發(fā)布時間：2022-02-26 13:59

　　朱砂根（Ardisia crenata sim）為紫金�？谱辖鹋僦参�,是我國傳統(tǒng)的觀賞藥用植物,無論從觀賞價值,藥用保健價值還是生態(tài)用途以及經(jīng)濟價值都極具開發(fā)利用的潛力。藥用植物功能基因組學的主要內(nèi)容就是闡明藥用植物生物活性成分的次生代謝過程及其調(diào)控的方式,本研究將以目前最新的測序平臺（Illumina公司的HiSeq2500測序平臺）為基礎(chǔ),利用水楊酸（SA）和茉莉酸甲酯（MJ）處理朱砂根盆栽五年生苗,得到次級代謝產(chǎn)物三萜皂苷含量差異較大的朱砂根,之后對其進行高通量轉(zhuǎn)錄組測序,并做功能基因組學方面的研究。從生物信息學的角度,以各個數(shù)據(jù)庫為依托,以各種分析軟件為手段,對朱砂根及其與三萜皂苷合成途徑相關(guān)的基因進行更深入微觀的了解,構(gòu)建的文庫信息以及得到的與三萜皂苷合成相關(guān)的差異基因,為后續(xù)從基因調(diào)控和轉(zhuǎn)基因方面使藥用成分三萜皂苷含量穩(wěn)定提高,奠定堅實的基礎(chǔ),于朱砂根及其相近屬藥用價值的深度開發(fā)具有重要的作用。朱砂根轉(zhuǎn)錄組測序的研究,得到以下結(jié)論：1.通過對2個差異樣品M1和S1（經(jīng)SA和MJ處理后得到的三萜皂苷含量差異較大的兩個實驗材料）進行測序,共獲得12.06Gb Clean Da... 

【文章來源】：四川農(nóng)業(yè)大學四川省211工程院校

【文章頁數(shù)】：66 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
中文摘要
Abstract
1 前言
    1.1 研究目的與意義
    1.2 文獻綜述
        1.2.1 朱砂根的研究現(xiàn)狀
        1.2.2 次生代謝產(chǎn)物三萜皂苷的研究現(xiàn)狀
        1.2.3 轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)
        1.2.4 生物信息學分析
2 研究材料與方法
    2.1 研究材料
    2.2 技術(shù)路線
    2.3 主要儀器與試劑
    2.4 研究方法
        2.4.1 朱砂根材料處理
        2.4.2 高效液相色譜法測朱砂根三萜皂苷含量
        2.4.3 朱砂根總RNA的提取方法
        2.4.4 轉(zhuǎn)錄組測序
        2.4.5 生物信息學分析
3 研究結(jié)果與分析
    3.1 朱砂根三萜皂苷含量的測定
    3.2 轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果
        3.2.1 測序數(shù)據(jù)產(chǎn)出統(tǒng)計與組裝統(tǒng)計
        3.2.2 轉(zhuǎn)錄組測序文庫質(zhì)量評估
        3.2.3 Unigene功能注釋
        3.2.4 基因結(jié)構(gòu)分析
        3.2.5 基因表達量分析
        3.2.6 差異表達分析
        3.2.7 差異表達基因功能注釋和富集分析
4 結(jié)論與討論
5 展望
6 參考文獻
7 致謝
8 附錄


【參考文獻】：
期刊論文
[1]高通量測序技術(shù)及其在農(nóng)業(yè)科學研究中的應(yīng)用[J]. 閆紹鵬,楊瑞華,冷淑嬌,王秋玉,周容濤.  中國農(nóng)學通報. 2012(30)
[2]高通量轉(zhuǎn)錄組測序的數(shù)據(jù)分析與基因發(fā)掘[J]. 周華,張新,劉騰云,余發(fā)新.  江西科學. 2012(05)
[3]比色法測定朱砂根中三萜類成分的含量[J]. 王志平,段姚堯,劉占云,劉岱琳.  武警后勤學院學報(醫(yī)學版). 2012(03)
[4]植物激素對朱砂根愈傷組織生長的影響[J]. 何雪嬌,賴鐘雄.  江西農(nóng)業(yè)學報. 2012(01)
[5]朱砂根愈傷組織培養(yǎng)及懸浮細胞系建立[J]. 鄧素芳,楊旸,賴鐘雄.  熱帶亞熱帶植物學報. 2012(01)
[6]朱砂根成年莖段的離體培養(yǎng)研究[J]. 鄧素芳,楊旸,賴鐘雄.  福建農(nóng)業(yè)學報. 2011(03)
[7]朱砂根化學成分和藥理作用研究進展[J]. 張偉,李錕,李東,祁獻芳,康文藝.  中國實驗方劑學雜志. 2011(11)
[8]培養(yǎng)基類型、碳源對朱砂根愈傷組織生長的影響[J]. 何雪嬌,賴鐘雄.  福建熱作科技. 2010(04)
[9]五環(huán)三萜皂苷的合成途徑及生物活性研究進展[J]. 廖一帆.  湖北中醫(yī)學院學報. 2010(03)
[10]生物信息數(shù)據(jù)庫資源及其應(yīng)用[J]. 張桂榮.  河北科技師范學院學報(社會科學版). 2010(01)

博士論文
[1]基于EST數(shù)據(jù)庫和轉(zhuǎn)錄組測序的茶樹DNA分子標記開發(fā)與應(yīng)用研究[D]. 王麗鴛.中國農(nóng)業(yè)科學院 2011
[2]申克孢子絲菌酵母相和菌絲相cDNA消減文庫的構(gòu)建及差異表達基因的生物信息學分析[D]. 周汛.重慶醫(yī)科大學 2010

碩士論文
[1]二化螟神經(jīng)組織轉(zhuǎn)錄組分析與部分神經(jīng)肽及神經(jīng)肽受體的基因克隆[D]. 孫方達.浙江大學 2012



本文編號：3644619