肉用牛bHLH轉(zhuǎn)錄因子家族成員的鑒定與分析
發(fā)布時(shí)間:2022-01-17 17:16
堿性螺旋環(huán)螺旋(bHLH)轉(zhuǎn)錄因子屬于真核生物蛋白當(dāng)中的一個(gè)大家族,其在細(xì)胞增殖與細(xì)胞分化,神經(jīng)元的分化,肌肉組織與器官的發(fā)生,腸組織發(fā)育以及性別決定等生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中有重要作用。牛是哺乳類(lèi)偶蹄目的草食性反芻動(dòng)物,作為奶,肉以及皮革等的來(lái)源,與人類(lèi)生活密切相關(guān)。家牛的基因組中有80%的基因與人類(lèi)基因達(dá)到共享,并且家牛與人類(lèi)的遺傳相似性高于老鼠與人類(lèi)的遺傳相似性,理論上可作為研究人類(lèi)疾病的動(dòng)物模型。牦牛能夠適應(yīng)高原環(huán)境,表現(xiàn)在其心臟以及肺發(fā)達(dá)、沒(méi)有肺動(dòng)脈高壓、覓食能力強(qiáng)且能量代謝高等解剖學(xué)和生理學(xué)性狀,通過(guò)將人類(lèi)基因組與牛等動(dòng)物的基因組進(jìn)行比較,便于更加全面與深入地理解人類(lèi)疾病的基因基礎(chǔ)。bHLH轉(zhuǎn)錄因子序列大約由60個(gè)氨基酸殘基組成,是由位于氨基端的堿性結(jié)構(gòu)域(b)和位于羧基端的螺旋環(huán)螺旋結(jié)構(gòu)域(HLH)兩部分組成的高度保守的蛋白質(zhì)因子。堿性區(qū)域的功能是與特定的六核苷酸DNA序列結(jié)合,螺旋環(huán)螺旋結(jié)構(gòu)域是通過(guò)與其他HLH蛋白形成同源或異緣二聚體進(jìn)而發(fā)揮其功能。根據(jù)bHLH蛋白與核心的六核苷酸序列的結(jié)合特異性以及蛋白質(zhì)的保守結(jié)構(gòu)域的特點(diǎn)對(duì)bHLH蛋白進(jìn)行分類(lèi),將其劃分為A,B,C,D,E,F...
【文章來(lái)源】:阜陽(yáng)師范大學(xué)安徽省
【文章頁(yè)數(shù)】:79 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第1章 緒論
1 bHLH轉(zhuǎn)錄因子的分類(lèi)
1.1 動(dòng)物bHLH轉(zhuǎn)錄因子的分類(lèi)
1.2 植物和真菌bHLH轉(zhuǎn)錄因子的分類(lèi)
2 已報(bào)道的bHLH轉(zhuǎn)錄因子成員鑒定結(jié)果
3 bHLH轉(zhuǎn)錄因子的功能
3.1 動(dòng)物bHLH轉(zhuǎn)錄因子的功能
3.2 植物與真菌bHLH轉(zhuǎn)錄因子的功能
4 研究目的及意義
5 研究?jī)?nèi)容與技術(shù)路線(xiàn)
5.1 研究?jī)?nèi)容
5.2 技術(shù)路線(xiàn)
第2章 家牛與牦牛bHLH轉(zhuǎn)錄因子的鑒定與分類(lèi)
1 材料
1.1 118 條人bHLH基序
1.2 生物信息學(xué)工具
2 方法與步驟
2.1 BLASTP和TBLASTN搜索
2.2 刪除冗余和序列核查
2.3 序列比對(duì)
2.4 系統(tǒng)發(fā)生分析
3 結(jié)果與討論
3.1 bHLH轉(zhuǎn)錄因子成員的鑒定與分類(lèi)
3.2 bHLH轉(zhuǎn)錄因子成員的命名
4 本章小結(jié)
第3章 家牛與牦牛bHLH轉(zhuǎn)錄因子的功能分析
1 材料
1.1 家牛和牦牛bHLH轉(zhuǎn)錄因子序列
1.2 生物信息工具
2 方法與步驟
2.1 KOBAS對(duì)家牛與牦牛bHLH轉(zhuǎn)錄因子的分析
2.2 DAVID對(duì)家牛與牦牛bHLH轉(zhuǎn)錄因子的分析
2.3 STRING對(duì)家牛與牦牛bHLH轉(zhuǎn)錄因子的分析
3 結(jié)果與分析
3.1 KOBAS對(duì)家牛bHLH轉(zhuǎn)錄因子的分析
3.2 KOBAS對(duì)牦牛bHLH轉(zhuǎn)錄因子的分析
3.3 DAVID對(duì)家牛bHLH轉(zhuǎn)錄因子的分析
3.4 DAVID對(duì)牦牛bHLH轉(zhuǎn)錄因子的分析
3.5 STRING對(duì)家牛bHLH轉(zhuǎn)錄因子的分析
4 本章小結(jié)
第4章 結(jié)論和展望
1 結(jié)論
2 展望
參考文獻(xiàn)
附錄
后記
在校期間公開(kāi)發(fā)表論文及著作情況
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]植物bHLH轉(zhuǎn)錄因子研究進(jìn)展[J]. 劉文文,李文學(xué). 生物技術(shù)進(jìn)展. 2013(01)
[2]動(dòng)物bHLH轉(zhuǎn)錄因子家族成員及其功能[J]. 王勇,姚勤,陳克平. 遺傳. 2010(04)
本文編號(hào):3595121
【文章來(lái)源】:阜陽(yáng)師范大學(xué)安徽省
【文章頁(yè)數(shù)】:79 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第1章 緒論
1 bHLH轉(zhuǎn)錄因子的分類(lèi)
1.1 動(dòng)物bHLH轉(zhuǎn)錄因子的分類(lèi)
1.2 植物和真菌bHLH轉(zhuǎn)錄因子的分類(lèi)
2 已報(bào)道的bHLH轉(zhuǎn)錄因子成員鑒定結(jié)果
3 bHLH轉(zhuǎn)錄因子的功能
3.1 動(dòng)物bHLH轉(zhuǎn)錄因子的功能
3.2 植物與真菌bHLH轉(zhuǎn)錄因子的功能
4 研究目的及意義
5 研究?jī)?nèi)容與技術(shù)路線(xiàn)
5.1 研究?jī)?nèi)容
5.2 技術(shù)路線(xiàn)
第2章 家牛與牦牛bHLH轉(zhuǎn)錄因子的鑒定與分類(lèi)
1 材料
1.1 118 條人bHLH基序
1.2 生物信息學(xué)工具
2 方法與步驟
2.1 BLASTP和TBLASTN搜索
2.2 刪除冗余和序列核查
2.3 序列比對(duì)
2.4 系統(tǒng)發(fā)生分析
3 結(jié)果與討論
3.1 bHLH轉(zhuǎn)錄因子成員的鑒定與分類(lèi)
3.2 bHLH轉(zhuǎn)錄因子成員的命名
4 本章小結(jié)
第3章 家牛與牦牛bHLH轉(zhuǎn)錄因子的功能分析
1 材料
1.1 家牛和牦牛bHLH轉(zhuǎn)錄因子序列
1.2 生物信息工具
2 方法與步驟
2.1 KOBAS對(duì)家牛與牦牛bHLH轉(zhuǎn)錄因子的分析
2.2 DAVID對(duì)家牛與牦牛bHLH轉(zhuǎn)錄因子的分析
2.3 STRING對(duì)家牛與牦牛bHLH轉(zhuǎn)錄因子的分析
3 結(jié)果與分析
3.1 KOBAS對(duì)家牛bHLH轉(zhuǎn)錄因子的分析
3.2 KOBAS對(duì)牦牛bHLH轉(zhuǎn)錄因子的分析
3.3 DAVID對(duì)家牛bHLH轉(zhuǎn)錄因子的分析
3.4 DAVID對(duì)牦牛bHLH轉(zhuǎn)錄因子的分析
3.5 STRING對(duì)家牛bHLH轉(zhuǎn)錄因子的分析
4 本章小結(jié)
第4章 結(jié)論和展望
1 結(jié)論
2 展望
參考文獻(xiàn)
附錄
后記
在校期間公開(kāi)發(fā)表論文及著作情況
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]植物bHLH轉(zhuǎn)錄因子研究進(jìn)展[J]. 劉文文,李文學(xué). 生物技術(shù)進(jìn)展. 2013(01)
[2]動(dòng)物bHLH轉(zhuǎn)錄因子家族成員及其功能[J]. 王勇,姚勤,陳克平. 遺傳. 2010(04)
本文編號(hào):3595121
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