由稻瘟病菌（Magnapothe oryzae）引起的稻瘟病是世界水稻生產(chǎn)中三大毀滅性病害之一,也是西南地區(qū)一季稻常見(jiàn)的流行性病害之一。該病害在貴州南部、四川盆地中西部和云南西南部等地發(fā)生率非常高。因此,致力于稻瘟病菌群體遺傳結(jié)構(gòu)及其多樣性的研究、掌握其毒性相關(guān)基因的出現(xiàn)頻率,對(duì)于品種選育、合理布局和延長(zhǎng)抗病品種的使用壽命等方面都具有重要的意義。本研究通過(guò)對(duì)西南地區(qū)8個(gè)縣（市）所采集到的穗頸瘟標(biāo)樣進(jìn)行病菌分離,選用13對(duì)SSR引物和16對(duì)毒性相關(guān)基因特異性引物對(duì)病原菌基因組DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增。根據(jù)反應(yīng)的結(jié)果,建立基于SSR序列和毒性相關(guān)基因序列的0-1數(shù)據(jù)庫(kù),通過(guò)一系列軟件對(duì)病原菌群體遺傳結(jié)構(gòu)及遺傳多樣性進(jìn)行分析,并根據(jù)擴(kuò)增結(jié)果初步預(yù)測(cè)毒性相關(guān)基因的分布頻率,得到如下結(jié)論：1、通過(guò)分離得到200個(gè)單孢分離菌株。其中四川雅安52株,溫江37株,南充33株,自貢6株；重慶永川25株,墊江24株,梁平15株；貴州湄潭8株。2、8對(duì)SSR引物都能擴(kuò)增出特異性條帶,擴(kuò)增頻率較高,大部分在95.00%以上；16對(duì)毒性相關(guān)基因特異性引物均能擴(kuò)增出目的條帶,擴(kuò)增頻率差異較大。3、西南地區(qū)稻瘟病菌群體... 

【文章來(lái)源】：四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校

【文章頁(yè)數(shù)】：62 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1 稻瘟病菌的多樣性
        1.1 稻瘟病菌寄主多樣性
        1.2 稻瘟病菌生理小種多樣性
            1.2.1 致病型及生理小種研究
            1.2.2 生理小種多樣性
            1.2.3 生理小種多樣性產(chǎn)生的原因
        1.3 稻瘟病菌遺傳多樣性研究
    2 稻瘟病菌致病相關(guān)基因研究
        2.1 稻瘟病菌致病相關(guān)基因研究概況
        2.2 稻瘟病菌致病相關(guān)基因
            2.2.1 參與產(chǎn)孢過(guò)程的基因
            2.2.2 參與附著胞分化的功能基因
            2.2.3 參與附著胞成熟過(guò)程中的功能基因
            2.2.4 參與侵入栓形成及侵入相關(guān)基因
            2.2.5 參與侵入后菌絲分化及擴(kuò)展相關(guān)的基因
            2.2.6 其他稻瘟病菌致病相關(guān)基因
    3 稻瘟病菌無(wú)毒基因研究
        3.1 稻瘟病菌無(wú)毒基因研究概況
        3.2 稻瘟病菌無(wú)毒基因的遺傳分析
        3.3 稻瘟病菌無(wú)毒基因的的結(jié)構(gòu)與功能
    4 本研究的目的意義
第二章 材料與方法
    1 實(shí)驗(yàn)材料
        1.1 稻瘟病樣本
        1.2 儀器設(shè)備
        1.3 試驗(yàn)試劑
        1.4 培養(yǎng)基
    2 實(shí)驗(yàn)方法
        2.1 稻瘟病菌菌株的分離與培養(yǎng)
            2.1.1 稻瘟病標(biāo)樣保濕培養(yǎng)
            2.1.2 病菌的單孢分離
            2.1.3 菌種的制備與保存
            2.1.4 菌絲體培養(yǎng)
        2.2 病菌DNA提取
        2.3 引物設(shè)計(jì)
        2.4 PCR擴(kuò)增條件及電泳
        2.5 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析
第三章 結(jié)果與分析
    1 菌株的分離結(jié)果
    2 全基因組DNA提取效果檢測(cè)
    3 供試菌株的PCR擴(kuò)增結(jié)果
        3.1 SSR引物擴(kuò)增結(jié)果
        3.2 致病基因特異性引物擴(kuò)增結(jié)果
        3.3 無(wú)毒基因特異性引物擴(kuò)增結(jié)果
    4 西南地區(qū)稻瘟病菌群體遺傳結(jié)構(gòu)及其多樣性分析
        4.1 西南地區(qū)稻瘟病菌群體遺傳結(jié)構(gòu)
            4.1.1 西南地區(qū)稻瘟病菌群體單元型分析
            4.1.2 西南地區(qū)稻瘟病菌群體遺傳宗譜分析
        4.2 稻瘟病菌遺傳結(jié)構(gòu)的地理分布特點(diǎn)
        4.3 西南地區(qū)稻瘟病菌自然種群的遺傳參數(shù)分析
            4.3.1 稻瘟病菌遺傳多樣性水平
            4.3.2 稻瘟病菌群體遺傳分化
        4.4 西南地區(qū)稻瘟病菌群體間的遺傳距離與聚類分析
            4.4.1 群體間的遺傳距離
            4.4.2 群體間的聚類分析
    5 西南地區(qū)稻瘟病菌群體間毒性相關(guān)基因分布頻率的初步預(yù)測(cè)
        5.1 致病基因分布頻率的初步預(yù)測(cè)
        5.2 無(wú)毒基因分布頻率的初步預(yù)測(cè)
第四章 結(jié)論與討論
    1 結(jié)論
    2 討論
        2.1 研究背景
        2.2 稻瘟病菌群體遺傳結(jié)構(gòu)研究方法的選擇
        2.3 加強(qiáng)田間監(jiān)測(cè),掌握動(dòng)態(tài)變化規(guī)律
        2.4 毒性相關(guān)基因分布頻率的初步預(yù)測(cè)
    3 后續(xù)實(shí)驗(yàn)展望
        3.1 加強(qiáng)田間監(jiān)測(cè),擴(kuò)大病原菌群體
        3.2 西南地區(qū)稻瘟病菌群體遺傳結(jié)構(gòu)與病原菌致病型的關(guān)系
        3.3 西南地區(qū)稻瘟病菌致病性測(cè)定
        3.4 探究毒性相關(guān)基因在西南地區(qū)稻瘟病菌群體中的分布頻率
參考文獻(xiàn)
致謝
碩士期間發(fā)表文章


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]遼寧省稻瘟病菌無(wú)毒基因型鑒定及分析[J]. 王世維,鄭文靜,趙家銘,魏松紅,王妍,趙寶海,劉志恒.  中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(03)
[2]稻瘟病菌無(wú)毒基因研究進(jìn)展[J]. 姚琳,王劍,盧代華,張歡,陳宇,龔學(xué)書(shū),毛建輝.  中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào). 2014(04)
[3]研究稻瘟病菌群體遺傳多態(tài)性的分子標(biāo)記方法[J]. 穆慧敏,姜華,王艷麗,孫國(guó)昌.  中國(guó)水稻科學(xué). 2013(05)
[4]中國(guó)稻瘟病菌種群分布及優(yōu)勢(shì)生理小種的研究進(jìn)展[J]. 肖丹鳳,張佩勝,王玲,黃世文.  中國(guó)水稻科學(xué). 2013(03)
[5]黑龍江省稻瘟病菌無(wú)毒基因分析及抗病種質(zhì)資源篩選[J]. 李祥曉,王倩,羅生香,何云霞,朱苓華,周永力,黎志康.  作物學(xué)報(bào). 2012(12)
[6]湖南稻瘟病菌遺傳多樣性分析[J]. 童建新,任佐華,劉毅雄,俞海,劉二明.  雜交水稻. 2012(03)
[7]云南省稻瘟病菌群體對(duì)稻瘟病抗性單基因系的致病性分析[J]. 董麗英,王群,劉樹(shù)芳,鄭鳳萍,李迅東,楊勤忠.  西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2012(02)
[8]長(zhǎng)蛸（Octopus variabilis）不同地理群體遺傳多樣性的ISSR分析[J]. 郭寶英,周超,呂振明,李繼姬,吳常文.  海洋與湖沼. 2011(06)
[9]稻瘟菌無(wú)毒基因研究進(jìn)展[J]. 張哲,姜華,王艷麗,孫國(guó)昌.  遺傳. 2011(06)
[10]用SSR標(biāo)記法對(duì)黑龍江省稻瘟菌無(wú)毒基因的檢測(cè)[J]. 張崎峰,靳學(xué)慧,蔡鑫鑫,鞏雙印,劉顯元.  中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào). 2010(10)

碩士論文
[1]湖北省稻瘟病菌群體遺傳多樣性及水稻品種（系）抗瘟性研究[D]. 王永崇.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009



本文編號(hào)：3580531