落羽杉屬種類及其雜交子代‘中山杉’系列品種的SSR指紋圖譜構(gòu)建及遺傳關(guān)系分析
發(fā)布時間:2025-01-19 12:24
運(yùn)用熒光標(biāo)記毛細(xì)管電泳技術(shù),對池杉[Taxodium distichum var.imbricatum(Nuttall) Croom]、墨西哥落羽杉(T.mucronatum Tenore)和落羽杉[T.distichum(Linn.) Rich.]的單株以及‘中山杉’(T.‘Zhongshanshan’)系列品種共96個樣本進(jìn)行SSR分子標(biāo)記檢測,分析供試樣本的遺傳多樣性并分別構(gòu)建指紋圖譜;在此基礎(chǔ)上,依據(jù)供試樣本的Nei's遺傳距離進(jìn)行聚類分析。結(jié)果顯示:6對SSR引物共擴(kuò)增條帶91條,其中多態(tài)性條帶68條;每對引物擴(kuò)增條帶9~31條,其中多態(tài)性條帶6~27條,多態(tài)性條帶百分率平均值為70.9%;各引物的多態(tài)性信息含量指數(shù)為0.476~0.793,平均值為0.658;供試樣本的Nei's基因多樣性指數(shù)、Shannon's多態(tài)性信息指數(shù)、觀測雜合度和期望雜合度的平均值分別為0.755、1.599、0.381和0.245。用4對SSR引物的多態(tài)性條帶可構(gòu)建40個‘中山杉’系列品種的指紋圖譜,指紋編碼數(shù)量為33,鑒別率達(dá)85.0%;用6對SSR引物的多態(tài)性條帶可構(gòu)建15個池杉、23個墨西...
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【部分圖文】:
本文編號:4028975
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圖1 40個‘中山杉’系列品種以及56個池杉、墨西哥落羽杉和落羽杉單株的NJ聚類圖
SSR分子標(biāo)記通常是共顯性標(biāo)記,呈共顯性的引物有3種帶型,即只有父本帶、只有母本帶和親本雜合帶[16-17]。本研究中,針對‘中山杉’系列品種進(jìn)行SSR分子標(biāo)記擴(kuò)增,在排除信息錯誤后,其中有些品種的擴(kuò)增條帶出現(xiàn)了親本中沒有的新條帶,例如:經(jīng)四堿基(CCTT)5重復(fù)SSR引物TA0....
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