馬鈴薯AS2基因家族的鑒定與逆境脅迫表達(dá)
發(fā)布時間:2022-07-13 10:33
高鹽、干旱、高溫、低溫等非生物脅迫是造成馬鈴薯減產(chǎn)的重要因素,鑒定和探究馬鈴薯逆境脅迫應(yīng)答相關(guān)基因?qū)︸R鈴薯生產(chǎn)具有重要意義. ASYMMETRIC LEAVES2(AS2)基因家族是一類廣泛存在于植物中的轉(zhuǎn)錄因子家族,在植物生長發(fā)育和抵御逆境脅迫過程中發(fā)揮重要作用.通過生物信息學(xué)系統(tǒng)分析,鑒定得到43個馬鈴薯AS2基因家族成員.結(jié)果顯示,根據(jù)保守結(jié)構(gòu)域的差異將AS2基因家族分為ClassⅠ、ClassⅡ兩類,其中ClassⅠ分為Ⅰa、Ⅰb、Ⅰc、Ⅰd、Ⅰe共5個亞類,ClassⅡ分為Ⅱa、Ⅱb兩個亞類.馬鈴薯AS2蛋白主要以α-螺旋和不規(guī)則卷曲兩種二級結(jié)構(gòu)組成,定位在細(xì)胞核中.通過對馬鈴薯植株進(jìn)行高鹽、干旱、低溫和高溫脅迫處理,并對葉片和根中部分AS2基因家族成員的表達(dá)量進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)ClassⅠ類和ClassⅡ類中大部分成員均參與逆境脅迫應(yīng)答,但在不同逆境脅迫下的響應(yīng)程度存在差異.高鹽脅迫下,葉片中St AS2-7和根中St AS2-27表達(dá)量分別是對照的10倍;干旱脅迫下,除St AS2-4外的其余成員在葉片和根部表達(dá)量明顯上調(diào);高溫脅迫下,葉片中St AS2-15表達(dá)量下調(diào),其余...
【文章頁數(shù)】:10 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 試驗材料
1.2 馬鈴薯AS2基因家族鑒定和染色體定位
1.3 馬鈴薯AS2基因家族演化分析
1.4 馬鈴薯AS2基因家族二級結(jié)構(gòu)預(yù)測
1.5 馬鈴薯AS2基因成員芯片表達(dá)模式分析
1.6 qRT-PCR分析
2 結(jié)果與分析
2.1 馬鈴薯AS2基因家族成員鑒定和染色體定位
2.2 馬鈴薯AS2基因家族成員分類與演化分析
2.3 馬鈴薯AS2基因家族蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)分析
2.4 馬鈴薯AS2基因家族成員應(yīng)激表達(dá)
2.5 馬鈴薯AS2基因家族成員實時熒光定量分析
3 討論與結(jié)論
3.1 馬鈴薯AS2基因家族成員系統(tǒng)發(fā)育特征
3.2 馬鈴薯AS2基因家族成員響應(yīng)植物激素誘導(dǎo)
3.3 馬鈴薯AS2基因家族成員響應(yīng)非生物脅迫
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]葡萄LBD基因家族的鑒定與表達(dá)分析[J]. 何紅紅,馬宗桓,張元霞,張娟,盧世雄,張志強(qiáng),趙鑫,吳玉霞,毛娟. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(21)
[2]植物應(yīng)答非生物脅迫信號傳導(dǎo)研究進(jìn)展[J]. 劉鈴,武小龍,諸葛強(qiáng). 分子植物育種. 2018(02)
[3]毛果楊LBD基因家族的全基因組分析[J]. 蘆強(qiáng),邵芬娟,邱德有. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2018(01)
[4]番茄AS2基因家族的系統(tǒng)進(jìn)化分析[J]. 劉洋,鄭洋洋,宮超,程謨楨,黃海峰,張瑤,陳秀玲,王傲雪. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2018(09)
[5]大麥ASYMMETRIC LEAVES2/LATERAL OR-GAN BOUNDARIES(AS2/LOB)基因家族的全基因組分析(英文)[J]. Bao-jian GUO,Jun WANG,Shen LIN,Zheng TIAN,Kai ZHOU,Hai-ye LUAN,Chao LYU,Xin-zhong ZHANG,Ru-gen XU. Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology). 2016(10)
[6]馬鈴薯主糧化與產(chǎn)業(yè)開發(fā)研究綜述[J]. 張千友,王萬疆,廖武霜. 西昌學(xué)院學(xué)報(自然科學(xué)版). 2016(02)
[7]辣椒全基因組中LBD轉(zhuǎn)錄因子的鑒定與表達(dá)分析[J]. 鄭忠凡,張亞利,胡燦,戴雄澤,劉峰,袁祖華. 園藝學(xué)報. 2016(04)
[8]普通煙草LBD基因家族的全基因組序列鑒定與表達(dá)分析[J]. 孫亭亭,龔達(dá)平,張磊,陳雅瓊,趙維,向小華,孫玉合. 植物遺傳資源學(xué)報. 2016(02)
本文編號:3659881
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【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 試驗材料
1.2 馬鈴薯AS2基因家族鑒定和染色體定位
1.3 馬鈴薯AS2基因家族演化分析
1.4 馬鈴薯AS2基因家族二級結(jié)構(gòu)預(yù)測
1.5 馬鈴薯AS2基因成員芯片表達(dá)模式分析
1.6 qRT-PCR分析
2 結(jié)果與分析
2.1 馬鈴薯AS2基因家族成員鑒定和染色體定位
2.2 馬鈴薯AS2基因家族成員分類與演化分析
2.3 馬鈴薯AS2基因家族蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)分析
2.4 馬鈴薯AS2基因家族成員應(yīng)激表達(dá)
2.5 馬鈴薯AS2基因家族成員實時熒光定量分析
3 討論與結(jié)論
3.1 馬鈴薯AS2基因家族成員系統(tǒng)發(fā)育特征
3.2 馬鈴薯AS2基因家族成員響應(yīng)植物激素誘導(dǎo)
3.3 馬鈴薯AS2基因家族成員響應(yīng)非生物脅迫
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]葡萄LBD基因家族的鑒定與表達(dá)分析[J]. 何紅紅,馬宗桓,張元霞,張娟,盧世雄,張志強(qiáng),趙鑫,吳玉霞,毛娟. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(21)
[2]植物應(yīng)答非生物脅迫信號傳導(dǎo)研究進(jìn)展[J]. 劉鈴,武小龍,諸葛強(qiáng). 分子植物育種. 2018(02)
[3]毛果楊LBD基因家族的全基因組分析[J]. 蘆強(qiáng),邵芬娟,邱德有. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2018(01)
[4]番茄AS2基因家族的系統(tǒng)進(jìn)化分析[J]. 劉洋,鄭洋洋,宮超,程謨楨,黃海峰,張瑤,陳秀玲,王傲雪. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2018(09)
[5]大麥ASYMMETRIC LEAVES2/LATERAL OR-GAN BOUNDARIES(AS2/LOB)基因家族的全基因組分析(英文)[J]. Bao-jian GUO,Jun WANG,Shen LIN,Zheng TIAN,Kai ZHOU,Hai-ye LUAN,Chao LYU,Xin-zhong ZHANG,Ru-gen XU. Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology). 2016(10)
[6]馬鈴薯主糧化與產(chǎn)業(yè)開發(fā)研究綜述[J]. 張千友,王萬疆,廖武霜. 西昌學(xué)院學(xué)報(自然科學(xué)版). 2016(02)
[7]辣椒全基因組中LBD轉(zhuǎn)錄因子的鑒定與表達(dá)分析[J]. 鄭忠凡,張亞利,胡燦,戴雄澤,劉峰,袁祖華. 園藝學(xué)報. 2016(04)
[8]普通煙草LBD基因家族的全基因組序列鑒定與表達(dá)分析[J]. 孫亭亭,龔達(dá)平,張磊,陳雅瓊,趙維,向小華,孫玉合. 植物遺傳資源學(xué)報. 2016(02)
本文編號:3659881
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