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美洲黑楊群體結(jié)構(gòu)分析及核心種質(zhì)庫構(gòu)建

發(fā)布時間:2021-09-03 20:42
  【目的】利用SSR分子標(biāo)記技術(shù)研究美洲黑楊種質(zhì)資源的群體結(jié)構(gòu),構(gòu)建美洲黑楊核心種質(zhì)資源庫,為美洲黑楊種質(zhì)資源的科學(xué)管理、高效利用和有效保護(hù)提供理論依據(jù)。【方法】利用15對SSR引物,分析美洲黑楊6個種源23個采樣點(diǎn)的338個個體的遺傳結(jié)構(gòu)。應(yīng)用Gene Al Ex 6.503等軟件計(jì)算等位基因數(shù)(Na)、有效等位基因數(shù)(Ne)、Shannon’s信息多樣性指數(shù)(I)、觀測雜合度(Ho)、Nei’s遺傳多樣性指數(shù)(H)和多態(tài)信息含量(PIC)等遺傳參數(shù),并進(jìn)行主坐標(biāo)(PCoA)分析。采用分組的逐步聚類方法結(jié)合位點(diǎn)等位基因數(shù)目最大化法和位點(diǎn)稀有等位基因優(yōu)先相結(jié)合的取樣策略構(gòu)建核心種質(zhì)庫,并在核心種質(zhì)庫的基礎(chǔ)上補(bǔ)充種質(zhì)個體使等位基因保留比例達(dá)到100.00%,形成優(yōu)化核心種質(zhì)庫。通過對相關(guān)遺傳參數(shù)的t檢驗(yàn)和PCoA分析驗(yàn)證核心種質(zhì)庫和優(yōu)化核心種質(zhì)庫的有效性!窘Y(jié)果】美洲黑楊群體結(jié)構(gòu)研究結(jié)果表明6個種源群體被劃分為3大類型,即分布在圣勞倫斯河流域的Que種源的個體和哥倫比亞河流域的Was種源個體歸為一類;分布在密西西比河中下游流域的種源個體(Mis、Lou、Ten)大致歸為一類;分布在密西西比... 

【文章來源】:林業(yè)科學(xué). 2020,56(09)北大核心EICSCD

【文章頁數(shù)】:10 頁

【部分圖文】:

美洲黑楊群體結(jié)構(gòu)分析及核心種質(zhì)庫構(gòu)建


美洲黑楊群體遺傳結(jié)構(gòu)

核心種質(zhì)


通過對比核心種質(zhì)與原始種質(zhì)檢測位點(diǎn)的等位變異情況,發(fā)現(xiàn)核心種質(zhì)在15個檢測位點(diǎn)丟失了24個等位變異基因,在保留種質(zhì)中挑選了15個美洲黑楊個體為補(bǔ)充種質(zhì),補(bǔ)充到核心種質(zhì)中,形成優(yōu)化核心種質(zhì)庫。優(yōu)化核心種質(zhì)庫共包括34個美洲黑楊個體,篩選比例為10.06%(表3)。通過對比遺傳參數(shù)可以看出優(yōu)化核心種質(zhì)庫的等位基因保留比例達(dá)到100.00%,其他遺傳參數(shù)(Ne、I、Ho、H、PIC)均高于原始種質(zhì)庫。與核心種質(zhì)相比,Ne、I、H和PIC均增大,說明補(bǔ)充種質(zhì)的加入提高了核心種質(zhì)庫的遺傳多樣性水平(表4)。通過t檢驗(yàn)結(jié)果表明優(yōu)化核心種質(zhì)庫與原始種質(zhì)庫之間的遺傳多樣性不存在顯著差異,可以代表原始種質(zhì)庫的遺傳多樣性水平(表5)。通過對補(bǔ)充種質(zhì)的PCo A分析,可以看出補(bǔ)充種質(zhì)進(jìn)一步擴(kuò)大了核心種質(zhì)的分布范圍,使優(yōu)化核心種質(zhì)具有更好的代表性(圖2)。3 討論

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[2]基于等位基因最大化法初步構(gòu)建杜仲核心種質(zhì)[J]. 李洪果,許基煌,杜紅巖,烏云塔娜,劉攀峰,杜慶鑫.  林業(yè)科學(xué). 2018(02)
[3]利用表型性狀構(gòu)建杜仲雄性資源核心種質(zhì)[J]. 李洪果,杜紅巖,賈宏炎,諶紅輝,許基煌,杜慶鑫,王璐.  分子植物育種. 2018(02)
[4]新疆野核桃核心種質(zhì)的構(gòu)建[J]. 張捷,張萍,李勤霞.  果樹學(xué)報(bào). 2018(02)
[5]一種簡易高效提取多種植物純凈DNA的方法[J]. 丁浩,鄭唐春,梁德洋,曲冠證.  植物研究. 2015(03)
[6]灰楸形態(tài)多樣性分析及核心種質(zhì)初步構(gòu)建[J]. 李秀蘭,賈繼文,王軍輝,麻文俊,馬建偉,趙秋玲.  植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2013(02)
[7]微衛(wèi)星標(biāo)記中的無效等位基因[J]. 文亞峰,Kentaro Uchiyama,韓文軍,Saneyoshi Ueno,謝偉東,徐剛標(biāo),Yoshihiko Tsumura.  生物多樣性. 2013(01)
[8]楊樹抗逆轉(zhuǎn)錄因子基因內(nèi)SSR標(biāo)記的開發(fā)[J]. 王保壘,王博文,陳清清,李百煉,張德強(qiáng).  林業(yè)科學(xué). 2011(08)
[9]毛白楊木材形成功能基因內(nèi)SSR標(biāo)記的開發(fā)及評價(jià)[J]. 杜慶章,王博文,王保壘,張曼,李百煉,張志毅,張德強(qiáng).  林業(yè)科學(xué). 2010(11)
[10]小葉楊DREB同源基因內(nèi)SSR的發(fā)現(xiàn)及群體結(jié)構(gòu)分析[J]. 衛(wèi)尊征,杜慶章,郭琦,張金鳳,李百煉,張德強(qiáng).  植物學(xué)報(bào). 2010(05)

博士論文
[1]新疆野蘋果(Malus sieversii)群體遺傳結(jié)構(gòu)與核心種質(zhì)構(gòu)建方法[D]. 張春雨.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008

碩士論文
[1]我國辣椒種質(zhì)資源遺傳多樣性分析及核心種質(zhì)構(gòu)建的研究[D]. 顧曉振.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2016
[2]美洲黑楊遺傳多樣性分析與核心種質(zhì)庫構(gòu)建[D]. 倪茂磊.南京林業(yè)大學(xué) 2011



本文編號:3381826

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