發(fā)布時(shí)間：2017-05-26 04:09

  本文關(guān)鍵詞：基于ndhF序列的中國懸鉤子屬植物系統(tǒng)發(fā)育初步研究，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：懸鉤子屬(Rubus L.),又名樹莓屬,隸屬薔薇科(Rosaceae) 。中國作為懸鉤子屬植物的起源和重要分布中心之一,有201種,98變種,其中特有種138種。樹莓是懸鉤子屬植物中果實(shí)可食用的用于園藝栽培的特色果樹種類,在中國野生樹莓資源極其豐富。但由于該屬在植物分類上存在較多的分歧,給野生樹莓種質(zhì)鑒定和評價(jià)帶來了極大的困難。只有明晰其相關(guān)類群系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系才可能從根本上解決這些問題。目前,細(xì)胞學(xué)手段已經(jīng)顯得捉襟見肘,而分子系統(tǒng)學(xué)手段在該領(lǐng)域中的應(yīng)用存在諸多空白或不足。本研究正是基于此,立足中國懸鉤子屬,側(cè)重優(yōu)良野生樹莓集中的空心莓組和木莓組,利用及進(jìn)化速率較快的葉綠體基因編碼區(qū)ndhF序列,評價(jià)其在該屬中的進(jìn)化和系統(tǒng)學(xué)價(jià)值,構(gòu)建支持率較高的中國懸鉤子屬植物的分子系統(tǒng)樹,以期對該屬植物的系統(tǒng)發(fā)育和優(yōu)良野生樹莓種質(zhì)的分類和鑒定提供參考依據(jù)。主要結(jié)果如下：1葉綠體ndhF序列在中國懸鉤子屬植物中的系統(tǒng)應(yīng)用價(jià)值。所有供試材料的葉綠體ndhF序列經(jīng)過對比排列后長度為1182bp,GC含量為34.3%,AT含量為65.7%。以薔薇屬黃刺玫(Rosa xanthina)口草莓屬野草莓(Fragaria vesca)為外類群,對比排序后,共檢測到ndhF序列變異位點(diǎn)和信息位點(diǎn)分別為88個(gè)和47個(gè),占7.44%和3.97%�？招妮M材料ndhF序列變異率為4.8%,而木莓組和刺毛莓組序列變異率僅為1.2%�；趎dhF序列的系統(tǒng)樹,一致性指數(shù)CI和保留性指數(shù)RI值均較高,分支自展值和后驗(yàn)概率較高,系統(tǒng)樹的拓?fù)湎鄬Ψ�(wěn)定,對于所討論的問題有較高的支持度。2中國懸鉤子屬系統(tǒng)關(guān)系�；�56條ndhF序列構(gòu)建最大簡約法MP和貝葉斯推論BI系統(tǒng)樹表明,相較于外類群,中國懸鉤子屬植物為單系群。研究所涉及的空心莓組、木莓組和刺毛莓組材料分化較明顯,木莓組和刺毛莓組材料聚為一支,空心莓組材料則被劃分為幾支,呈現(xiàn)多系進(jìn)化現(xiàn)象。中國懸鉤子屬各組內(nèi)部所涉及材料并沒有完全按照形態(tài)學(xué)亞組的劃分進(jìn)行聚類,基于ndhF序列的聚類結(jié)果顯示各組材料相互交叉,其中以空心莓組內(nèi)部各組材料出現(xiàn)交叉最多,揭示出空心莓組內(nèi)部可能存在復(fù)雜的進(jìn)化關(guān)系。此外,橢圓懸鉤子與其變種以58%的自展支持率和96%的后驗(yàn)支持率聚在了一起,而不同采樣地的茅莓卻沒有聚在一起。
【關(guān)鍵詞】：中國懸鉤子 ndhF序列 空心莓組 木莓組 系統(tǒng)發(fā)育
【學(xué)位授予單位】：四川農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號】：S663.2
【目錄】：

• 摘要5-6
• Abstract6-8
• 縮略詞表8-11
• 1 引言11-24
• 1.1 懸鉤子屬植物簡介11-18
• 1.1.1 懸鉤子屬植物分類系統(tǒng)11-12
• 1.1.2 中國懸鉤子屬分類系統(tǒng)中的問題12-15
• 1.1.2.1 橢圓懸鉤子、栽秧泡和紅毛懸鉤子的分類處理和系統(tǒng)位置13
• 1.1.2.2 插田泡及其近緣種的分類處理13-14
• 1.1.2.3 其他14-15
• 1.1.3 懸鉤子屬植物系統(tǒng)發(fā)育、分類等相關(guān)研究進(jìn)展15-18
• 1.1.3.1 基于細(xì)胞學(xué)和分子細(xì)胞學(xué)工作的研究進(jìn)展15
• 1.1.3.2 DNA序列在懸鉤子屬系統(tǒng)研究中的應(yīng)用與發(fā)展15-18
• 1.2 植物分子系統(tǒng)學(xué)及其發(fā)展18-23
• 1.2.1 分子系統(tǒng)學(xué)18
• 1.2.2 DNA序列分析在植物分子系統(tǒng)學(xué)中的應(yīng)用18-19
• 1.2.3 植物分子系統(tǒng)學(xué)研究中常用的DNA序列19-23
• 1.2.3.1 葉綠體基因DNA(cpDNA)19-20
• 1.2.3.2 核基因組(nDNA)20-23
• 1.2.3.3 線粒體基因組(mtDNA)23
• 1.3 本研究的目的和意義23-24
• 2 材料與方法24-29
• 2.1 樣本采集24
• 2.2 外類群的選擇24-27
• 2.3 DNA提取27-28
• 2.4 PCR擴(kuò)增28
• 2.5 序列測定28
• 2.6 基因序列分析28-29
• 2.7 系統(tǒng)發(fā)育分析29
• 3 結(jié)果與分析29-38
• 3.1 PCR條件對懸鉤子屬植物ndhF序列擴(kuò)增的影響29-30
• 3.2 ndhF序列測序結(jié)果30-31
• 3.3 ndhF序列特點(diǎn)及分析31-32
• 3.4 替代模型選擇和參數(shù)估計(jì)32-33
• 3.5 系統(tǒng)發(fā)育分析33-38
• 4 討論與結(jié)論38-41
• 4.1 利用ndhF序列構(gòu)建中國懸鉤子屬植物系統(tǒng)進(jìn)化樹可行性分析38
• 4.2 基于ndhF序列的中國懸鉤子屬系統(tǒng)關(guān)系38-41
• 4.2.1 中國懸鉤子屬空心莓組和木莓組的系統(tǒng)關(guān)系38-39
• 4.2.2 基于ndhF序列結(jié)果與形態(tài)分類的比較39-40
• 4.2.3 中國懸鉤子屬種內(nèi)及種間關(guān)系40-41
• 5 小結(jié)與展望41-43
• 5.1 小結(jié)41-42
• 5.2 論文主要?jiǎng)?chuàng)新點(diǎn)42
• 5.3 展望42-43
• 參考文獻(xiàn)43-54
• 致謝54-55
• 攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文目錄55

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2 王鶯;傅賽紅;徐壽愛;焦和玉;;遂昌縣懸鉤子屬植物資源及其開發(fā)利用[J];現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技;2012年02期

3 姚德生;懸鉤子屬植物亟待開發(fā)利用[J];中國水土保持;1987年12期

4 田春元,姜益泉,吳金清;河南雞公山國家級自然保護(hù)區(qū)懸鉤子屬植物資源開發(fā)利用研究[J];武漢植物學(xué)研究;2003年06期

5 宣景宏;張春艷;孟憲軍;劉春菊;;懸鉤子屬植物種質(zhì)資源開發(fā)利用研究進(jìn)展[J];北方園藝;2006年05期

6 和加衛(wèi);楊正松;唐開學(xué);李燕;楊燕林;王朝文;楊洪濤;;滇西北懸鉤子屬植物資源的調(diào)查[J];園藝學(xué)報(bào);2008年07期

7 楊燕林;唐開學(xué);和加衛(wèi);朱映安;和志嬌;楊正松;;懸鉤子屬植物分子標(biāo)記技術(shù)和基因組研究進(jìn)展[J];中國農(nóng)學(xué)通報(bào);2008年08期

8 萬靜;周蘭英;向倩;王淑華;金銀春;蒲光蘭;張旭;;懸鉤子屬植物系統(tǒng)分類學(xué)研究綜述[J];安徽農(nóng)業(yè)科學(xué);2010年10期

9 鄧維明;;山西省懸鉤子屬植物資源種類與分布[J];中國園藝文摘;2011年08期

10 王鵬霄;程許娜;蘇金樂;;內(nèi)鄉(xiāng)寶天曼自然保護(hù)區(qū)懸鉤子屬植物資源狀況及經(jīng)濟(jì)價(jià)值分析[J];西部林業(yè)科學(xué);2011年04期

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1 李維林;;中國懸鉤子屬植物資源[A];第六屆全國系統(tǒng)與進(jìn)化植物學(xué)青年學(xué)術(shù)研討會(huì)論文摘要集[C];2000年

2 柴偉;王祝舉;唐力英;;懸鉤子屬植物的化學(xué)成分和藥理研究進(jìn)展[A];中華中醫(yī)藥學(xué)會(huì)中藥炮制分會(huì)2008年學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2008年

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本文編號：395717