目的:高血壓是最常見的慢性非傳染性疾病,也是全球范圍內(nèi)心血管疾病死亡的主要原因之一。在臨床上,服用降壓藥物是最常用的治療手段,但近年來降壓藥物的安全問題頻發(fā)。本課題從多組學(xué)角度,對(duì)ACEI類的一線降壓藥物進(jìn)行研究,并與33種癌癥的特異性基因進(jìn)行表達(dá)模式的匹配分析,探究其潛在致癌風(fēng)險(xiǎn)因素并篩選相關(guān)生物標(biāo)志物,為高血壓病的藥物治療方案提供組學(xué)層面的參考。方法:通過GEO、ArrayExpress等基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)獲取符合分析條件的ACEI類降壓藥物的基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)。利用生物信息學(xué)方法進(jìn)行差異表達(dá)基因、通路富集等分析,參考從Drugbank、PharmGKB、KEGG Drug等藥物數(shù)據(jù)庫(kù)中獲取到的ACEI類藥物靶點(diǎn)數(shù)據(jù),綜合得出與ACEI類降壓藥密切相關(guān)的基因（ACEI-DEGs）。隨后利用UALCAN數(shù)據(jù)庫(kù)中對(duì)ACEI-DEGs進(jìn)行差異表達(dá)分析,研究其在33種癌癥的表達(dá)量情況,篩選其中具有顯著差異性且與ACEI-DEGs表達(dá)模式（上調(diào)或下調(diào)）一致的基因,并對(duì)每一個(gè)基因集進(jìn)行蛋白質(zhì)互作用網(wǎng)絡(luò)分析,篩選出Hub基因（蛋白質(zhì)）。從TCGA中分別獲取這相關(guān)癌癥樣本的生存時(shí)間臨床數(shù)據(jù),對(duì)Hub基因（... 

【文章來源】：山西醫(yī)科大學(xué)山西省

【文章頁(yè)數(shù)】：46 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

缺失值補(bǔ)充及數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化的部分代碼

部分代碼如圖1-2，篩選閾值需要根據(jù)數(shù)據(jù)情況做調(diào)整，本課題根據(jù) Benjamini 和 Hochberg 提出的方法修正原始 P，以 P＜0.07，|logFC|≥0.3 作為 DEGs 的篩選閾值。結(jié)合 DEGs 表達(dá)譜之間的歐氏距離，使用層次聚類的方法構(gòu)建熱圖。利用 OriginLab 軟件(https://www.originlab.com/)[32]進(jìn)行相關(guān)數(shù)據(jù)的可視化。

11圖 1-4 本課題的技術(shù)路線圖.6 論文的創(chuàng)新點(diǎn)關(guān)于藥物安全性問題的研究，傳統(tǒng)角度是對(duì)藥品進(jìn)行病理學(xué)研究，并對(duì)樣本進(jìn)系列毒理試驗(yàn)，從結(jié)果中判斷藥物敏感性、毒性等方面。隨著大數(shù)據(jù)與高通量測(cè)術(shù)的發(fā)展與應(yīng)用，為藥物臨床研究提供了新的思路與方法，本論文從多組學(xué)角度CEI 類降壓藥進(jìn)行安全性分析，通過生物信息學(xué)方法建立藥物基因與與癌癥基因聯(lián)并篩選其生物標(biāo)志物，以期對(duì)未來高血壓疾病的藥物治療方案提供一定參考。


本文編號(hào)：2932960