的效果。褐腐病是一種在全世界范圍內(nèi)廣泛發(fā)生和流行的重要果樹病害。本文以桃褐腐病菌Monilinia fructicola為例,基于已知的多菌靈抗性機(jī)理,即靶標(biāo)β微管蛋白基因TUB2的點(diǎn)突變E198A,建立了一種桃褐腐病菌對(duì)多菌靈抗性的等位基因?qū);訮CR檢測(cè)技術(shù)。結(jié)果表明,堿基錯(cuò)配、內(nèi)參引物、退火溫度、dNTPs、Taq DNA聚合酶、;砸餄舛燃芭浔鹊纫蛩鼐鶎(duì)檢測(cè)效率有影響。經(jīng)過(guò)對(duì)以上因素的優(yōu)化,并對(duì)優(yōu)化后的檢測(cè)技術(shù)進(jìn)行;约办`敏度評(píng)價(jià),證實(shí)該檢測(cè)技術(shù)能特異性地鑒別桃褐腐病菌M.fructicola對(duì)多菌靈抗性基因型E198A,且檢測(cè)靈敏度可達(dá)到4.342 pg/μL病菌DNA,有望在實(shí)踐中推廣使用。
【文章來(lái)源】:植物保護(hù). 2020,46(06)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:9 頁(yè)
【部分圖文】:
內(nèi)參引物和特異性引物對(duì)多菌靈抗/感菌株的
反應(yīng)體系中包含dNTPs、Taq DNA聚合酶等試劑,其質(zhì)量及濃度是影響PCR反應(yīng)的擴(kuò)增效率以及避免產(chǎn)生非特異性擴(kuò)增的重要因素。dNTPs的優(yōu)化結(jié)果表明在設(shè)置的各個(gè)濃度梯度下反應(yīng)均能發(fā)生,但特異性引物擴(kuò)增的效率略有不同。0.2~0.3 mmol/L濃度擴(kuò)增效率相對(duì)較高(圖4a)。依據(jù)標(biāo)準(zhǔn)的PCR反應(yīng)體系中推薦的dNTPs濃度為0.2 mmol/L,本著效率優(yōu)先,節(jié)約為輔的原則,確定dNTPs的最佳濃度為0.2 mmol/L。Taq DNA聚合酶的優(yōu)化,在不同的Taq DNA聚合酶濃度下反應(yīng)均能發(fā)生,但特異性引物擴(kuò)增的條帶亮度隨濃度增加大致呈依次遞增的關(guān)系(圖4b)。結(jié)果顯示在Taq DNA聚合酶濃度為1.25 U下擴(kuò)增的效率已較高,且接近推薦的濃度,故確定Taq DNA聚合酶的用量為1.25 U(25 μL體系)。圖4 dNTPs (a)和Taq DNA 聚合酶(b)的優(yōu)化
通過(guò)Nanodrop 2000測(cè)定抗性菌株YHC11-8c的DNA濃度為434.2 ng/μL,將DNA分別稀釋為原濃度的100、10-1、10-2、10-3、10-4、10-5、10-6、10-7、10-8、10-9,得到10個(gè)DNA濃度梯度,進(jìn)行3次獨(dú)立重復(fù)試驗(yàn)。結(jié)果發(fā)現(xiàn)該檢測(cè)技術(shù)的靈敏度很高,最低可從稀釋為10-5(4.342 pg/μL)的病原菌DNA中檢測(cè)出抗性菌株,完全可用于生產(chǎn)實(shí)踐(圖7)。圖6 AS-PCR檢測(cè)方法的特異性
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]果樹褐腐病的研究現(xiàn)狀及其展望[J]. 羅朝喜. 植物病理學(xué)報(bào). 2017(02)
[2]一種基于LAMP技術(shù)快速檢測(cè)小麥赤霉病菌對(duì)多菌靈抗藥性方法的建立及應(yīng)用[J]. 段亞冰,效雪梅,楊瑩,曹君紅,施一淵,張曉柯,王勇,王建新,周明國(guó). 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2016(01)
[3]利用等位基因特異性PCR技術(shù)檢測(cè)番茄高色素基因hp1和hp2的單核苷酸多態(tài)性[J]. 金鳳媚,楊迎霞,薛俊,郟艷紅,劉仲齊. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2009(05)
[4]單核苷酸多態(tài)性檢測(cè)方法研究概述及其應(yīng)用[J]. 李琳,楊德光,胡正,王永力. 玉米科學(xué). 2009(03)
[5]美澳型核果褐腐病菌對(duì)甲基硫菌靈和啶酰菌胺的敏感性[J]. 樊錦艷,房雅麗,國(guó)立耘. 植物保護(hù)學(xué)報(bào). 2009(03)
[6]等位基因特異PCR技術(shù)的研究與應(yīng)用[J]. 陳吉寶,景蕊蓮,員海燕,衛(wèi)波. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2005(04)
博士論文
[1]桃褐腐病菌和炭疽病菌對(duì)DMI殺菌劑的抗性研究[D]. 陳淑寧.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]中國(guó)核果/仁果類果樹褐腐病菌種群結(jié)構(gòu)及Cyt b基因的遺傳進(jìn)化研究[D]. 尹良芬.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
本文編號(hào):3455937
【文章來(lái)源】:植物保護(hù). 2020,46(06)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:9 頁(yè)
【部分圖文】:
內(nèi)參引物和特異性引物對(duì)多菌靈抗/感菌株的
反應(yīng)體系中包含dNTPs、Taq DNA聚合酶等試劑,其質(zhì)量及濃度是影響PCR反應(yīng)的擴(kuò)增效率以及避免產(chǎn)生非特異性擴(kuò)增的重要因素。dNTPs的優(yōu)化結(jié)果表明在設(shè)置的各個(gè)濃度梯度下反應(yīng)均能發(fā)生,但特異性引物擴(kuò)增的效率略有不同。0.2~0.3 mmol/L濃度擴(kuò)增效率相對(duì)較高(圖4a)。依據(jù)標(biāo)準(zhǔn)的PCR反應(yīng)體系中推薦的dNTPs濃度為0.2 mmol/L,本著效率優(yōu)先,節(jié)約為輔的原則,確定dNTPs的最佳濃度為0.2 mmol/L。Taq DNA聚合酶的優(yōu)化,在不同的Taq DNA聚合酶濃度下反應(yīng)均能發(fā)生,但特異性引物擴(kuò)增的條帶亮度隨濃度增加大致呈依次遞增的關(guān)系(圖4b)。結(jié)果顯示在Taq DNA聚合酶濃度為1.25 U下擴(kuò)增的效率已較高,且接近推薦的濃度,故確定Taq DNA聚合酶的用量為1.25 U(25 μL體系)。圖4 dNTPs (a)和Taq DNA 聚合酶(b)的優(yōu)化
通過(guò)Nanodrop 2000測(cè)定抗性菌株YHC11-8c的DNA濃度為434.2 ng/μL,將DNA分別稀釋為原濃度的100、10-1、10-2、10-3、10-4、10-5、10-6、10-7、10-8、10-9,得到10個(gè)DNA濃度梯度,進(jìn)行3次獨(dú)立重復(fù)試驗(yàn)。結(jié)果發(fā)現(xiàn)該檢測(cè)技術(shù)的靈敏度很高,最低可從稀釋為10-5(4.342 pg/μL)的病原菌DNA中檢測(cè)出抗性菌株,完全可用于生產(chǎn)實(shí)踐(圖7)。圖6 AS-PCR檢測(cè)方法的特異性
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]果樹褐腐病的研究現(xiàn)狀及其展望[J]. 羅朝喜. 植物病理學(xué)報(bào). 2017(02)
[2]一種基于LAMP技術(shù)快速檢測(cè)小麥赤霉病菌對(duì)多菌靈抗藥性方法的建立及應(yīng)用[J]. 段亞冰,效雪梅,楊瑩,曹君紅,施一淵,張曉柯,王勇,王建新,周明國(guó). 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2016(01)
[3]利用等位基因特異性PCR技術(shù)檢測(cè)番茄高色素基因hp1和hp2的單核苷酸多態(tài)性[J]. 金鳳媚,楊迎霞,薛俊,郟艷紅,劉仲齊. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2009(05)
[4]單核苷酸多態(tài)性檢測(cè)方法研究概述及其應(yīng)用[J]. 李琳,楊德光,胡正,王永力. 玉米科學(xué). 2009(03)
[5]美澳型核果褐腐病菌對(duì)甲基硫菌靈和啶酰菌胺的敏感性[J]. 樊錦艷,房雅麗,國(guó)立耘. 植物保護(hù)學(xué)報(bào). 2009(03)
[6]等位基因特異PCR技術(shù)的研究與應(yīng)用[J]. 陳吉寶,景蕊蓮,員海燕,衛(wèi)波. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2005(04)
博士論文
[1]桃褐腐病菌和炭疽病菌對(duì)DMI殺菌劑的抗性研究[D]. 陳淑寧.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]中國(guó)核果/仁果類果樹褐腐病菌種群結(jié)構(gòu)及Cyt b基因的遺傳進(jìn)化研究[D]. 尹良芬.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
本文編號(hào):3455937
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