茶樹“信陽10號”生態(tài)休眠不同階段的蛋白質(zhì)組學(xué)研究
發(fā)布時間:2022-12-23 00:32
茶樹是多年生木本植物,在其生命周期中會不斷遭遇到惡劣環(huán)境條件,比如寒冷的冬季。已有研究表明,休眠在茶樹等多年生植物的越冬過程中起著重要作用,而茶樹,由于其市場特性,在保證產(chǎn)量的前提下,越早發(fā)芽,越早上市,則可以獲得越多的經(jīng)濟效益。因此研究茶樹越冬芽的休眠機制,具有重要生物學(xué)意義和突出的經(jīng)濟效益。目前關(guān)于茶樹休眠的研究在轉(zhuǎn)錄組方面比較成熟,而蛋白質(zhì)組學(xué)研究還不夠深入。本研究對茶樹蛋白質(zhì)組學(xué)的基本概念、研究方法及其休眠機制等方面的進展進行綜述,并進行高效的蛋白樣品制備、質(zhì)譜技術(shù)鑒定和差異表達蛋白分析,印證了茶樹休眠的調(diào)控過程與基因表達機制的統(tǒng)一性,補充了現(xiàn)有的茶樹休眠蛋白質(zhì)組學(xué)的理論研究,為進一步探索植物休眠的代謝通路提供了參考依據(jù)。根據(jù)前人研究,本實驗在2018年10月28日、11月26日和2019年1月28日、2月26日取4組樣品。采用Label free定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),研究了茶樹生態(tài)休眠時期的蛋白質(zhì)組的變化。共鑒定到蛋白質(zhì)4599個,其中有3541個蛋白質(zhì)是共有的。剛進入休眠的11月26日實驗組中有61個特有蛋白質(zhì),破除休眠的2月26日實驗組中有55個獨特的蛋白質(zhì),這些差異蛋白的...
【文章頁數(shù)】:64 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第1章 引言
1.1 研究目的及意義
1.2 研究內(nèi)容
1.3 研究方法
第2章 文獻綜述
2.1 茶樹相關(guān)介紹
2.1.1 茶樹的起源
2.1.2 茶樹的功效
2.1.3 信陽10 號的生物學(xué)特性
2.2 茶樹芽休眠及影響因素
2.2.1 芽休眠的分類
2.2.2 芽休眠影響因素
2.2.3 芽休眠調(diào)控的分子機制
2.2.4 芽休眠研究進展
2.2.5 展望
2.3 蛋白質(zhì)組的研究進展
2.3.1 蛋白質(zhì)組學(xué)的背景及意義
2.3.2 蛋白質(zhì)組學(xué)的主要內(nèi)容
2.3.3 茶樹蛋白質(zhì)組學(xué)發(fā)展背景
2.3.4 在茶樹抗寒研究中的應(yīng)用
2.3.5 茶樹蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)體系建立
2.3.6 研究瓶頸和發(fā)展前景
第3章 材料與方法
3.1 原料采集
3.2 樣本標記信息
3.3 蛋白質(zhì)提取和肽段酶解
3.4 LC-MS/MS數(shù)據(jù)采集
3.5 蛋白質(zhì)鑒定和定量分析
3.6 生物信息學(xué)分析
3.7 核心實驗方法介紹
3.7.1 Label free實驗
3.7.2 質(zhì)量控制
3.7.3 鑒定蛋白質(zhì)和肽段特性描述
3.8 數(shù)據(jù)庫介紹
3.8.1 NR數(shù)據(jù)庫
3.8.2 UniProt數(shù)據(jù)庫
3.8.3 GO數(shù)據(jù)庫
3.8.4 KEGG通路數(shù)據(jù)庫
3.8.5 STRING數(shù)據(jù)庫
3.9 實驗分析流程
第4章 實驗結(jié)果與分析
4.1 蛋白質(zhì)鑒定結(jié)果匯總
4.2 差異表達蛋白質(zhì)篩選
4.3 差異表達蛋白質(zhì)聚類分析
4.4 差異表達蛋白質(zhì)GO功能富集分析
4.5 差異表達蛋白質(zhì)KEGG通路富集分析
4.6 黃酮類生物合成中的差異蛋白分析
4.7 差異蛋白互作網(wǎng)絡(luò)
第5章 結(jié)論
參考文獻
致謝
本文編號:3724353
【文章頁數(shù)】:64 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第1章 引言
1.1 研究目的及意義
1.2 研究內(nèi)容
1.3 研究方法
第2章 文獻綜述
2.1 茶樹相關(guān)介紹
2.1.1 茶樹的起源
2.1.2 茶樹的功效
2.1.3 信陽10 號的生物學(xué)特性
2.2 茶樹芽休眠及影響因素
2.2.1 芽休眠的分類
2.2.2 芽休眠影響因素
2.2.3 芽休眠調(diào)控的分子機制
2.2.4 芽休眠研究進展
2.2.5 展望
2.3 蛋白質(zhì)組的研究進展
2.3.1 蛋白質(zhì)組學(xué)的背景及意義
2.3.2 蛋白質(zhì)組學(xué)的主要內(nèi)容
2.3.3 茶樹蛋白質(zhì)組學(xué)發(fā)展背景
2.3.4 在茶樹抗寒研究中的應(yīng)用
2.3.5 茶樹蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)體系建立
2.3.6 研究瓶頸和發(fā)展前景
第3章 材料與方法
3.1 原料采集
3.2 樣本標記信息
3.3 蛋白質(zhì)提取和肽段酶解
3.4 LC-MS/MS數(shù)據(jù)采集
3.5 蛋白質(zhì)鑒定和定量分析
3.6 生物信息學(xué)分析
3.7 核心實驗方法介紹
3.7.1 Label free實驗
3.7.2 質(zhì)量控制
3.7.3 鑒定蛋白質(zhì)和肽段特性描述
3.8 數(shù)據(jù)庫介紹
3.8.1 NR數(shù)據(jù)庫
3.8.2 UniProt數(shù)據(jù)庫
3.8.3 GO數(shù)據(jù)庫
3.8.4 KEGG通路數(shù)據(jù)庫
3.8.5 STRING數(shù)據(jù)庫
3.9 實驗分析流程
第4章 實驗結(jié)果與分析
4.1 蛋白質(zhì)鑒定結(jié)果匯總
4.2 差異表達蛋白質(zhì)篩選
4.3 差異表達蛋白質(zhì)聚類分析
4.4 差異表達蛋白質(zhì)GO功能富集分析
4.5 差異表達蛋白質(zhì)KEGG通路富集分析
4.6 黃酮類生物合成中的差異蛋白分析
4.7 差異蛋白互作網(wǎng)絡(luò)
第5章 結(jié)論
參考文獻
致謝
本文編號:3724353
本文鏈接:http://sikaile.net/shoufeilunwen/zaizhiyanjiusheng/3724353.html
最近更新
教材專著