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基于核糖體RNA高通量測序分析微生物群落結(jié)構(gòu)

發(fā)布時(shí)間:2016-05-11 08:00

  本文關(guān)鍵詞:核糖體rna,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


微生物群落多樣性是微生物生態(tài)學(xué)和環(huán)境學(xué)研究的重點(diǎn)之一。分子生物學(xué)方法應(yīng)用于微生物群落結(jié)構(gòu)分析使得對(duì)環(huán)境樣品中占大多數(shù)的不可培養(yǎng)微生物的研究成為了可能。由于功能上高度保守,序列上的不同位置具有不同的變異速率,核糖體RNA(rRNA)是目前在微生物分子生態(tài)學(xué)上最為有用以及應(yīng)用最廣泛的分子標(biāo)記,通過rRNA序列比對(duì),可以分析不同分類水平的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系。目前,較為常用的分析微生物群落結(jié)構(gòu)的方法大多是建立在對(duì)于小亞基(SSU)rRNA上的全長或某個(gè)片段進(jìn)行PCR擴(kuò)增的基礎(chǔ)上的。

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