近年來研究表明,真菌小分子RNA（sRNA）可以跨界調(diào)控宿主植物使其致病。稻瘟病的致病因子——稻瘟菌（Magnaporthe oryzae）可通過附著孢貼附于水稻表面,產(chǎn)生入侵絲侵入到水稻組織內(nèi)從而引起疾病。然而,在目前已有的對于稻瘟菌致病性的研究中,人們對于稻瘟菌如何跨界調(diào)控水稻仍是了解甚少。因此,研究稻瘟菌在侵染過程中通過sRNA對水稻的跨物種調(diào)控作用,對于控制水稻病害和提高水稻產(chǎn)量具有重要的理論意義和實踐價值。本文基于稻瘟菌sRNA以及侵染后稻瘟菌—水稻的混合sRNA兩種高通量數(shù)據(jù),應(yīng)用多種機器學(xué)習(xí)算法分別構(gòu)建了基于單算法多數(shù)據(jù)集的預(yù)測模型和基于多算法多數(shù)據(jù)集的融合模型,分析了稻瘟菌sRNA在侵染后相較于侵染前的差異表達(dá)情況,發(fā)現(xiàn)有366種稻瘟菌sRNA的表達(dá)水平在侵染后明顯上調(diào)。針對差異表達(dá)sRNA的靶基因進(jìn)行功能富集分析,得到與水稻生長以及防御反應(yīng)相關(guān)的九個生物學(xué)過程和一個KEGG通路,這些功能對應(yīng)于十三個水稻基因。通過數(shù)據(jù)分析,本文共挖掘出十四個靶向這些水稻基因、影響水稻生長和防御從而致病的稻瘟菌sRNA,并在稻瘟菌sRNA的相關(guān)數(shù)據(jù)庫中驗證了它們的真實性,即這十四種稻瘟菌... 

【文章頁數(shù)】：58 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

miRNA形成過程示意圖

去接頭處理后長度分布示意圖

mapping匹配流程圖

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]外源水楊酸對稻瘟病菌效應(yīng)蛋白BAS4過表達(dá)菌株耐受性的影響[J]. 王云鋒,王春梅,王長秘,張婭玲,劉林,李成云,楊靜.  南方農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2017(12)
[2]基于高通量數(shù)據(jù)的人體外源性植物miRNA跨界調(diào)控建模[J]. 張浩,占萌蘋,郭劉香,李誌,劉元寧,張春鶴,常浩武,王志強.  吉林大學(xué)學(xué)報(工學(xué)版). 2018(04)
[3]酸堿度對稻瘟病菌BAS4過表達(dá)菌株耐受性的影響[J]. 王長秘,王春梅,王云鋒,劉林,劉艷琴,李成云,楊靜.  南方農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2017(10)
[4]谷瘟病菌生理小種鑒別及谷子標(biāo)準(zhǔn)品種體系的構(gòu)建[J]. 李志江,賈冠清,李祥羽,李易初,馬金豐,智慧,湯沙,張碩,柴楊,李艷東,刁現(xiàn)民.  中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(17)
[5]稻瘟病菌群體結(jié)構(gòu)的研究進(jìn)展[J]. 任林柱,白容霖.  吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2002(02)



本文編號：3691517