黃龍病(huanglongbing, HLB)是華南柑橘產(chǎn)區(qū)最嚴(yán)重的病害之一,主要通過柑橘木虱和嫁接等方式傳播,不同的感病方式對(duì)寄主的影響可能有所差別。本研究通過嫁接的方式,研究黃龍病對(duì)椪柑在感病早期和發(fā)病晚期轉(zhuǎn)錄組的影響。在早期(14 wpi),總共有6 467個(gè)基因出現(xiàn)了顯著差異表達(dá),而在晚期(22 wpi),總共有9 625個(gè)基因出現(xiàn)了顯著差異表達(dá)。對(duì)差異表達(dá)的基因進(jìn)行KEGG富集分析,發(fā)現(xiàn)14 wpi組的差異表達(dá)基因總共有14個(gè)通路出現(xiàn)了富集,而22 wpi組的差異表達(dá)基因總共有24個(gè)通路出現(xiàn)了富集。對(duì)8個(gè)差異表達(dá)的基因進(jìn)行熒光定量PCR驗(yàn)證,結(jié)果表明這些基因在兩個(gè)階段的表達(dá)變化趨勢(shì)與轉(zhuǎn)錄組的數(shù)據(jù)基本一致。本研究通過研究黃龍病不同發(fā)病階段的差異基因表達(dá),為探究黃龍病的發(fā)病機(jī)理提供了一定的理論基礎(chǔ)。

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【部分圖文】：

圖1健康的和感染了黃龍病的椪柑

接種了黃龍病的椪柑(CitrusreticulataBlancocv.Ponkan)，在初期(14周,14wpi)時(shí)，一些葉片上開始出現(xiàn)黃化的癥狀。在后期(22周,22wpi)時(shí)，葉片上出現(xiàn)更加明顯的斑駁黃化等黃龍病典型癥狀(圖1)。通過巢式PCR檢測(cè)，接種后的樣品均有....

圖3兩組差異調(diào)控基因的火山圖(Volcanoplot)和韋恩圖(Vennplot)

在14wpi組的差異表達(dá)基因GO(GeneOthology)富集分析發(fā)現(xiàn)(圖4A)，在生物學(xué)過程(BiologicalProcess,BP)分類中，有43個(gè)Terms出現(xiàn)了富集，顯著性最高的前3小類分別為木質(zhì)素代謝過程(Ligninmetabolicprocess,G....

圖414wpi組（A)和22wpi組（B）差異基因的GO功能注釋

經(jīng)過KEGG富集分析發(fā)現(xiàn)，蛋白合成的相關(guān)通路核糖體(Ribosome,ko03010)、和蛋白折疊轉(zhuǎn)運(yùn)相關(guān)通路內(nèi)質(zhì)網(wǎng)蛋白加工(Proteinprocessinginendoplasmicreticulum,ko04141)兩個(gè)通路在14wpi組的差異基因中出現(xiàn)顯著富集....

圖514wpi組（A)和22wpi組（B）差異基因的KEGG富集圖

圖414wpi組（A)和22wpi組（B）差異基因的GO功能注釋1.9次生代謝物相關(guān)差異基因

本文編號(hào)：3890515