番茄AP2/ERF超家族重鑒定及SlERF.D.3基因的功能研究
發(fā)布時(shí)間:2022-02-26 17:19
番茄(Solanum lycopersicum)以其果實(shí)具有豐富的營(yíng)養(yǎng)價(jià)值和獨(dú)特的風(fēng)味而深受人們喜愛(ài),是被廣泛種植的蔬菜之一。ERF轉(zhuǎn)錄因子家族屬于AP2/ERF超家族,研究表明其廣泛參與了植物的生長(zhǎng)發(fā)育、激素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和脅迫應(yīng)答等過(guò)程;诜鸦蚪M測(cè)序的完成,已有學(xué)者對(duì)番茄AP2/ERF超家族進(jìn)行了家族鑒定,但隨著番茄基因組數(shù)據(jù)庫(kù)的更新,更全面地鑒定番茄AP2/ERF超家族成員,豐富其成員信息,對(duì)挖掘未知基因的功能具有重要意義。本研究對(duì)番茄AP2/ERF超家族成員進(jìn)行了更新,對(duì)ERF家族基因進(jìn)行了染色體定位、保守基序、基因結(jié)構(gòu)、啟動(dòng)子順式作用元件及其對(duì)灰霉菌和生長(zhǎng)素處理響應(yīng)的分析,并進(jìn)一步通過(guò)番茄轉(zhuǎn)基因材料對(duì)SlERF.D.3基因進(jìn)行了功能鑒定,具體結(jié)果如下:經(jīng)生物信息學(xué)分析,本文共鑒定到176個(gè)AP2/ERF超家族成員,其中ERF家族基因共141個(gè),新鑒定到的ERF亞家族成員有42個(gè);這些新基因在除7號(hào)染色體外的其他染色體上均有分布,其中有19個(gè)基因只含外顯子而無(wú)內(nèi)含子;利用進(jìn)化關(guān)系并結(jié)合啟動(dòng)子順式作用元件預(yù)測(cè),在番茄ERF家族基因中篩選出19個(gè)可能與脅迫響應(yīng)相關(guān)的基因并在灰霉菌和...
【文章來(lái)源】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省
【文章頁(yè)數(shù)】:71 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
符號(hào)說(shuō)明
中文摘要
Abstract
1 前言
1.1 研究目的及意義
1.2 國(guó)內(nèi)外研究進(jìn)展
1.2.1 AP2/ERF轉(zhuǎn)錄因子超家族簡(jiǎn)介
1.2.2 AP2/ERF轉(zhuǎn)錄因子功能研究進(jìn)展
1.2.3 植物激素對(duì)果實(shí)發(fā)育和單性結(jié)實(shí)影響的研究
1.2.4 單性結(jié)實(shí)相關(guān)基因的研究進(jìn)展
1.3 研究?jī)?nèi)容及技術(shù)路線
2 材料與方法
2.1 試驗(yàn)材料
2.1.1 植物材料
2.1.2 菌株及質(zhì)粒
2.1.3 試劑及設(shè)備
2.1.4 培養(yǎng)基的配制
2.2 試驗(yàn)方法
2.2.1 番茄AP2/ERF超家族生物信息學(xué)分析
2.2.2 SlERF.D.3 轉(zhuǎn)錄激活活性分析
2.2.3 番茄的處理及取樣
2.2.4 SlERF.D.3 過(guò)表達(dá)載體的構(gòu)建
2.2.5 SlERF.D.3 基因的遺傳轉(zhuǎn)化及轉(zhuǎn)基因驗(yàn)證
2.2.6 基因表達(dá)分析
2.2.7 高效液相色譜法測(cè)定內(nèi)源激素
2.2.8 果實(shí)品質(zhì)相關(guān)指標(biāo)的測(cè)定方法
2.2.9 數(shù)據(jù)處理
3 結(jié)果與分析
3.1 番茄AP2/ERF超家族重鑒定及生物信息學(xué)分析
3.1.1 番茄AP2/ERF家族成員鑒定及其分類
3.1.2 番茄ERF家族基因染色體定位信息分析
3.1.3 番茄ERF家族基因結(jié)構(gòu)和保守基序分析
3.1.4 番茄ERF家族基因啟動(dòng)子順式作用元件預(yù)測(cè)
3.1.5 番茄ERF家族基因在灰霉菌和IAA處理下的表達(dá)分析
3.2 SlERF.D.3 蛋白結(jié)構(gòu)和亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)
3.2.1 SlERF.D.3 蛋白的理化性質(zhì)分析
3.2.2 SlERF.D.3 蛋白的二級(jí)和三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
3.2.3 SlERF.D.3 蛋白的亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)
3.3 SlERF.D.3 轉(zhuǎn)錄因子具有轉(zhuǎn)錄激活活性
3.4 SlERF.D.3 基因的組織表達(dá)特性分析
3.5 SlERF.D.3 基因在不同激素處理下的表達(dá)模式
3.6 SlERF.D.3 基因過(guò)表達(dá)載體的構(gòu)建及遺傳轉(zhuǎn)化
3.6.1 SlERF.D.3 基因過(guò)表達(dá)載體的構(gòu)建
3.6.2 SlERF.D.3 基因的遺傳轉(zhuǎn)化
3.6.3 過(guò)表達(dá)植株的轉(zhuǎn)基因驗(yàn)證
3.6.4 過(guò)表達(dá)株系的表達(dá)量檢測(cè)
3.7 過(guò)表達(dá)SlERF.D.3 株系的表型鑒定
3.7.1 過(guò)表達(dá)SlERF.D.3 基因影響了葉片發(fā)育
3.7.2 過(guò)表達(dá)SlERF.D.3 植株的花與果實(shí)性狀的觀察
3.8 SlERF.D.3 是單性結(jié)實(shí)相關(guān)基因
3.8.1 過(guò)表達(dá)SlERF.D.3 基因提高了生長(zhǎng)素含量
3.8.2 過(guò)表達(dá)SlERF.D.3 基因促進(jìn)了單性結(jié)實(shí)和果實(shí)發(fā)育相關(guān)基因的表達(dá)
3.8.3 過(guò)表達(dá)SlERF.D.3 影響了GA合成基因的表達(dá)
3.9 過(guò)表達(dá)SlERF.D.3 對(duì)果實(shí)品質(zhì)的影響
4 討論
4.1 番茄ERF轉(zhuǎn)錄因子家族的生物信息學(xué)及表達(dá)分析
4.2 SlERF.D.3 基因的表達(dá)特性分析
4.3 過(guò)表達(dá)SlERF.D.3 基因?qū)Ψ讶~片形態(tài)的影響
4.4 過(guò)表達(dá)SlERF.D.3對(duì)GA合成基因的影響
5 結(jié)論
6 參考文獻(xiàn)
7 附錄
8 致謝
9 攻讀學(xué)位期間發(fā)表論文情況
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]植物AP2/ERF轉(zhuǎn)錄因子家族的研究進(jìn)展[J]. 張麒,陳靜,李俐,趙明珠,張美萍,王義. 生物技術(shù)通報(bào). 2018(08)
[2]番茄單性結(jié)實(shí)研究進(jìn)展[J]. 張少麗,邵景成,胡志峰,魏兵強(qiáng). 園藝學(xué)報(bào). 2016(01)
[3]單性結(jié)實(shí)的分子研究進(jìn)展[J]. 涂冬萍,馬小軍,莫長(zhǎng)明,潘麗梅,馮世鑫,黃杰. 中草藥. 2014(20)
[4]植物果實(shí)發(fā)育調(diào)控的分子機(jī)理研究進(jìn)展[J]. 蔣勵(lì),張小蘭. 中國(guó)蔬菜. 2013(06)
[5]生長(zhǎng)素結(jié)合蛋白cDNA的克隆及其在黃瓜中的表達(dá)[J]. 白吉?jiǎng)?宋明,劉佩瑛,張盛林,王中鳳. 植物學(xué)通報(bào). 2002(06)
[6]果實(shí)專一性啟動(dòng)子驅(qū)動(dòng)ipt基因在番茄中的表達(dá)及其對(duì)番茄果實(shí)發(fā)育的影響[J]. 毛自朝,于秋菊,甄偉,郭俊毅,胡鳶雷,高音,林忠平. 科學(xué)通報(bào). 2002(06)
[7]園藝作物單性結(jié)實(shí)的類型[J]. 陳學(xué)好,陶俊,曹碚生. 生物學(xué)通報(bào). 2001(09)
[8]番茄單性結(jié)果與內(nèi)源激素的關(guān)系[J]. 戴惠學(xué). 長(zhǎng)江蔬菜. 1998(07)
[9]單性結(jié)實(shí)與激素[J]. 邱似德. 植物生理學(xué)通訊. 1984(02)
本文編號(hào):3644849
【文章來(lái)源】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省
【文章頁(yè)數(shù)】:71 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
符號(hào)說(shuō)明
中文摘要
Abstract
1 前言
1.1 研究目的及意義
1.2 國(guó)內(nèi)外研究進(jìn)展
1.2.1 AP2/ERF轉(zhuǎn)錄因子超家族簡(jiǎn)介
1.2.2 AP2/ERF轉(zhuǎn)錄因子功能研究進(jìn)展
1.2.3 植物激素對(duì)果實(shí)發(fā)育和單性結(jié)實(shí)影響的研究
1.2.4 單性結(jié)實(shí)相關(guān)基因的研究進(jìn)展
1.3 研究?jī)?nèi)容及技術(shù)路線
2 材料與方法
2.1 試驗(yàn)材料
2.1.1 植物材料
2.1.2 菌株及質(zhì)粒
2.1.3 試劑及設(shè)備
2.1.4 培養(yǎng)基的配制
2.2 試驗(yàn)方法
2.2.1 番茄AP2/ERF超家族生物信息學(xué)分析
2.2.2 SlERF.D.3 轉(zhuǎn)錄激活活性分析
2.2.3 番茄的處理及取樣
2.2.4 SlERF.D.3 過(guò)表達(dá)載體的構(gòu)建
2.2.5 SlERF.D.3 基因的遺傳轉(zhuǎn)化及轉(zhuǎn)基因驗(yàn)證
2.2.6 基因表達(dá)分析
2.2.7 高效液相色譜法測(cè)定內(nèi)源激素
2.2.8 果實(shí)品質(zhì)相關(guān)指標(biāo)的測(cè)定方法
2.2.9 數(shù)據(jù)處理
3 結(jié)果與分析
3.1 番茄AP2/ERF超家族重鑒定及生物信息學(xué)分析
3.1.1 番茄AP2/ERF家族成員鑒定及其分類
3.1.2 番茄ERF家族基因染色體定位信息分析
3.1.3 番茄ERF家族基因結(jié)構(gòu)和保守基序分析
3.1.4 番茄ERF家族基因啟動(dòng)子順式作用元件預(yù)測(cè)
3.1.5 番茄ERF家族基因在灰霉菌和IAA處理下的表達(dá)分析
3.2 SlERF.D.3 蛋白結(jié)構(gòu)和亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)
3.2.1 SlERF.D.3 蛋白的理化性質(zhì)分析
3.2.2 SlERF.D.3 蛋白的二級(jí)和三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
3.2.3 SlERF.D.3 蛋白的亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)
3.3 SlERF.D.3 轉(zhuǎn)錄因子具有轉(zhuǎn)錄激活活性
3.4 SlERF.D.3 基因的組織表達(dá)特性分析
3.5 SlERF.D.3 基因在不同激素處理下的表達(dá)模式
3.6 SlERF.D.3 基因過(guò)表達(dá)載體的構(gòu)建及遺傳轉(zhuǎn)化
3.6.1 SlERF.D.3 基因過(guò)表達(dá)載體的構(gòu)建
3.6.2 SlERF.D.3 基因的遺傳轉(zhuǎn)化
3.6.3 過(guò)表達(dá)植株的轉(zhuǎn)基因驗(yàn)證
3.6.4 過(guò)表達(dá)株系的表達(dá)量檢測(cè)
3.7 過(guò)表達(dá)SlERF.D.3 株系的表型鑒定
3.7.1 過(guò)表達(dá)SlERF.D.3 基因影響了葉片發(fā)育
3.7.2 過(guò)表達(dá)SlERF.D.3 植株的花與果實(shí)性狀的觀察
3.8 SlERF.D.3 是單性結(jié)實(shí)相關(guān)基因
3.8.1 過(guò)表達(dá)SlERF.D.3 基因提高了生長(zhǎng)素含量
3.8.2 過(guò)表達(dá)SlERF.D.3 基因促進(jìn)了單性結(jié)實(shí)和果實(shí)發(fā)育相關(guān)基因的表達(dá)
3.8.3 過(guò)表達(dá)SlERF.D.3 影響了GA合成基因的表達(dá)
3.9 過(guò)表達(dá)SlERF.D.3 對(duì)果實(shí)品質(zhì)的影響
4 討論
4.1 番茄ERF轉(zhuǎn)錄因子家族的生物信息學(xué)及表達(dá)分析
4.2 SlERF.D.3 基因的表達(dá)特性分析
4.3 過(guò)表達(dá)SlERF.D.3 基因?qū)Ψ讶~片形態(tài)的影響
4.4 過(guò)表達(dá)SlERF.D.3對(duì)GA合成基因的影響
5 結(jié)論
6 參考文獻(xiàn)
7 附錄
8 致謝
9 攻讀學(xué)位期間發(fā)表論文情況
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]植物AP2/ERF轉(zhuǎn)錄因子家族的研究進(jìn)展[J]. 張麒,陳靜,李俐,趙明珠,張美萍,王義. 生物技術(shù)通報(bào). 2018(08)
[2]番茄單性結(jié)實(shí)研究進(jìn)展[J]. 張少麗,邵景成,胡志峰,魏兵強(qiáng). 園藝學(xué)報(bào). 2016(01)
[3]單性結(jié)實(shí)的分子研究進(jìn)展[J]. 涂冬萍,馬小軍,莫長(zhǎng)明,潘麗梅,馮世鑫,黃杰. 中草藥. 2014(20)
[4]植物果實(shí)發(fā)育調(diào)控的分子機(jī)理研究進(jìn)展[J]. 蔣勵(lì),張小蘭. 中國(guó)蔬菜. 2013(06)
[5]生長(zhǎng)素結(jié)合蛋白cDNA的克隆及其在黃瓜中的表達(dá)[J]. 白吉?jiǎng)?宋明,劉佩瑛,張盛林,王中鳳. 植物學(xué)通報(bào). 2002(06)
[6]果實(shí)專一性啟動(dòng)子驅(qū)動(dòng)ipt基因在番茄中的表達(dá)及其對(duì)番茄果實(shí)發(fā)育的影響[J]. 毛自朝,于秋菊,甄偉,郭俊毅,胡鳶雷,高音,林忠平. 科學(xué)通報(bào). 2002(06)
[7]園藝作物單性結(jié)實(shí)的類型[J]. 陳學(xué)好,陶俊,曹碚生. 生物學(xué)通報(bào). 2001(09)
[8]番茄單性結(jié)果與內(nèi)源激素的關(guān)系[J]. 戴惠學(xué). 長(zhǎng)江蔬菜. 1998(07)
[9]單性結(jié)實(shí)與激素[J]. 邱似德. 植物生理學(xué)通訊. 1984(02)
本文編號(hào):3644849
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