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棉花逆境響應(yīng)相關(guān)NAC類轉(zhuǎn)錄因子的克隆與分析

發(fā)布時(shí)間:2017-05-13 05:11

  本文關(guān)鍵詞:棉花逆境響應(yīng)相關(guān)NAC類轉(zhuǎn)錄因子的克隆與分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:干旱、鹽、病害等逆境脅迫嚴(yán)重影響著植物正常的生長(zhǎng)發(fā)育,進(jìn)而制約著作物產(chǎn)量。植物在漫長(zhǎng)的進(jìn)化過(guò)程中,通過(guò)感知逆境信號(hào),調(diào)控抵御逆境的相關(guān)基因表達(dá)變化,形成了諸多在逆境脅迫下的保護(hù)機(jī)制。NAC轉(zhuǎn)錄因子為植物所特有,目前對(duì)擬南芥、水稻等植物NAC基因的研究表明,NAC基因在植物生長(zhǎng)發(fā)育,器官形成,植株衰老,激素信號(hào)傳導(dǎo)及逆境脅迫應(yīng)答中發(fā)揮著重要作用。目的:在亞洲棉全基因組中預(yù)測(cè)分析NAC基因,進(jìn)一步開(kāi)發(fā)棉花NAC基因資源;克隆獲得陸地棉NAC轉(zhuǎn)錄因子,研究其在干旱、鹽、病害等逆境脅迫下的表達(dá),分析其轉(zhuǎn)錄活性,為揭示棉花NAC轉(zhuǎn)錄因子在響應(yīng)逆境脅迫中的作用奠定基礎(chǔ)方法:利用生物信息學(xué)方法預(yù)測(cè)亞洲棉全基因組的NAC基因;采用RT-PCR方法克隆Gh SNAC5和Gh SNAC8基因;采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)分析基因在干旱、鹽、病害等逆境脅迫下的表達(dá);通過(guò)構(gòu)建酵母轉(zhuǎn)錄激活載體和亞細(xì)胞定位載體分析基因的轉(zhuǎn)錄因子活性;采用基因工程方法構(gòu)建Gh SNAC5和Gh SNAC8基因的植物表達(dá)載體;通過(guò)農(nóng)桿菌介導(dǎo)法轉(zhuǎn)化煙草。結(jié)果:在亞洲棉全基因組中預(yù)測(cè)了138個(gè)NAC基因,根據(jù)Ga NAC蛋白的序列相似性及系統(tǒng)進(jìn)化分析,將其分為11個(gè)亞家族,每個(gè)亞家族的Ga NAC蛋白數(shù)目為4-25個(gè);蚪Y(jié)構(gòu)分析發(fā)現(xiàn),63.7%的Ga NAC基因含有2個(gè)內(nèi)含子。Gh SNAC5基因的c DNA序列長(zhǎng)度為1080bp,其開(kāi)放閱讀框(ORF)編碼299個(gè)氨基酸。Gh SNAC8基因的c DNA序列長(zhǎng)度為1104bp,其開(kāi)放閱讀框(ORF)編碼349個(gè)氨基酸。2個(gè)基因所編碼的蛋白序列在N-末端均含有NAM保守域。對(duì)基因結(jié)構(gòu)分析發(fā)現(xiàn)Gh SNAC5和Gh SNAC8基因分別各含有3個(gè)外顯子2個(gè)內(nèi)含子,且內(nèi)含子具有典型的植物內(nèi)含子特征。利用熒光實(shí)時(shí)定量PCR分析了Gh SNAC5和Gh SNAC8基因受高鹽、干旱及黃萎病脅迫處理后的表達(dá)變化。結(jié)果顯示,Gh SNAC5和Gh SNAC8基因在受到干旱處理2h后,表達(dá)明顯上調(diào),24h后呈現(xiàn)下降態(tài)勢(shì);Gh SNAC5和Gh SNAC8基因在受到高鹽處理2h后,表達(dá)量明顯上調(diào)。Gh SNAC5基因在高鹽脅迫12h后,相對(duì)表達(dá)量上調(diào)了50倍,這說(shuō)明Gh SNAC5基因在響應(yīng)鹽脅迫時(shí),具有高表達(dá)性。Gh SNAC5和Gh SNAC8基因在受到黃萎病VD8處理6h后,相對(duì)表達(dá)量明顯上升,比受干旱及鹽處理的響應(yīng)時(shí)間要延后。通過(guò)構(gòu)建酵母轉(zhuǎn)錄激活載體對(duì)Gh SNAC5和Gh SNAC8基因的轉(zhuǎn)錄激活活性進(jìn)行了試驗(yàn),缺失培養(yǎng)生長(zhǎng)情況及β-gal顯色結(jié)果顯示,Gh SNAC5和Gh SNAC8基因均能轉(zhuǎn)錄激活下游基因的表達(dá)。利用p BI221-GFP載體將Gh SNAC5和Gh SNAC8與GFP構(gòu)建融合蛋白,瞬時(shí)表達(dá)試驗(yàn)結(jié)果顯示,Gh SNAC5和Gh SNAC8均定位與細(xì)胞核內(nèi)。利用p CAMBIA3301及p ROKⅡ構(gòu)建了一個(gè)新載體,與Gh SNAC5和Gh SNAC8基因重組構(gòu)建了植物過(guò)表達(dá)載體,并成功轉(zhuǎn)化至煙草。結(jié)論:通過(guò)比較亞洲棉與陸地棉、雷蒙德氏棉NAC蛋白的同源性,發(fā)現(xiàn)亞洲棉與雷蒙德氏棉NAC蛋白的匹配程度高于陸地棉,為亞洲棉及陸地棉NAC轉(zhuǎn)錄因子的后續(xù)深入研究提供了重要參考。本研究從陸地棉中克隆并分析了兩個(gè)NAC基因Gh SNAC5和Gh SNAC8,為Gh SNAC5和Gh SNAC8基因功能的深入研究奠定基礎(chǔ),并為棉花的遺傳改良提供了基因資源;
【關(guān)鍵詞】:棉花 NAC轉(zhuǎn)錄因子 克隆 表達(dá) 逆境脅迫
【學(xué)位授予單位】:石河子大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:S562;Q943.2
【目錄】:
  • 摘要5-6
  • Abstract6-9
  • 符號(hào)說(shuō)明9-10
  • 第一章 文獻(xiàn)綜述10-17
  • 1.1 NAC轉(zhuǎn)錄因子的研究進(jìn)展10-14
  • 1.1.1 NAC轉(zhuǎn)錄因子的發(fā)現(xiàn)10-11
  • 1.1.2 NAC轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)11
  • 1.1.3 NAC轉(zhuǎn)錄因子的作用機(jī)制11-12
  • 1.1.4 NAC基因的調(diào)控機(jī)制12
  • 1.1.5 NAC轉(zhuǎn)錄因子的功能研究進(jìn)展12-14
  • 1.2 棉花NAC轉(zhuǎn)錄因子的研究進(jìn)展14-15
  • 1.2.1 雷蒙德氏棉和亞洲棉NAC轉(zhuǎn)錄因子研究14-15
  • 1.2.2 陸地棉NAC轉(zhuǎn)錄因子研究15
  • 1.3 研究意義15-17
  • 第二章 亞洲棉全基因組NAC基因的預(yù)測(cè)及分析17-31
  • 2.1 試驗(yàn)材料17
  • 2.1.1 序列17
  • 2.1.2 主要生物軟件及網(wǎng)站17
  • 2.2 試驗(yàn)方法17-18
  • 2.2.1 亞洲棉NAC基因的鑒定17-18
  • 2.2.2 亞洲棉NAC基因系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)的構(gòu)建18
  • 2.2.3 miR164靶序列的預(yù)測(cè)18
  • 2.3 試驗(yàn)結(jié)果18-29
  • 2.3.1 亞洲棉NAC基因的鑒定18-20
  • 2.3.2 亞洲棉GaNAC基因結(jié)構(gòu)的分析20-25
  • 2.3.3 亞洲棉GaNAC蛋白的系統(tǒng)進(jìn)化分析25-26
  • 2.3.4 miR164靶基因的分析26-27
  • 2.3.5 GhSNAC5和GhSNAC8基因與138個(gè)GaNACs及78個(gè)GhNACs的比對(duì)27-29
  • 2.4 本章討論29-31
  • 第三章 棉花GhSNAC5和GhSNAC8基因的克隆及生物信息學(xué)分析31-40
  • 3.1 試驗(yàn)材料31-32
  • 3.1.1 植物材料與菌株31
  • 3.1.2 酶與試劑盒31
  • 3.1.3 培養(yǎng)基與試劑31-32
  • 3.1.4 主要儀器設(shè)備32
  • 3.1.5 引物序列32
  • 3.2 試驗(yàn)方法32-36
  • 3.2.1 RNA提取及反轉(zhuǎn)錄32-33
  • 3.2.2 DNA提取33-34
  • 3.2.3 目的基因的克隆34-35
  • 3.2.4 GhSNAC5和GhSNAC8基因生物生物信息學(xué)分析35-36
  • 3.3 試驗(yàn)結(jié)果36-38
  • 3.3.1 GhSNAC5和GhSNAC8基因的獲得36-37
  • 3.3.2 GhSNAC5和GhSNAC8基因的生物信息學(xué)分析37-38
  • 3.4 本章討論38-40
  • 第四章 GhSNAC5和GhSNAC8基因的轉(zhuǎn)錄因子性質(zhì)分析40-53
  • 4.1 試驗(yàn)材料40-42
  • 4.1.1 菌株和質(zhì)粒載體40
  • 4.1.2 酶及試驗(yàn)藥品40
  • 4.1.3 培養(yǎng)基40-41
  • 4.1.4 常用試劑41
  • 4.1.5 引物序列41-42
  • 4.2 試驗(yàn)方法42-47
  • 4.2.1 GhSNAC5和GhSNAC8轉(zhuǎn)錄激活試驗(yàn)42-44
  • 4.2.2 GhSNAC5和GhSNAC8基因亞細(xì)胞定位44-47
  • 4.3 試驗(yàn)結(jié)果47-52
  • 4.3.1 GhSNAC5和GhSNAC8基因轉(zhuǎn)錄激活活性分析47-50
  • 4.3.2 GhSNAC5和GhSNAC8基因亞細(xì)胞定位試驗(yàn)50-52
  • 4.4 本章討論52-53
  • 第五章 GhSNAC5和GhSNAC8基因的表達(dá)分析53-57
  • 5.1 試驗(yàn)材料53
  • 5.1.1 試驗(yàn)材料53
  • 5.1.2 藥品及試劑盒53
  • 5.1.3 引物53
  • 5.2 試驗(yàn)方法53-54
  • 5.2.1 棉花處理53-54
  • 5.2.2 RNA提取及反轉(zhuǎn)錄54
  • 5.2.3 實(shí)時(shí)熒光定量PCR54
  • 5.3 試驗(yàn)結(jié)果54-56
  • 5.3.1 黃萎病VD8侵染棉花幼苗的表型變化54-55
  • 5.3.2 GhSNAC5基因的表達(dá)量變化55
  • 5.3.3 GhSNAC8基因的表達(dá)量變化55-56
  • 5.4 本章討論56-57
  • 第六章 植物過(guò)表達(dá)載體的構(gòu)建及煙草轉(zhuǎn)化57-68
  • 6.1 試驗(yàn)材料57-59
  • 6.1.1 植物、菌株及載體57
  • 6.1.2 培養(yǎng)基57-58
  • 6.1.3 引物序列58-59
  • 6.2 試驗(yàn)方法59-62
  • 6.2.1 pCAMBIA3301及pROKⅡ構(gòu)建成一個(gè)新載體pCAMBIA3301new59
  • 6.2.2 植物過(guò)表達(dá)載體的構(gòu)建59-60
  • 6.2.3 重組植物過(guò)表達(dá)載體轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌60-61
  • 6.2.4 葉盤法轉(zhuǎn)化煙草61-62
  • 6.2.5 轉(zhuǎn)基因煙草的分子鑒定62
  • 6.3 試驗(yàn)結(jié)果62-66
  • 6.3.1 pCAMBIA3301及pROKⅡ構(gòu)建成一個(gè)新載體62-63
  • 6.3.2 植物過(guò)表達(dá)載體的構(gòu)建63-65
  • 6.3.3 葉盤法轉(zhuǎn)化煙草65-66
  • 6.3.4 轉(zhuǎn)基因煙草的分子鑒定66
  • 6.4 本章討論66-68
  • 第七章 結(jié)論及展望68-69
  • 7.1 結(jié)論68
  • 7.2 展望68-69
  • 參考文獻(xiàn)69-74
  • 附錄74-77
  • 致謝77-78
  • 作者簡(jiǎn)介78-79
  • 附件79

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

1 邵鳳霞;柳展基;魏麗奇;曹敏;畢玉平;;花生NAC類新基因AhNAC1的克隆及序列分析[J];西北植物學(xué)報(bào);2008年10期

中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

1 盧敏;玉米ZmSNAC1和高粱SbSNAC1基因的克隆與功能分析[D];中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2013年

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前2條

1 邵鳳霞;花生NAC轉(zhuǎn)錄因子的克隆和功能分析[D];山東師范大學(xué);2009年

2 趙鳳利;棉花葉片衰老相關(guān)基因GhNAC12的功能分析[D];中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2014年


  本文關(guān)鍵詞:棉花逆境響應(yīng)相關(guān)NAC類轉(zhuǎn)錄因子的克隆與分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

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本文編號(hào):361639

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