發(fā)布時(shí)間：2024-03-23 05:07

　　水稻作為主要的糧食作物,是全球二分之一以上人口的主糧。在保證水稻產(chǎn)量的基礎(chǔ)上,培育出品質(zhì)優(yōu)良的水稻品種是目前育種的主要目標(biāo)。水稻粒型作為決定水稻產(chǎn)量與品質(zhì)的重要農(nóng)藝性狀,已成為研究的焦點(diǎn)。雖然已經(jīng)有部分水稻粒型相關(guān)基因被克隆,但是大多數(shù)研究只關(guān)注于單一基因的功能,而忽視了不同基因功能變異之間互作關(guān)系。本實(shí)驗(yàn)基于1488份野生稻品種和全世界的代表性水稻全基因組深度測(cè)序,提取控制水稻粒型的187個(gè)已克隆基因與水稻長(zhǎng)、寬、長(zhǎng)寬比和千粒重等粒型形態(tài)數(shù)據(jù)進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,篩選顯著性關(guān)聯(lián)位點(diǎn),結(jié)合群體遺傳學(xué)分析,選擇水稻馴化和育種中受到選擇的基因,解析粒型基因的連鎖關(guān)系和形態(tài)效應(yīng),從而闡明粒型復(fù)雜調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。從基因互作的角度解析水稻長(zhǎng)、寬、長(zhǎng)寬比和千粒重多樣性的遺傳基礎(chǔ),主要研究結(jié)果如下:1.Structure、PCA和NJ等群體遺傳結(jié)構(gòu)分析表明,1488份世界有代表性的水稻及野生稻資源可以分成秈稻、粳稻和野生稻,其中野生稻包含1個(gè)居群,粳稻群體包含2個(gè)居群,秈稻群體包含5個(gè)居群。2.水稻粒型表型分析結(jié)果顯示水稻粒型在秈稻、粳稻兩個(gè)栽培稻群體中有明顯差異,不同年代的品種也在兩秈稻、粳稻群體中也呈現(xiàn)出不同...

【文章頁(yè)數(shù)】：67 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖1實(shí)驗(yàn)材料地理分布圖

基于GWAS解析水稻粒型變異的遺傳基礎(chǔ)6第二章材料與方法2.1實(shí)驗(yàn)材料本實(shí)驗(yàn)選取了世界范圍內(nèi)具有代表性的栽培稻品種和野生近緣種共1488份，并對(duì)這些材料進(jìn)行處理分析，其中秈稻（Oryzasativassp.indica）917份、粳稻（Oryzasativassp.japonic....

圖2栽培稻和野生近緣種的居群結(jié)構(gòu)圖

基于GWAS解析水稻粒型變異的遺傳基礎(chǔ)19第三章結(jié)果與分析3.1水稻及其近緣野生種的群體遺傳結(jié)構(gòu)研究3.1.1群體結(jié)構(gòu)分析采用栽培稻和野生稻的全基因組SNP數(shù)據(jù)，通過(guò)Admixture軟件分析栽培稻及其近緣野生種的群體遺傳結(jié)構(gòu)。我們關(guān)注了k=2~10九種情況下的群體遺傳結(jié)構(gòu)，并結(jié)....

圖3基于水稻基因組單核苷酸多態(tài)性的主成分分析圖

基于GWAS解析水稻粒型變異的遺傳基礎(chǔ)21圖3基于水稻基因組單核苷酸多態(tài)性的主成分分析圖Fig.3ThePCAanalysisofricegenomesinglenucleotidepolymorphism注：圖A~C是PC1、PC2、PC3主成分之間的二維關(guān)系圖，圖D是三個(gè)主成....

圖4栽培稻與野生近緣種進(jìn)化樹

基于GWAS解析水稻粒型變異的遺傳基礎(chǔ)223.1.3鄰接法鄰接法（neighbor-joining,NJ）是一種利用進(jìn)化距離建樹的方法，基于最小進(jìn)化原理，將遺傳關(guān)系近的樣本聚集在一起，且待合并的樣本進(jìn)化距離要大于已合并的材料，是一種運(yùn)算速度較快的建樹方法[63]。圖4栽培稻與野生....

本文編號(hào)：3935506