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基于高通量測序的金釵石斛種子內(nèi)生菌群落結(jié)構(gòu)組成分析

發(fā)布時間:2021-11-07 08:52
  本研究基于免培養(yǎng)和高通量測序技術(shù),對金釵石斛種子內(nèi)生菌16 S rDNA V 4區(qū)和ITS 1區(qū)擴增序列進(jìn)行分析,揭示內(nèi)生菌的組成和豐度。結(jié)果表明:擴增的內(nèi)生細(xì)菌16 S rDNA序列歸為13 OTUs,隸屬于變形菌門(Proteobacteria)和藍(lán)細(xì)菌門(Cyanobacteria);其中變形菌門為優(yōu)勢門,泛菌屬(Pantoea)為優(yōu)勢屬;香農(nóng)指數(shù)、辛普森指數(shù)和Chao 1指數(shù)分別為1.82、0.69和11.00。內(nèi)生真菌序列歸為14個OTUs,隸屬于子囊菌門(Ascomycota)、擔(dān)子菌門(Basidiomycota)和接合菌門(Zygomycota);其中子囊菌門為優(yōu)勢門,德巴利酵母屬(Debaryomyces)為優(yōu)勢屬;香農(nóng)指數(shù)、辛普森指數(shù)和Chao1指數(shù)分別為0.57、0.79和14.13。金釵石斛種子的內(nèi)生細(xì)菌與內(nèi)生真菌具有一定的多樣性。此研究為進(jìn)一步促進(jìn)金釵石斛種子萌發(fā)及幼苗栽培具有一定的指導(dǎo)意義。 

【文章來源】:種子. 2020,39(08)北大核心

【文章頁數(shù)】:5 頁

【部分圖文】:

基于高通量測序的金釵石斛種子內(nèi)生菌群落結(jié)構(gòu)組成分析


種子內(nèi)生細(xì)菌門水平和屬水平豐度分布

豐度分布,內(nèi)生真菌,豐度分布,種子


金釵石斛種子內(nèi)生真菌隸屬于子囊菌門(Ascomycota)、擔(dān)子菌門(Basidiomycota)和接合菌門(Zygomycota),分別占內(nèi)生真菌的97.04%、2.84%和0.12%(圖2)。子囊菌門分屬于4個綱,6個目,10個科,5個屬。酵母綱(Saccharomycetes)占88.75%,包括1個OTU,為酵母目(Saccharomycetales)、分類未定科(Incertae sedis Saccharomycetales)德巴利酵母屬(Debaryomyces)。座囊菌綱(Dothideomycetes)有4個OTUs(1.61%),格孢腔菌目(Pleosporales)占1.36%,包括格孢菌科(Pleosporaceae)鏈格孢屬(Alternaria),占0.74%,以及未分類的格孢腔菌目(Incertae sedis Pleosporales),占0.62%。散囊菌綱(Eurotiomycetes)有2個OTUs(1.24%),包括散囊菌目(Eurotiales)發(fā)菌科(Trichocomaceae),占0.99%;以及刺盾炱目(Chaetothyriales)毛蕊科(Herpotrichiellaceae),0.25%,屬水平分類未定。錘舌菌綱(Leotiomycetes)有1個OTU(0.25%),為柔膜菌目(Helotiales)石竹科(Rutstroemiaceae)蠟盤菌屬(Rutstroemia)。另外,子囊菌門真菌在綱水平占5.19%(1個OTU)和屬水平占7.29%分類未定劃入Others。

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[2]金釵石斛內(nèi)生細(xì)菌的組成及多樣性分析[J]. 吳慶珊,雷珣,雷友梅,蒲星,劉穎,翁慶北.  植物資源與環(huán)境學(xué)報. 2018(01)
[3]人類活動對織金洞洞穴水中可培養(yǎng)細(xì)菌多樣性的影響[J]. 董乙乂,艾義郎,黃煜,魏文章,孫詩語,牛曉娟,張傳博,周忠發(fā),翁慶北.  貴州師范大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2017(04)
[4]454測序方法對人參種子內(nèi)生真菌種類的研究[J]. 馬偉,劉振鵬,孫麗英,張開雪,徐姣,溫東,趙銳,劉秀波.  中醫(yī)藥信息. 2017(03)
[5]金釵石斛IAA內(nèi)生細(xì)菌篩選及對干旱脅迫下玉米種子萌發(fā)的影響[J]. 高陽,朱雙麗,吳慶珊,雷珣,安忠琦,王玉倩,牛曉娟,翁慶北.  種子. 2017(04)
[6]應(yīng)用高通量測序技術(shù)對進(jìn)境澳大利亞小麥病原真菌的檢測研究[J]. 史亞千,程穎慧,王穎,高瑞芳,汪瑩,向才玉,馮建軍,婁定風(fēng),王紅英,朱崧琪.  植物檢疫. 2017(01)
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本文編號:3481553

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