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南瓜種質(zhì)資源遺傳多樣性SRAP和ISSR分析

發(fā)布時間:2017-08-23 11:39

  本文關(guān)鍵詞:南瓜種質(zhì)資源遺傳多樣性SRAP和ISSR分析


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【摘要】:南瓜具有豐富的營養(yǎng)價值、保健功能和加工價值,培育優(yōu)質(zhì)的南瓜品種越來越受到育種家的重視。利用分子標(biāo)記技術(shù)對南瓜種質(zhì)資源進(jìn)行遺傳多樣性和親緣關(guān)系分析,對于輔助南瓜育種十分重要。本論文利用SRAP和ISSR兩種分子標(biāo)記技術(shù),分析85份南瓜種質(zhì)資源遺傳多樣性,構(gòu)建遺傳聚類圖,鑒定種質(zhì)資源間的親緣遠(yuǎn)近,同時對南瓜的田間性狀進(jìn)行調(diào)查,為種質(zhì)資源鑒定、分類、雜交育種工作提供理論依據(jù)。主要結(jié)果如下:1南瓜SRAP反應(yīng)體系的建立以‘密本’南瓜為篩選體系材料,通過單因素試驗對南瓜SRAP擴(kuò)增體系中的Mg2+、dNTP、Taq酶、引物、DNA和擴(kuò)增程序中的退火溫度與循環(huán)次數(shù)進(jìn)行優(yōu)化。結(jié)果確立南瓜最佳20μL SRAP體系為:0.20mmol/L dNTP,1.50U Taq酶,80ng DNA,0.16μmol/L的單條引物,1.50mmol/LMg2+,2μL lOxBuffer;最優(yōu)反應(yīng)程序為:94℃預(yù)變性5min;接著94℃1min,35℃ 1min,72℃ 1min,5個循環(huán);然后94℃ 1min,52℃1min,72℃ 1min,35個循環(huán);最后72℃延伸10min。2南瓜種質(zhì)資源遺傳多樣性SRAP分析從100對SRAP引物中挑出17對引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,獲得總條帶200條,差異帶187條,13條條帶為所有南瓜共有,多態(tài)性比例為93.50%。通過Ntsys2.10e軟件計算出85份南瓜種質(zhì)資源遺傳相似系數(shù)為0.4500-0.9850。通過聚類,將收集的南瓜種質(zhì)資源分為美洲南瓜、中國南瓜、印度南瓜三類,親緣關(guān)系較近的是中國南瓜與美洲南瓜,兩類南瓜與印度南瓜的親緣關(guān)系均比較遠(yuǎn)。3南瓜ISSR反應(yīng)體系的建立以‘密本’南瓜為篩選體系材料,采用單因素試驗,對ISSR反應(yīng)體系的Mg2+、 dNTP、Taq酶、引物和DNA等5個因素進(jìn)行優(yōu)化。結(jié)果表明:南瓜25μiL ISSR最佳反應(yīng)體系包括:2.50μL lOxBuffer,2.00mmol/L Mg2+,0.30mmol/L dNTP, 1.00UTaq酶,0.48μmol/L引物,75ng DNA。在此基礎(chǔ)上,對篩選出的12條ISSR引物的退火溫度進(jìn)行優(yōu)化,確定每條引物的最佳退火溫度。4南瓜種質(zhì)資源遺傳多樣性ISSR分析從100條ISSR引物中篩選出12條引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,獲得總條帶125條,差異帶115條,10條條帶為所有南瓜共有,多態(tài)性比例為92.00%。通過Ntsys2.10e軟件計算出85份南瓜種質(zhì)資源的遺傳相似系數(shù)為0.3840-1.0000。通過聚類,將收集的南瓜種質(zhì)資源分為美洲南瓜、中國南瓜、印度南瓜三類,親緣關(guān)系較近的是中國南瓜與美洲南瓜,兩類南瓜與印度南瓜的親緣關(guān)系均比較遠(yuǎn)。5南瓜田間性狀調(diào)查結(jié)果田間性狀調(diào)查結(jié)果為:子葉長3.40cm-7.30cm;子葉寬2.15cm-4.38cm;子葉長寬比1.30-2.30;瓜重在0.41kg-8.60kg;瓜外橫徑8.60cm-26.40cm;瓜內(nèi)橫徑4.70cm-19.80cm;果實厚度1.85cm.3.48cm;瓜縱徑5.20cm-51.20cm:生長勢有強(qiáng)和中等兩種;主蔓橫切面形狀有圓形和五棱形兩種;葉面白斑有多、中等、少量之分;葉形上有心臟形、心臟五角、近三角、近圓形、掌狀五角、掌狀六種;生長習(xí)性有矮生和蔓生兩種;嫩瓜皮色上有淺綠、深綠、淺黃、綠色、橙紅、黃色六種;老瓜皮色上有橙黃、黃、棕黃、橙紅、深綠、墨綠、黃褐七種;老瓜肉色有橙黃、金黃、淺黃、黃、白五種;瓜面特征上有光滑、多溝、瘤突、皺縮、多棱五個特征;瓜形上有長頸圓筒、橢圓、梨形、扁圓、近圓、長筒六種;瓜面蠟粉上有多、少、無之分。
【關(guān)鍵詞】:南瓜 SRAP ISSR 分子標(biāo)記 遺傳多樣性
【學(xué)位授予單位】:福建農(nóng)林大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號】:S642.1
【目錄】:
  • 縮略詞表8-9
  • 摘要9-11
  • Abstract11-14
  • 第一章 前言14-22
  • 1 遺傳多樣性研究14-18
  • 1.1 遺傳多樣性的概念14
  • 1.2 遺傳多樣性的研究方法14-17
  • 1.2.1 形態(tài)學(xué)標(biāo)記14-15
  • 1.2.2 細(xì)胞學(xué)標(biāo)記15
  • 1.2.3 生化標(biāo)記15
  • 1.2.4 DNA分子標(biāo)記15-17
  • 1.3 遺傳多樣性研究的意義17-18
  • 2 南瓜遺傳多樣性的研究現(xiàn)狀18-21
  • 2.1 南瓜形態(tài)標(biāo)記18
  • 2.2 南瓜細(xì)胞學(xué)標(biāo)記18
  • 2.3 南瓜同工酶標(biāo)記18-19
  • 2.4 南瓜分子標(biāo)記19-21
  • 3 研究的目的與意義21
  • 4 研究內(nèi)容21-22
  • 第二章 南瓜種質(zhì)資源遺傳多樣性SRAP分析22-40
  • 第一節(jié) 南瓜SRAP反應(yīng)體系的建立22-32
  • 1 材料與方法22-25
  • 1.1 材料22-24
  • 1.1.1 實驗材料22-23
  • 1.1.2 實驗儀器23
  • 1.1.3 實驗試劑23-24
  • 1.2 方法24-25
  • 1.2.1 南瓜DNA提取方法24
  • 1.2.2 SRAP初始擴(kuò)增條件及擴(kuò)增程序24
  • 1.2.3 南瓜SRAP-PCR擴(kuò)增反應(yīng)體系及程序優(yōu)化24-25
  • 2 結(jié)果與分析25-30
  • 2.1 基因組DNA的檢測結(jié)果25-26
  • 2.2 Mg~(2+)對SRAP-PCR擴(kuò)增的影響26
  • 2.3 dNTP對SRAP-PCR擴(kuò)增的影響26-27
  • 2.4 Taq酶對SRAP-PCR擴(kuò)增的影響27
  • 2.5 引物濃度對SRAP-PCR擴(kuò)增的影響27-28
  • 2.6 模板DNA對SRAP-PCR擴(kuò)增的影響28
  • 2.7 退火溫度對SRAP-PCR擴(kuò)增的影響28-29
  • 2.8 循環(huán)次數(shù)對SRAP-PCR擴(kuò)增的影響29
  • 2.9 南瓜SRAP-PCR擴(kuò)增體系及擴(kuò)增程序的確立29-30
  • 3 討論30-32
  • 第二節(jié) 南瓜種質(zhì)資源遺傳多樣性SRAP分析32-40
  • 1 材料與方法32
  • 1.1 材料32
  • 1.1.1 實驗材料32
  • 1.1.2 實驗儀器32
  • 1.1.3 實驗試劑32
  • 1.2 方法32
  • 1.2.1 PCR反應(yīng)及電泳32
  • 1.2.2 SRAP引物的篩選32
  • 1.2.3 數(shù)據(jù)處理與分析32
  • 2 結(jié)果與分析32-38
  • 2.1 引物篩選32-33
  • 2.2 17引物對85個南瓜品種的SRAP擴(kuò)增結(jié)果33-35
  • 2.3 SRAP聚類結(jié)果分析35-38
  • 3 討論38-40
  • 第三章 南瓜種質(zhì)資源遺傳多樣性ISSR分析40-54
  • 第一節(jié) 南瓜ISSR反應(yīng)體系的建立40-47
  • 1 材料與方法40-41
  • 1.1 材料40
  • 1.1.1 實驗材料40
  • 1.1.2 實驗儀器40
  • 1.1.3 試劑40
  • 1.2 方法40-41
  • 1.2.1 ISSR原初擴(kuò)增條件及PCR擴(kuò)增程序40
  • 1.2.2 南瓜ISSR擴(kuò)增反應(yīng)體系的優(yōu)化40
  • 1.2.3 退火溫度的優(yōu)化40-41
  • 2 結(jié)果與分析41-45
  • 2.1 Mg~(2+)濃度對ISSR擴(kuò)增的影響41
  • 2.2 dNTP濃度對ISSR擴(kuò)增的影響41-42
  • 2.3 Taq酶濃度對ISSR擴(kuò)增的影響42
  • 2.4 引物濃度對ISSR擴(kuò)增的影響42
  • 2.5 DNA用量對ISSR擴(kuò)增的影響42-43
  • 2.6 退火溫度對ISSR擴(kuò)增的影響43-44
  • 2.7 南瓜ISSR-PCR擴(kuò)增體系及擴(kuò)增程序的確立44-45
  • 3 討論45-47
  • 第二節(jié) 南瓜種質(zhì)資源遺傳多樣性ISSR分析47-54
  • 1 材料與方法47
  • 1.1 材料47
  • 1.1.1 實驗材料47
  • 1.1.2 實驗儀器47
  • 1.1.3 實驗試劑47
  • 1.2 方法47
  • 1.2.1 PCR反應(yīng)及電泳47
  • 1.2.2 ISSR引物的篩選47
  • 1.2.3 數(shù)據(jù)處理與分析47
  • 2 結(jié)果與分析47-53
  • 2.1 引物的篩選47-48
  • 2.2 引物對85個南瓜品種的ISSR擴(kuò)增結(jié)果48-50
  • 2.3 ISSR聚類結(jié)果分析50-53
  • 3 討論53-54
  • 第四章 南瓜田間性狀調(diào)查54-63
  • 1 材料與方法54
  • 1.1 材料54
  • 1.1.1 實驗材料54
  • 1.1.2 主要儀器設(shè)備54
  • 1.2 方法54
  • 2 結(jié)果與分析54-55
  • 3 討論55-63
  • 第五章 小結(jié)63-65
  • 參考文獻(xiàn)65-70
  • 研究生期間發(fā)表相關(guān)論文情況70-71
  • 附錄171-74
  • 附錄274-77
  • 附錄377-86
  • 附錄486-98
  • 致謝98

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本文編號:724852


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