近海海域病原菌及水體中抗生素抗性基因與驅(qū)動(dòng)因素研究
發(fā)布時(shí)間:2023-04-17 03:42
近年來,我國近海海域的污染情況逐漸加重,其中陸源污染為最主要的一種污染,因此陸源污染輸入所帶來的致病性微生物及抗生素抗性基因污染逐漸受到人們的重視。本文以秦皇島灤河口海域和深圳大亞灣海域兩個(gè)典型海域?yàn)檠芯繉ο?采用熒光定量PCR方法對近海水域較常出現(xiàn)的大腸桿菌、腸球菌和金黃色葡萄球菌的分布狀況進(jìn)行監(jiān)測并分析其環(huán)境驅(qū)動(dòng)因素,同時(shí),采用宏基因組學(xué)結(jié)合熒光定量PCR方法對抗性基因的分布狀況進(jìn)行研究,得到了下列結(jié)果:對兩海域環(huán)境因子的研究表明,灤河口海域環(huán)境因子在不同季節(jié)間差異顯著,大亞灣海域環(huán)境因子僅冬季顯著區(qū)別于其他三個(gè)季節(jié)。此外,兩河口環(huán)境因子均呈現(xiàn)出隨離岸距離增加而遞減的趨勢,但在養(yǎng)殖區(qū)會(huì)出現(xiàn)短暫上升。對兩個(gè)海域病原菌分布特征的研究發(fā)現(xiàn),不同季節(jié)灤河口海域和大亞灣海域中腸球菌和金黃色葡萄球菌的豐度存在顯著差異,此外大亞灣海域的大腸桿菌豐度也表現(xiàn)出顯著的季節(jié)性差異,差異最大可達(dá)10倍左右;在空間分布上,灤河口海域病原菌呈斑塊狀分布,大亞灣海域大腸桿菌和金黃色葡萄球菌從河口向中心逐漸遞減,豐度最高可達(dá)1.30×105和2.17×106 copie...
【文章頁數(shù)】:76 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
第1章 緒論
1.1 研究近海病原菌及抗生素抗性基因的必要性
1.1.1 病原菌造成的危害
1.1.2 抗生素抗性基因(ARGs)的危害
1.2 近海海域病原菌及抗性基因的研究現(xiàn)狀
1.2.1 病原菌概述及研究現(xiàn)狀
1.2.2 抗生素抗性基因概述及研究現(xiàn)狀
1.3 近海病原菌及ARGs檢測技術(shù)
1.3.1 病原菌常見檢測方法
1.3.2 ARGs常見檢測方法
1.4 研究海域背景
1.4.1 秦皇島灤河水質(zhì)狀況
1.4.2 深圳大亞灣水質(zhì)狀況
1.5 目的與意義
第2章 南北典型河口環(huán)境因子差異
2.1 實(shí)驗(yàn)儀器與材料
2.1.1 實(shí)驗(yàn)儀器
2.1.2 實(shí)驗(yàn)材料
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 樣品的采集
2.2.2 環(huán)境因子的測定
2.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
2.3.1 北方河口環(huán)境因子的時(shí)空分布
2.3.2 南方河口環(huán)境因子的時(shí)空分布
2.3.3 南北方河口主要環(huán)境因子差異
2.4 小結(jié)
第3章 南北典型河口病原菌分布狀況及驅(qū)動(dòng)因素
3.1 實(shí)驗(yàn)儀器與材料
3.1.1 實(shí)驗(yàn)儀器
3.1.2 實(shí)驗(yàn)材料
3.2 實(shí)驗(yàn)方法
3.2.1 環(huán)境樣品DNA的提取
3.2.2 目標(biāo)菌種引物的設(shè)計(jì)
3.2.3 質(zhì)粒構(gòu)建
3.2.4 Quantitative -PCR法測定病原菌
3.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
3.3.1 秦皇島灤河口病原菌時(shí)空分布特征
3.3.2 北方灤河口病原菌變化的驅(qū)動(dòng)因素
3.3.3 深圳大亞灣病原菌時(shí)空分布特征
3.3.4 南方大亞灣病原菌變化的驅(qū)動(dòng)因素
3.3.5 不同河口病原菌分布及驅(qū)動(dòng)因素差異
3.4 小結(jié)
第4章 不同生境下ARGs分布狀況及其驅(qū)動(dòng)因素
4.1 實(shí)驗(yàn)儀器與材料
4.1.1 實(shí)驗(yàn)儀器
4.1.2 實(shí)驗(yàn)材料
4.2 實(shí)驗(yàn)方法
4.2.1 環(huán)境樣品DNA的提取
4.2.2 目標(biāo)菌種引物的設(shè)計(jì)
4.2.3 質(zhì)粒構(gòu)建
4.2.4 Quantitative-PCR法測定抗性基因
4.2.5 宏基因組學(xué)測定抗性基因
4.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
4.3.1 秦皇島灤河口海域ARGs的時(shí)空分布特征
4.3.2 驅(qū)動(dòng)ARGs豐度變化的主要因素
4.3.3 不同種類ARGs之間的關(guān)系
4.4 小結(jié)
第5章 結(jié)論與展望
參考文獻(xiàn)
發(fā)表論文和參加科研情況說明
致謝
本文編號:3792494
【文章頁數(shù)】:76 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
第1章 緒論
1.1 研究近海病原菌及抗生素抗性基因的必要性
1.1.1 病原菌造成的危害
1.1.2 抗生素抗性基因(ARGs)的危害
1.2 近海海域病原菌及抗性基因的研究現(xiàn)狀
1.2.1 病原菌概述及研究現(xiàn)狀
1.2.2 抗生素抗性基因概述及研究現(xiàn)狀
1.3 近海病原菌及ARGs檢測技術(shù)
1.3.1 病原菌常見檢測方法
1.3.2 ARGs常見檢測方法
1.4 研究海域背景
1.4.1 秦皇島灤河水質(zhì)狀況
1.4.2 深圳大亞灣水質(zhì)狀況
1.5 目的與意義
第2章 南北典型河口環(huán)境因子差異
2.1 實(shí)驗(yàn)儀器與材料
2.1.1 實(shí)驗(yàn)儀器
2.1.2 實(shí)驗(yàn)材料
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 樣品的采集
2.2.2 環(huán)境因子的測定
2.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
2.3.1 北方河口環(huán)境因子的時(shí)空分布
2.3.2 南方河口環(huán)境因子的時(shí)空分布
2.3.3 南北方河口主要環(huán)境因子差異
2.4 小結(jié)
第3章 南北典型河口病原菌分布狀況及驅(qū)動(dòng)因素
3.1 實(shí)驗(yàn)儀器與材料
3.1.1 實(shí)驗(yàn)儀器
3.1.2 實(shí)驗(yàn)材料
3.2 實(shí)驗(yàn)方法
3.2.1 環(huán)境樣品DNA的提取
3.2.2 目標(biāo)菌種引物的設(shè)計(jì)
3.2.3 質(zhì)粒構(gòu)建
3.2.4 Quantitative -PCR法測定病原菌
3.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
3.3.1 秦皇島灤河口病原菌時(shí)空分布特征
3.3.2 北方灤河口病原菌變化的驅(qū)動(dòng)因素
3.3.3 深圳大亞灣病原菌時(shí)空分布特征
3.3.4 南方大亞灣病原菌變化的驅(qū)動(dòng)因素
3.3.5 不同河口病原菌分布及驅(qū)動(dòng)因素差異
3.4 小結(jié)
第4章 不同生境下ARGs分布狀況及其驅(qū)動(dòng)因素
4.1 實(shí)驗(yàn)儀器與材料
4.1.1 實(shí)驗(yàn)儀器
4.1.2 實(shí)驗(yàn)材料
4.2 實(shí)驗(yàn)方法
4.2.1 環(huán)境樣品DNA的提取
4.2.2 目標(biāo)菌種引物的設(shè)計(jì)
4.2.3 質(zhì)粒構(gòu)建
4.2.4 Quantitative-PCR法測定抗性基因
4.2.5 宏基因組學(xué)測定抗性基因
4.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
4.3.1 秦皇島灤河口海域ARGs的時(shí)空分布特征
4.3.2 驅(qū)動(dòng)ARGs豐度變化的主要因素
4.3.3 不同種類ARGs之間的關(guān)系
4.4 小結(jié)
第5章 結(jié)論與展望
參考文獻(xiàn)
發(fā)表論文和參加科研情況說明
致謝
本文編號:3792494
本文鏈接:http://sikaile.net/wenshubaike/qiuzhijiqiao/3792494.html
最近更新
教材專著