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馬鈴薯AS2基因家族的鑒定與逆境脅迫表達(dá)

發(fā)布時間:2022-07-13 10:33
  高鹽、干旱、高溫、低溫等非生物脅迫是造成馬鈴薯減產(chǎn)的重要因素,鑒定和探究馬鈴薯逆境脅迫應(yīng)答相關(guān)基因?qū)︸R鈴薯生產(chǎn)具有重要意義. ASYMMETRIC LEAVES2(AS2)基因家族是一類廣泛存在于植物中的轉(zhuǎn)錄因子家族,在植物生長發(fā)育和抵御逆境脅迫過程中發(fā)揮重要作用.通過生物信息學(xué)系統(tǒng)分析,鑒定得到43個馬鈴薯AS2基因家族成員.結(jié)果顯示,根據(jù)保守結(jié)構(gòu)域的差異將AS2基因家族分為ClassⅠ、ClassⅡ兩類,其中ClassⅠ分為Ⅰa、Ⅰb、Ⅰc、Ⅰd、Ⅰe共5個亞類,ClassⅡ分為Ⅱa、Ⅱb兩個亞類.馬鈴薯AS2蛋白主要以α-螺旋和不規(guī)則卷曲兩種二級結(jié)構(gòu)組成,定位在細(xì)胞核中.通過對馬鈴薯植株進(jìn)行高鹽、干旱、低溫和高溫脅迫處理,并對葉片和根中部分AS2基因家族成員的表達(dá)量進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)ClassⅠ類和ClassⅡ類中大部分成員均參與逆境脅迫應(yīng)答,但在不同逆境脅迫下的響應(yīng)程度存在差異.高鹽脅迫下,葉片中St AS2-7和根中St AS2-27表達(dá)量分別是對照的10倍;干旱脅迫下,除St AS2-4外的其余成員在葉片和根部表達(dá)量明顯上調(diào);高溫脅迫下,葉片中St AS2-15表達(dá)量下調(diào),其余... 

【文章頁數(shù)】:10 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 試驗材料
    1.2 馬鈴薯AS2基因家族鑒定和染色體定位
    1.3 馬鈴薯AS2基因家族演化分析
    1.4 馬鈴薯AS2基因家族二級結(jié)構(gòu)預(yù)測
    1.5 馬鈴薯AS2基因成員芯片表達(dá)模式分析
    1.6 qRT-PCR分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 馬鈴薯AS2基因家族成員鑒定和染色體定位
    2.2 馬鈴薯AS2基因家族成員分類與演化分析
    2.3 馬鈴薯AS2基因家族蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)分析
    2.4 馬鈴薯AS2基因家族成員應(yīng)激表達(dá)
    2.5 馬鈴薯AS2基因家族成員實時熒光定量分析
3 討論與結(jié)論
    3.1 馬鈴薯AS2基因家族成員系統(tǒng)發(fā)育特征
    3.2 馬鈴薯AS2基因家族成員響應(yīng)植物激素誘導(dǎo)
    3.3 馬鈴薯AS2基因家族成員響應(yīng)非生物脅迫


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[5]大麥ASYMMETRIC LEAVES2/LATERAL OR-GAN BOUNDARIES(AS2/LOB)基因家族的全基因組分析(英文)[J]. Bao-jian GUO,Jun WANG,Shen LIN,Zheng TIAN,Kai ZHOU,Hai-ye LUAN,Chao LYU,Xin-zhong ZHANG,Ru-gen XU.  Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology). 2016(10)
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本文編號:3659881

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