目前,全球的水污染極其嚴重,在引起水污染的諸多因素中,重金屬的排放與遷移導(dǎo)致的水體污染日益顯著,其危害程度也逐日漸增。鉛作為重金屬污染中毒性較大的一種,其危害十分常見。 生活中鉛污染的來源極為廣泛。作為具有神經(jīng)毒性的重金屬,其毒性十分嚴重。對于生物而言,鉛毒可以作用與全身各個系統(tǒng)和器官,鉛不僅對生物細胞的超微結(jié)構(gòu)影響嚴重,對神經(jīng)系統(tǒng)損傷也十分明顯,因此,目前關(guān)于鉛毒理學的研究已成為水體重金屬污染的一個熱點課題。關(guān)于鉛的研究目前主要關(guān)注于引發(fā)機體產(chǎn)生“亞臨床毒性”,基因水平的損傷研究進行較少。探究鉛毒害脅迫下整體基因的改變和基因表達量的變化、相關(guān)代謝變化對于從分子水平研究鉛脅迫下的毒理機制及鉛損傷后的修復(fù)機制十分重要。 日本三角渦蟲(Dugesia japonica)屬扁形動物門,渦蟲綱,生活在淡水環(huán)境中。作為淡水污染指示動物,日本三角渦蟲在環(huán)境水源重金屬污染研究評估方面起到重要作用。 本實驗采用日本三角渦蟲作為實驗動物。經(jīng)醋酸鉛溶液(80mg·L-1)處理48h,miRNeasy Mini Kit(217084)試劑盒提取總RNA, Agilent2100測定總RNA的濃度、...

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【學位級別】：碩士

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摘要
Abstract
第1章 前言
    1.1 轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)的發(fā)展
        1.1.1 轉(zhuǎn)錄組的定義
        1.1.2 微陣列技術(shù)
        1.1.3 表達序列標簽測序
        1.1.4 基因表達系列分析
        1.1.5 轉(zhuǎn)錄組測序
    1.2 數(shù)字基因表達譜的研究現(xiàn)狀
        1.2.1 數(shù)字基因表達譜
        1.2.2 數(shù)字基因表達譜的應(yīng)用范圍
        1.2.3 數(shù)字基因表達譜在探究基因差異表達中的應(yīng)用
        1.2.4 日本三角渦蟲表達譜研究現(xiàn)狀
    1.3 日本三角渦蟲鉛損傷研究現(xiàn)狀
        1.3.1 重金屬損傷效應(yīng)的研究現(xiàn)狀
        1.3.2 鉛損傷對生物體的研究現(xiàn)狀
        1.3.3 鉛損傷對日本三角渦蟲的研究
    1.4 選題意義
        1.4.1 日本三角渦蟲的研究現(xiàn)狀
        1.4.2 日本三角渦蟲鉛損傷的研究意義
第2章 材料與方法
    2.1 實驗材料
        2.1.1 實驗標本的采集與飼養(yǎng)
        2.1.2 實驗材料處理方法
        2.1.3 實驗儀器和試劑
        2.1.4 分析軟件及數(shù)據(jù)庫
    2.2 試驗方法
        2.2.1 日本三角渦蟲總RNA的提取
        2.2.2 檢測RNA的純度和完整性
        2.2.3 對RNA進行RNA-Seq測序
        2.2.4 測序評估
        2.2.5 基因功能注釋
        2.2.6 差異表達譜的生物信息學分析
第3章 結(jié)果分析
    3.1 瓊脂糖凝膠電泳
    3.2 日本三角渦蟲總RNA的濃度和純度測定
    3.3 生物信息學分析
        3.3.1 測序數(shù)據(jù)處理與比對
        3.3.2 測序評估
        3.3.3 基因表達量統(tǒng)計
        3.3.4 差異表達基因篩選
        3.3.5 基因表達模式聚類分析
        3.3.6 Gene Ontology功能顯著性富集分析
        3.3.7 Gene Ontology功能分類
        3.3.8 KEGG Pathway顯著性富集分析
第4章 討論
    4.1 數(shù)字基因表達譜測序技術(shù)在探尋差異基因中的應(yīng)用
    4.2 測序數(shù)據(jù)的比對
    4.3 差異表達基因的篩選
    4.4 差異表達基因的GO分析
    4.5 差異表達基因的Pathway分析
        4.5.1 蛋白質(zhì)合成過程中的相關(guān)差異表達基因
        4.5.2 氧化磷酸化途徑上的相關(guān)差異表達基因
        4.5.3 人類疾病相關(guān)的差異表達基因
第5章 結(jié)論
參考文獻
致謝
攻讀學位期間的研究成果



本文編號：4021248