本文關(guān)鍵詞：生物信息學(xué)，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

    講正事兒之前，先講兩個無關(guān)的故事。前段時間在看正版的《三國志通俗演義》，以前看過很多遍的那個《三國演義》其實是盜版。呂布很有意思，武功天下第一，張飛十幾個回合就不行了，關(guān)羽一看老三不照了，拍馬上前雙戰(zhàn)呂布，還是擺不平。老大劉備一看擺不平，拔劍就沖上去。呂布一看：這不成流氓斗毆了嗎？哪有三打一的？撤了。話說呂布武功高是高，但整天到處被人追殺，亡命天涯，最后還是被曹操抓住砍了頭，啥原因呢？其實就是沒有自己的地盤。另一個故事是這樣的，有天下大雨，淋了我一身，回家找衣服穿，老婆在一邊就說了：找啥？你衣服都洗掉了，要不穿我的吧？我說不穿。老婆怒：不穿你裸奔吧。后來想想，有的穿總比裸奔好哈，所以老老實實穿了老婆的衣服。
    說正事兒，講講生物信息學(xué)。生物信息學(xué)是干啥的？你能一句話概括出來嗎？想清楚再說哦！呃，你要回答：用信息學(xué)的方法來解決生物學(xué)的問題，對不對？好，爭議就在“問題”上。主流學(xué)者兩派觀點，一派認(rèn)為生物信息學(xué)應(yīng)當(dāng)能發(fā)現(xiàn)一些新的規(guī)律、新現(xiàn)象，所以是一門科學(xué)；另一派的觀點則認(rèn)為生物信息學(xué)應(yīng)當(dāng)處理生物學(xué)里一些實際的問題，比如算法、數(shù)據(jù)庫，軟件等，，所以是一門技術(shù)。目前來說，前一派的觀點占據(jù)絕對的優(yōu)勢，后一派則因為大家認(rèn)為技術(shù)這東西等同民工而強(qiáng)烈鄙視。前一派觀點占據(jù)主流，問題就來了。大家會問你：你一修電腦的，怎么發(fā)現(xiàn)新的規(guī)律和現(xiàn)象？充其量就是個預(yù)測！既然是預(yù)測，那就得拿實驗驗證��！所以，大家的邏輯是：生物信息學(xué)要做實驗。好，講到實驗，問題又來了：自己做還是合作？自己做？呵呵，隔行如隔山，并且實驗儀器、試劑等等可比計算機(jī)貴多了，而且出活太慢，要是什么東西都實驗驗證了，那估計搞計算的早退休了。雖然咱自己也做實驗，可如果能三年出數(shù)據(jù)，五年出文章，就一般的文章，我都很滿足了。所以搞生物信息的自己做實驗，這屬于大R和超R玩家 (R, RMB)的戰(zhàn)法，對于年輕學(xué)者來說，不要抱太大的指望。那么就只能跟實驗學(xué)家合作�？珊献饕膊皇悄敲慈菀椎�。搞生物信息學(xué)嘛，不管你怎么忽悠，其實還是算法、工具、數(shù)據(jù)庫、軟件這些玩意兒，多數(shù)實驗學(xué)家一般不會用到特別復(fù)雜的東西，就像你含辛茹苦弄出個金馬桶，好是好，就是太沉，拉了沒力氣倒。所以大多數(shù)人還是去蹲坑，你這金馬桶那也就只能看看。并且，如果是常規(guī)的生物信息學(xué)分析，找個學(xué)生做做就得了，請一個專家合作，又得給共通訊，又得分基金，經(jīng)濟(jì)上不合算。所以，合作也不靠譜。
     所以我這么分析一圈，就是想說，主流學(xué)派強(qiáng)調(diào)發(fā)現(xiàn)新玩意兒，如果要做實驗驗證，自己做或者合作都是極度不靠譜的事情。那有沒有別的辦法？有。雄雷支了一招，其實這招我?guī)熜趾芏嗄昵熬透抑v過，說搞生物信息學(xué)，文章要想法的好，要么做實驗，要么做進(jìn)化。后者的意思就是從進(jìn)化的角度來解釋你的結(jié)果。好不好呢？好是好，但也不是沒問題。第一，進(jìn)化的枝枝彎彎特別多，如果水平不夠，很容易弄出笑話，比如不懂positive selection結(jié)果發(fā)到Sciene上被人批成豬頭。發(fā)不出來也就算了，這種笑話如果發(fā)到Science上，那得多可怕？第二，把結(jié)果踢到進(jìn)化的好處是，死無對證，進(jìn)化動輒就是幾百萬年，怎么驗證？那審稿人也沒法讓你驗證。當(dāng)然嘍，這東西玩多了，靠不靠譜就算是頂尖學(xué)者的心里，恐怕也是打鼓。所以，進(jìn)化這東西，要玩先掂量掂量自己的分量，玩不過雄雷那還是洗洗睡吧。所以，進(jìn)化是一條好路，可你真要走這條路，那不如硬著頭皮自己做實驗：我就這么干的。
    結(jié)論：主流學(xué)派的想法很好，但基本上來說，因為可操作性極差，所以不現(xiàn)實。對于非主流學(xué)派的觀點(技術(shù)流)，主流人士歷來看不上，所以，生物信息學(xué)目前的唯一選擇就是：裸奔。

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