【目的】研究辣椒脈斑駁病毒(Pepper veinal mottle virus,PVMV)的分布及遺傳變異,為明確該病毒在我國(guó)的流行擴(kuò)散分子機(jī)制提供理論依據(jù)。【方法】利用特異性引物反轉(zhuǎn)錄PCR(RT-PCR)檢測(cè)從湖北宜昌及廣西南寧和百色采集的48份疑似感染PVMV的辣椒樣本;采用常規(guī)Sanger測(cè)序測(cè)定PCR產(chǎn)物序列,序列采用MEGA 5.0構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹(shù),采用RDP等算法分析其可能的重組事件;采用DnaSP v5分析病毒株系不同群體之間的基因流及基因差異�！窘Y(jié)果】從48份辣椒樣本中檢測(cè)到5份樣本被PVMV侵染,檢出率10.42%�；蛲葱员葘�(duì)分析結(jié)果表明,測(cè)定的PVMV湖北和廣西分離物CP基因序列同源性在97.00%以上,與其他地區(qū)分離物的同源性為91.73%～98.78%。系統(tǒng)發(fā)育分析表明,湖北(YC)和廣西(NN)PVMV分離物與我國(guó)臺(tái)灣PVMV分離物的親緣關(guān)系最近。重組分析表明,PVMV廣西分離物NN10有2個(gè)重組事件�！窘Y(jié)論】湖北和廣西辣椒的PVMV檢測(cè)結(jié)果表明,該病毒已擴(kuò)散至湖北和廣西;基因突變可能是PVMV湖北分離物遺傳變異的主要方式之一;而基因重組和基因突變可...

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圖1 PVMV特異性RT-PCR擴(kuò)增凝膠電泳結(jié)果

將PVMV分離物CP基因序列分為我國(guó)分離物群（I亞群）和國(guó)外分離物群（II亞群）兩個(gè)群體，采用DnaSPv5分析兩個(gè)群體間CP基因的變異及基因流。兩個(gè)群體CP基因的基因變異分析結(jié)果（表4）表明，我國(guó)PVMV分離物群體CP基因的分離位點(diǎn)數(shù)量（Ss）、平均差異位點(diǎn)數(shù)（k）和核苷酸多....

圖2 湖北和廣西PVMV分離物與其他地區(qū)PVMV分離物的CP基因序列系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹(shù)

圖1PVMV特異性RT-PCR擴(kuò)增凝膠電泳結(jié)果3討論

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