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辣椒抗白粉病基因CaMLO4的克隆和表達(dá)分析

發(fā)布時間:2022-01-17 15:33
  MLO基因是植物中特有的一類抗病負(fù)調(diào)控因子,該基因突變導(dǎo)致植物產(chǎn)生廣譜抗病性。為研究MLO基因在辣椒中表達(dá)模式及功能分析,以前期本課題組通過SSH文庫獲得的ESTs,設(shè)計引物,采用RT-PCR和RACE的方法,成功克隆了一個CaMLO4基因,并對該基因的特性和表達(dá)模式進(jìn)行了初步分析,結(jié)果顯示了該CaMLO4基因可能參與辣椒白粉病的調(diào)控過程。 

【文章來源】:綠色科技. 2020,(02)

【文章頁數(shù)】:3 頁

【部分圖文】:

辣椒抗白粉病基因CaMLO4的克隆和表達(dá)分析


總RNA質(zhì)量檢測

序列,蛋白,膜結(jié)構(gòu)


跨膜結(jié)構(gòu)域是膜中蛋白與膜脂結(jié)合的主要部位,一般由20個左右的疏水氨基酸殘基組成,形成α螺旋,與膜脂相結(jié)合。預(yù)測和分析跨膜結(jié)構(gòu)域?qū)φJ(rèn)識蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)、功能、分類以及在細(xì)胞中的作用部位均存在一定的意義。利用TMHMM2.0Serve在線軟件對CaM-LO4基因的氨基酸進(jìn)行了跨膜結(jié)構(gòu)域的分析。如圖3所示,CaMLO4蛋白的跨膜結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果均顯示包含6個跨膜結(jié)構(gòu)(seven-TM)。CaMLO4蛋白的6次跨膜結(jié)構(gòu)域,分別在15-35,61-83,157-179,281-300,305-322,392-414個氨基酸處形成跨膜的結(jié)構(gòu)域。利用NCBI中的Conserved Domain Database(CDD)數(shù)據(jù)庫對CaMLO4蛋白的保守結(jié)構(gòu)域進(jìn)行預(yù)測,結(jié)果顯示(圖4)該蛋白為MLO蛋白超家族成員。利用在線軟件PSORT II Prediction分析CaMLO4蛋白的亞細(xì)胞定位,發(fā)現(xiàn)該蛋白在plasma membrane中分布最多,達(dá)60.9%,其次為endoplasmic reticulum和vacuolar,達(dá)13.0%,再次是nuclear,mitochondrial,Golgi中也有分布,達(dá)4.3%。利用在線軟件SWISS-MODEL對CaMLO4蛋白進(jìn)行同源模建,預(yù)測其三級結(jié)構(gòu)模型,其最佳模型是(圖5),序列一致性為23.08%;另一模型是4ib4.1.A。

結(jié)構(gòu)域,蛋白,基因,白粉


RT-PCR分析表明(圖6),樣品在35個循環(huán)時就有大量擴(kuò)增產(chǎn)物出現(xiàn),說明供試基因在白粉菌接種后的cDNA群體中表達(dá)豐度較高,在未接種白粉時CaMLO4基因有一定的本底表達(dá),接種白粉病菌后24h表達(dá)量開始升高,36h時達(dá)到最大,后續(xù)出現(xiàn)了較明顯的下調(diào),基因的Northern雜交中(圖7),可以看出,在0h時就略微有表達(dá),在36h時開始增加,并且在以后的48h表達(dá)量最高,與RT-PCR驗證有一些區(qū)別。這與已經(jīng)報道的擬南芥和甜瓜MLO基因表達(dá)模式相似,說明CaMLO4基因可能參與辣椒白粉病的調(diào)控過程。圖5 CaMLO4蛋白三級結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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博士論文
[1]辣椒應(yīng)答逆境的轉(zhuǎn)錄譜分析及相關(guān)候選基因cDNA分離與鑒定[D]. 林明.福建農(nóng)林大學(xué) 2008



本文編號:3594984

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