本研究以栽培草莓為材料,用炭疽菌對(duì)植株進(jìn)行侵染,對(duì)健康草莓和患病草莓進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組分析（RNA-seq）,共得到86 988個(gè)序列以及2 127個(gè)差異表達(dá)基因。利用GO數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行了聚類(lèi)分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)差異表達(dá)基因主要聚類(lèi)在光合作用、氧化還原過(guò)程、氧化還原酶活性、碳固定過(guò)程以及糖代謝過(guò)程等方面。同時(shí),利用KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)差異表達(dá)基因影響的通路進(jìn)行注釋后發(fā)現(xiàn),炭疽菌侵染主要影響了光合作用、倍半萜和三萜生物途徑、類(lèi)黃酮生物合成、谷胱甘肽代謝和植物激素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)等途徑中關(guān)鍵基因的表達(dá)水平。挑選了20個(gè)差異表達(dá)基因進(jìn)行qRT-PCR,結(jié)果有19個(gè)基因的表達(dá)趨勢(shì)與轉(zhuǎn)錄測(cè)序結(jié)果一致。本研究獲得的草莓應(yīng)答炭疽菌侵染轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)信息,將有助于豐富草莓抗炭疽病的調(diào)控機(jī)制。 

【文章來(lái)源】：植物保護(hù). 2020,46(03)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】：9 頁(yè)

【部分圖文】：

草莓葉柄被Colletotrichum gloeosporioides

對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行GO數(shù)據(jù)庫(kù)分析,一共比對(duì)到了1 122個(gè)GO功能條目,篩選出p值小于0.01的68個(gè)條目進(jìn)行后續(xù)分析。 這68個(gè)條目分為3大類(lèi)功能,生物學(xué)過(guò)程(biological process)、細(xì)胞組分(cellular component)和分子功能(molecular function),每類(lèi)功能分別包括26個(gè)、14個(gè)和10個(gè)功能亞組,圖3展示了每類(lèi)功能之下的10個(gè)功能亞分組。分析發(fā)現(xiàn),感染炭疽菌的草莓葉柄的光合作用過(guò)程受到了極大的影響,這一結(jié)果和病癥相對(duì)應(yīng)。炭疽菌侵染到草莓葉柄處,逐漸積累到一定程度時(shí)會(huì)在葉柄外部出現(xiàn)紅褐色病斑,嚴(yán)重影響正常的光合作用,進(jìn)而草莓的很多生長(zhǎng)代謝過(guò)程也會(huì)出現(xiàn)異常。分子功能中的氧化還原酶活性功能,還有生物學(xué)過(guò)程中的氧化還原過(guò)程都富集了大量的差異表達(dá)基因等,這二者都是植物抗逆反應(yīng)中重要的環(huán)節(jié)[9],說(shuō)明在草莓應(yīng)答炭疽病的過(guò)程中,氧化還原反應(yīng)很可能發(fā)揮了關(guān)鍵性的作用。

分析發(fā)現(xiàn),感染炭疽菌的草莓葉柄的光合作用過(guò)程受到了極大的影響,這一結(jié)果和病癥相對(duì)應(yīng)。炭疽菌侵染到草莓葉柄處,逐漸積累到一定程度時(shí)會(huì)在葉柄外部出現(xiàn)紅褐色病斑,嚴(yán)重影響正常的光合作用,進(jìn)而草莓的很多生長(zhǎng)代謝過(guò)程也會(huì)出現(xiàn)異常。分子功能中的氧化還原酶活性功能,還有生物學(xué)過(guò)程中的氧化還原過(guò)程都富集了大量的差異表達(dá)基因等,這二者都是植物抗逆反應(yīng)中重要的環(huán)節(jié)[9],說(shuō)明在草莓應(yīng)答炭疽病的過(guò)程中,氧化還原反應(yīng)很可能發(fā)揮了關(guān)鍵性的作用。2.5 差異表達(dá)基因的 Pathway 富集分析

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]柱花草苯丙氨酸解氨酶（SgPALs）對(duì)生物脅迫與非生物脅迫的響應(yīng)[J]. 郭鵬飛,雷健,羅佳佳,劉攀道,虞道耿,羅麗娟.  熱帶作物學(xué)報(bào). 2019(09)
[2]干旱脅迫下植物體內(nèi)活性氧的作用機(jī)制[J]. 王福祥,肖開(kāi)轉(zhuǎn),姜身飛,曲夢(mèng)宇,連玲,何煒,陳麗萍,謝華安,張建福.  科學(xué)通報(bào). 2019(17)
[3]水分脅迫對(duì)春大豆葉片保護(hù)酶活性及相對(duì)電導(dǎo)率的影響[J]. 王文佳,李爽,馬澤眾,馬玉玲,劉麗君,董守坤.  中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào). 2019(11)
[4]基于轉(zhuǎn)錄組研究葡萄糖對(duì)葡萄試管苗碳代謝的影響[J]. 梁國(guó)平,李文芳,馬宗桓,左存武,褚明宇,馬麗娟,何紅紅,萬(wàn)鵬,陳佰鴻,毛娟.  園藝學(xué)報(bào). 2019(01)
[5]基于高光譜的晚疫病脅迫下馬鈴薯葉片的過(guò)氧化物酶活性檢測(cè)[J]. 胡耀華,李清宇,唐翊.  江蘇大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2018(06)
[6]杜梨根莖葉特異表達(dá)基因的RNA-Seq分析[J]. 張歡,楊英杰,李鼎立,宋健坤,馬春暉,王然.  園藝學(xué)報(bào). 2018(10)
[7]淡紫擬青霉QLP12對(duì)感染灰霉病后番茄植株的促生作用及抗病相關(guān)酶活性變化[J]. 張菁,連清貴,陳婧,馬青,王陽(yáng).  植物保護(hù)學(xué)報(bào). 2018(05)
[8]PEG模擬干旱脅迫下野生大豆轉(zhuǎn)錄組分析[J]. 張小芳,王冰冰,徐燕,張煒坤,趙恢,張鍇,喬亞科,李桂蘭.  大豆科學(xué). 2018(05)
[9]防治草莓炭疽病的芽胞桿菌組合的篩選[J]. 陳哲,黃靜,趙佳,梁宏.  中國(guó)生物防治學(xué)報(bào). 2018(04)
[10]堿脅迫下H2S參與活性氧代謝和水稻幼苗生長(zhǎng)的調(diào)控[J]. 祝一文,車(chē)永梅,趙方貴,朱丹,劉新.  農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2018(07)

博士論文
[1]花生應(yīng)答果腐病病原菌侵染的轉(zhuǎn)錄組和miRNAs研究及抗性相關(guān)基因克隆[D]. 王冕.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018

碩士論文
[1]輪紋病致病菌Botryosphaeria dothidea侵染對(duì)蘋(píng)果抗性反應(yīng)、乙烯合成和相關(guān)基因表達(dá)的影響[D]. 耿夙.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016



本文編號(hào)：3371098