【目的】本文擬獲得β-amyrin合成酶基因的全長序列及其蛋白的生物學信息�！痉椒ā恳元M葉柴胡為材料,獲得了抗肝炎有效成分齊墩果酸合成關鍵酶—β-amyrin合成酶基因的cDNA序列,并應用生物信息數(shù)據(jù)庫(哪個數(shù)據(jù)庫)和分析軟件(交代分析軟件的類型)對該基因的保守序列、蛋白質(zhì)理化性質(zhì)、跨膜結(jié)構(gòu)域、亞細胞定位、二級結(jié)構(gòu)、三級結(jié)構(gòu)、磷酸化位點做了分析。【結(jié)果】β-amyrin合成酶基因的ORF核苷酸長度2289 bp,編碼762個氨基酸,蛋白質(zhì)序列中含有氧化鯊烯環(huán)化酶家族所特有的且高度保守的DCTAE、QW和MWCYCR 3個序列;BsAS無跨膜區(qū),為親水性蛋白,定位于細胞質(zhì)中;其二級結(jié)構(gòu)主要為α-螺旋和無規(guī)卷曲,三級結(jié)構(gòu)預測結(jié)果可信。狹葉柴胡BsAS蛋白共有53個磷酸化位點,其中絲氨酸的磷酸化位點最多�！窘Y(jié)論】本研究首次在狹葉柴胡中克隆了BsAS全長基因,同時利用生物信息學分析了其蛋白特性及細胞定位,該研究豐富了BsAS基因資源庫,同時為齊墩果烷型代謝產(chǎn)物及代謝途徑的深入研究奠定基礎。

【文章頁數(shù)】：6 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 供試材料
    1.2 試劑
    1.3 試驗方法
        1.3.1 BsAS全長序列擴增
            (1) BsAS基因中間片段的擴增。
            (2)BsAS基因5’端片段的擴增。
            (3)BsAS基因3’端片段的擴增。
            (4)BsAS全長基因的擴增。
        1.3.2 BsAS序列生物信息學分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 狹葉柴胡中β-amyrin合成酶基因BsAS的克隆
    2.2 狹葉柴胡BsAS基因生物信息學分析
        2.2.1 BsAS保守序列分析
        2.2.2 狹葉柴胡BsAS理化性質(zhì)分析
        2.2.3 狹葉柴胡BsAS跨膜區(qū)、亞細胞定位分析
        2.2.4 狹葉柴胡BsAS二級結(jié)構(gòu)預測
        2.2.5 狹葉柴胡BsAS三級結(jié)構(gòu)預測
        2.2.6 狹葉柴胡BsAS磷酸化位點預測
3 討 論
4 結(jié) 論



本文編號：3863646