不同山羊品種朊蛋白基因多態(tài)性及其與血液免疫性狀的關(guān)聯(lián)分析
發(fā)布時(shí)間:2025-03-19 05:56
朊蛋白基因(PRNP)是調(diào)控朊蛋白表達(dá)的重要基因,存在高度的變異性,研究發(fā)現(xiàn)山羊PRNP基因編碼區(qū)存在10個(gè)氨基酸變異位點(diǎn)(102,127,143,146,154,211,218,219,222和240)和三個(gè)同義代替位點(diǎn)(42,125和138),PRNP基因位于山羊13號(hào)染色體,研究發(fā)現(xiàn)山羊PRNP基因遺傳多樣性與癢病的抗病性/易感性顯著相關(guān)。本試驗(yàn)以山東省規(guī);窖蝠B(yǎng)殖場為試驗(yàn)羊只,共采集851只山羊的血樣,包括3個(gè)品種即魯波山羊464只、萊蕪黑山羊131只和嶗山奶山羊256只,按年齡分為三組即1歲以下組、1歲-2歲組和2歲以上組。采取的技術(shù)路線是:首先,選取60只魯波山羊提取DNA、設(shè)計(jì)引物和混池測序,找出所研究群體中該基因可能存在的多態(tài)性位點(diǎn);對每只山羊的DNA樣品進(jìn)行測序,利用Chromas 2按照測序峰圖再為每個(gè)多態(tài)位點(diǎn)進(jìn)行基因型判定;用Pop Gen 32和SPSS 22分析PRNP基因多態(tài)位點(diǎn)和品種等對血液性狀的效應(yīng)值,找出與血液性狀有關(guān)聯(lián)的優(yōu)勢基因型。試驗(yàn)結(jié)果如下:1、在所研究群體中共發(fā)現(xiàn)11個(gè)SNP多態(tài)位點(diǎn),其中有3個(gè)SNP位點(diǎn)(NH1、NH2和3’UTR)為首次發(fā)現(xiàn)...
【文章頁數(shù)】:74 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
英文縮略詞
中文摘要
ABSTRACT
1 前言
1.1 魯波山羊、嶗山奶山羊和萊蕪黑山羊的特點(diǎn)
1.1.1 魯波山羊的特點(diǎn)
1.1.2 嶗山奶山羊的特點(diǎn)
1.1.3 萊蕪黑山羊的特點(diǎn)
1.1.4 魯波山羊、嶗山奶山羊和萊蕪黑山羊的抗病性狀
1.2 PRNP基因的研究進(jìn)展
1.3 朊蛋白
1.3.1 朊蛋白基因和蛋白的結(jié)構(gòu)
1.3.2 朊蛋白基因的表達(dá)調(diào)控
1.4 PRNP基因與山羊、綿羊癢病
1.4.1 癢病研究進(jìn)展
1.4.2 PRNP基因與綿羊癢病
1.4.3 PRNP基因與山羊癢病
1.5 目的意義
2 材料與方法
2.1 試驗(yàn)材料
2.1.1 試驗(yàn)樣品的采集
2.1.2 試驗(yàn)儀器設(shè)備
2.1.3 試驗(yàn)試劑及來源
2.1.4 主要數(shù)據(jù)庫及生物學(xué)軟件
2.1.5 常用試劑配制
2.2 試驗(yàn)方法
2.2.1 血常規(guī)的測定
2.2.2 血液基因組DNA的提取
2.2.3 PRNP基因的克隆及多態(tài)性分析
3 結(jié)果與分析
3.1 混池測序結(jié)果以及基因分型
3.1.1 混池測序結(jié)果
3.1.2 混池測序基因分型
3.2 不同山羊所有位點(diǎn)等位基因及基因型頻率
3.3 血常規(guī)測定結(jié)果
3.4 血液基因組DNA提取結(jié)果
3.5 三個(gè)品種山羊的所有位點(diǎn)多態(tài)性分析
3.5.1 三個(gè)品種山羊的所有位點(diǎn)遺傳變異統(tǒng)計(jì)值
3.5.2 三個(gè)品種山羊的所有位點(diǎn)雜合度統(tǒng)計(jì)值
3.5.3 三個(gè)品種山羊的所有位點(diǎn)F-統(tǒng)計(jì)量和基因流統(tǒng)計(jì)值
3.5.4 三個(gè)品種山羊之間Nei氏遺傳相似度和遺傳距離
3.6 不同因素與各項(xiàng)血液指標(biāo)之間的顯著性分析
3.7 品種和年齡與不同位點(diǎn)兩兩交互作用與各項(xiàng)血液指標(biāo)之間的顯著性分析
4 討論
4.1 篩選目的片段
4.2 不同山羊?qū)ρ虬W病的易感性
4.3 不同山羊品種內(nèi)與品種間的遺傳距離
4.4 血液免疫指標(biāo)與機(jī)體抗病力的關(guān)系
4.5 不同因素與血液免疫指標(biāo)的關(guān)系
5 結(jié)論
6 創(chuàng)新點(diǎn)
參考文獻(xiàn)
致謝
本文編號(hào):4036770
【文章頁數(shù)】:74 頁
【學(xué)位級別】:碩士
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英文縮略詞
中文摘要
ABSTRACT
1 前言
1.1 魯波山羊、嶗山奶山羊和萊蕪黑山羊的特點(diǎn)
1.1.1 魯波山羊的特點(diǎn)
1.1.2 嶗山奶山羊的特點(diǎn)
1.1.3 萊蕪黑山羊的特點(diǎn)
1.1.4 魯波山羊、嶗山奶山羊和萊蕪黑山羊的抗病性狀
1.2 PRNP基因的研究進(jìn)展
1.3 朊蛋白
1.3.1 朊蛋白基因和蛋白的結(jié)構(gòu)
1.3.2 朊蛋白基因的表達(dá)調(diào)控
1.4 PRNP基因與山羊、綿羊癢病
1.4.1 癢病研究進(jìn)展
1.4.2 PRNP基因與綿羊癢病
1.4.3 PRNP基因與山羊癢病
1.5 目的意義
2 材料與方法
2.1 試驗(yàn)材料
2.1.1 試驗(yàn)樣品的采集
2.1.2 試驗(yàn)儀器設(shè)備
2.1.3 試驗(yàn)試劑及來源
2.1.4 主要數(shù)據(jù)庫及生物學(xué)軟件
2.1.5 常用試劑配制
2.2 試驗(yàn)方法
2.2.1 血常規(guī)的測定
2.2.2 血液基因組DNA的提取
2.2.3 PRNP基因的克隆及多態(tài)性分析
3 結(jié)果與分析
3.1 混池測序結(jié)果以及基因分型
3.1.1 混池測序結(jié)果
3.1.2 混池測序基因分型
3.2 不同山羊所有位點(diǎn)等位基因及基因型頻率
3.3 血常規(guī)測定結(jié)果
3.4 血液基因組DNA提取結(jié)果
3.5 三個(gè)品種山羊的所有位點(diǎn)多態(tài)性分析
3.5.1 三個(gè)品種山羊的所有位點(diǎn)遺傳變異統(tǒng)計(jì)值
3.5.2 三個(gè)品種山羊的所有位點(diǎn)雜合度統(tǒng)計(jì)值
3.5.3 三個(gè)品種山羊的所有位點(diǎn)F-統(tǒng)計(jì)量和基因流統(tǒng)計(jì)值
3.5.4 三個(gè)品種山羊之間Nei氏遺傳相似度和遺傳距離
3.6 不同因素與各項(xiàng)血液指標(biāo)之間的顯著性分析
3.7 品種和年齡與不同位點(diǎn)兩兩交互作用與各項(xiàng)血液指標(biāo)之間的顯著性分析
4 討論
4.1 篩選目的片段
4.2 不同山羊?qū)ρ虬W病的易感性
4.3 不同山羊品種內(nèi)與品種間的遺傳距離
4.4 血液免疫指標(biāo)與機(jī)體抗病力的關(guān)系
4.5 不同因素與血液免疫指標(biāo)的關(guān)系
5 結(jié)論
6 創(chuàng)新點(diǎn)
參考文獻(xiàn)
致謝
本文編號(hào):4036770
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