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小麥根長(zhǎng)相關(guān)基因的挖掘

發(fā)布時(shí)間:2022-01-19 05:04
  小麥?zhǔn)悄壳笆澜缟戏N植最為廣泛的三大主要谷物之一,40%的世界人口以小麥為主要糧食作物,F(xiàn)階段,干旱是全球范圍內(nèi)制約作物生長(zhǎng)和影響作物產(chǎn)量最嚴(yán)重的非生物脅迫之一。小麥根系活力、土層分布和生長(zhǎng)勢(shì)是影響作物生長(zhǎng)發(fā)育的主要因素。以根長(zhǎng)為出發(fā)點(diǎn)發(fā)掘抗旱遺傳位點(diǎn),分析其遺傳基礎(chǔ)和網(wǎng)絡(luò),不僅可以為小麥抗旱理論積累研究數(shù)據(jù)和經(jīng)驗(yàn),還可以為重要根長(zhǎng)QTL進(jìn)行小麥抗旱育種提供理論參考和基因資源。我們對(duì)選取的768份小麥自然群體進(jìn)行根長(zhǎng)性狀表型分析,768份小麥群體中國內(nèi)品種占684份,國外引進(jìn)品種84份。684份國內(nèi)品種中263份取自黃淮海麥區(qū),根長(zhǎng)性狀平均值為15.99cm,變異系數(shù)為18.26%,其中改良品種242份,根長(zhǎng)性狀平均值為16.28cm,變異系數(shù)為17.07%,地方品種21份,根長(zhǎng)性狀平均值為12.63cm,變異系數(shù)為18.53%。684份國內(nèi)品種中120份取自長(zhǎng)江中下游麥區(qū),根長(zhǎng)性狀平均值為15.86cm,變異系數(shù)為16.77%,其中改良品種77份,根長(zhǎng)性狀平均值為16.37cm,變異系數(shù)為15.82%,地方品種42份,根長(zhǎng)性狀平均值為15.05cm,變異系數(shù)為15.68%。684份國內(nèi)... 

【文章來源】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省

【文章頁數(shù)】:61 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

小麥根長(zhǎng)相關(guān)基因的挖掘


根長(zhǎng)形狀的四次重復(fù)測(cè)量結(jié)果直方圖

關(guān)聯(lián)分析,染色體,上峰


小麥根長(zhǎng)相關(guān)基因的挖掘186D,7D染色體上(表3-3)。其中位于4B染色體上峰值SNP為AX-110397284,位于1220735bp,P值為6.30×10-5;位于7B染色體上兩個(gè)峰值SNP為AX-94418646和AX-110445547,其中AX-94418646位于426881189bp,P值為1.16×10-6。AX-110445547位于612607992bp,P值為8.80×10-6;位于6D染色體上峰值SNP為AX-109235132,位于665400815bp,P值為2.47×10-11;位于7D染色體上峰值SNP為AX-111729400,位于420359481bp,P值為1.32×10-4。表3-3SNP關(guān)聯(lián)分析峰值SNP位點(diǎn)Table3-3PeakSNPlociinSNPassociationanalysisPeakSNPsChromosomePositionPvalueAX-1092351326D6654008152.47E-11AX-944186467B4268811891.16E-06AX-1104455477B6126079928.80E-06AX-1103972844B12207356.30E-05AX-1117294007D4203594811.32E-04圖3-3根長(zhǎng)性狀的全基因關(guān)聯(lián)分析Manhattan和Q-Qplot圖Figure3-3ManhattanandQ-Qplotanalysisofrootlengthtraits其中6D染色體上的信號(hào)最顯著,于是我們對(duì)6D染色體上顯著位點(diǎn)附近進(jìn)行LDBlock分析(圖3-4),確定候選區(qū)間位于6D染色體上453.5MB-473.5MB之間,候選區(qū)間范圍在12473.7kb。

分析基,基因,根系


山東農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士專業(yè)學(xué)位論文19圖3-4根長(zhǎng)基因LDBlock分析基因區(qū)間范圍Figure3-4LDblockanalysisofrootlengthgenerange基于注釋信息,該候選區(qū)間內(nèi)共有28個(gè)注釋基因。轉(zhuǎn)錄組分析表明:其中13個(gè)候選基因是根系表達(dá)基因(表3-4,3-5)。其中TraesCS6D02G384500為根系特異表達(dá)基因,其在根長(zhǎng)兩次重復(fù)TMP(TranscriptsPerMillion)分別為99.04和108,而在葉片中兩次重復(fù)TMP分別為1.16和9.73(圖3-5)。同時(shí)進(jìn)一步同源分析表明:該候選基因與擬南芥FBR12為同源基因,而FBR1通過與細(xì)胞分裂素受體基因(AHK)以及下游磷酸傳遞蛋白基因(AHP)的遺傳互作,調(diào)控根系發(fā)育相關(guān)(RenBetal.,2013)。

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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碩士論文
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[2]中國小麥主產(chǎn)區(qū)小麥生產(chǎn)技術(shù)效率與技術(shù)進(jìn)步率的測(cè)算與分析[D]. 賈筱智.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2013
[3]玉米耐旱相關(guān)候選基因dhn2與表型性狀的關(guān)聯(lián)分析[D]. 趙曦.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2008



本文編號(hào):3596260

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