我國以秦嶺-淮河一線為中國南北分界線,湖南省長沙市望城區(qū)和山東省德州市禹城市分別屬于我國南方和北方地區(qū),生態(tài)環(huán)境和氣候差異明顯,而淡水魚類的腸道菌群豐度和結(jié)構(gòu)也可能存在差異。本研究分別從望城區(qū)和禹城市選取草魚（Ctenopharyngodon idella）、鯽魚（Carassius auratus）和鯉魚（Cyprinus carpio）提取腸道菌群的基因組,擴增16S rRNA的V4高變區(qū),高通量測序,進行數(shù)據(jù)分析。結(jié)果顯示,山東草魚組與湖南草魚組的組間差異大于組內(nèi)差異（R=0.307,P<0.05）,雖然6個組腸道菌群相對豐度不盡一致,但核心菌群為變形菌門（Proteobacteria）、梭桿菌門（Fusobacteria）,擬桿菌門（Bacteroidetes）和厚壁菌門（Firmicutes）,各組在屬水平上的優(yōu)勢菌為鯨桿菌屬（Cetabacterium）。對各組進行了鏈霉菌屬（Streptomyces）、芽孢桿菌屬（Bacillus）、乳桿菌屬（Lactobacillus）、雙歧桿菌屬（Bifidobacterium）、氣單胞菌屬（Aeromonas）、弧菌屬（Vib...

【文章來源】： 湖南師范大學湖南省 211工程院校

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摘要
ABSTRACT
第一章 引言
    1.1 中國常見淡水魚類的養(yǎng)殖情況
    1.2 魚類病害防控與健康養(yǎng)殖研究
        1.2.1 魚類病原體
        1.2.2 病害防治措施
        1.2.3 淡水魚類健康養(yǎng)殖
    1.3 魚類腸道菌群研究概況
        1.3.1 魚類腸道菌群研究
        1.3.2 基于16SrRNA的高通量測序技術(shù)
    1.4 鏈霉菌對水產(chǎn)養(yǎng)殖的潛在效益
    1.5 立題依據(jù)及意義
第二章 不同地區(qū)的淡水魚類腸道菌群分析
    2.1 樣本采集及處理
    2.2 實驗方法
    2.3 結(jié)果與分析
        2.3.1 擴增產(chǎn)物電泳圖
        2.3.2 樣本質(zhì)量評估及物種多樣性分析
        2.3.3 屬水平物種進化關(guān)系
        2.3.4 腸道微生物組成結(jié)構(gòu)
        2.3.5 LEfSe分析
        2.3.6 四種有益菌和五種有害菌的分析比較
        2.3.7 物種注釋
    2.4 討論
第三章 魚類病原菌拮抗菌株的篩選
    3.1 試驗材料
        3.1.1 試驗菌株及試驗用魚
        3.1.2 培養(yǎng)基
        3.1.3 試驗儀器及試劑
    3.2 試驗方法
        3.2.1 拮抗菌篩選
        3.2.2 菌株16SrRNA基因同源性分析
        3.2.3 拮抗菌的碳源利用情況
        3.2.4 淀粉水解試驗
        3.2.5 形態(tài)特征觀察
        3.2.6 菌株的生長曲線
        3.2.7 發(fā)酵上清液對草魚的安全性
        3.2.8 XA1菌株對草魚生長性能的影響
        3.2.9 發(fā)酵上清液對草魚的保護效果
    3.3 試驗結(jié)果
        3.3.1 拮抗菌的初篩
        3.3.2 拮抗菌復篩
        3.3.3 菌種鑒定
        3.3.4 碳源利用情況
        3.3.5 菌株XA1的形態(tài)特征
        3.3.6 生長曲線
        3.3.7 菌株XA1對草魚的影響
    3.4 討論
第四章 菌株XA1對草魚的影響及化合物的分離
    4.1 材料和儀器
        4.1.1 試驗菌株
        4.1.2 培養(yǎng)基
        4.1.3 主要試驗儀器及試劑
    4.2 試驗方法
        4.2.1 甲醇粗提物的抑菌效果
        4.2.2 甲醇粗提物的抑菌性能評價
        4.2.3 甲醇粗提物的耐熱性
        4.2.4 抑菌活性物質(zhì)的分離鑒定
    4.3 試驗結(jié)果
        4.3.1 拮抗菌粗提物的抑菌效果
        4.3.2 粗提物的抑菌性能評價
        4.3.3 抑菌物質(zhì)的熱穩(wěn)定性
        4.3.4 抑菌活性物質(zhì)的分離
    4.4 討論
第五章 結(jié)論與展望
    5.1 結(jié)論
    5.2 展望
參考文獻
縮略詞表
論文發(fā)表情況
專利發(fā)表情況
致謝
受資助的基金項目


【參考文獻】：
期刊論文
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本文編號：3536210