干旱脅迫下馬鈴薯根系A(chǔ)ux/IAA轉(zhuǎn)錄因子的挖掘
發(fā)布時(shí)間:2021-11-20 19:19
受地球氣候變化的影響,全球農(nóng)業(yè)用地逐漸減少,且干旱土地面積日益增加,干旱已成為限制作物生長及產(chǎn)量提高的最嚴(yán)峻的非生物脅迫因子。馬鈴薯(Solanum tuberosum L.)作為我國的主要糧食作物,在解決未來糧食缺乏問題和提高食品安全方面具有非常大的潛力,但因其根系結(jié)構(gòu)狹窄,具有較低的深入土壤的能力,被認(rèn)為是干旱敏感作物。Aux/IAA轉(zhuǎn)錄因子可調(diào)控植物根系的向地性生長從而吸取更多水份提高耐旱性,但其調(diào)控馬鈴薯根系發(fā)育的研究未見報(bào)道。本研究以干旱脅迫下抗旱能力差異明顯的“大西洋”和“青薯9號(hào)”兩個(gè)馬鈴薯品種塊莖膨大期的基礎(chǔ)根尖、初生匍匐莖莖端和塊莖為材料,采用Illumina高通量測(cè)序技術(shù),構(gòu)建6個(gè)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫并對(duì)其結(jié)果進(jìn)行分析,篩選干旱脅迫下馬鈴薯根系不同組分間差異表達(dá)的Aux/IAA轉(zhuǎn)錄因子,并利用qRT-PCR技術(shù)解析不同馬鈴薯品種在正常灌水和干旱處理下的不同生長發(fā)育階段的基礎(chǔ)根尖、初生匍匐莖端和塊莖中Aux/IAA轉(zhuǎn)錄因子表達(dá)模式,挖掘關(guān)鍵基因。已取得以下結(jié)果:1.通過RNA-Seq技術(shù)分析,在轉(zhuǎn)錄水平上共獲得了59234個(gè)差異基因。以“青薯9號(hào)”為參照,在“大西洋”的基礎(chǔ)根...
【文章來源】:甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)甘肅省
【文章頁數(shù)】:68 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
不同樣品基因表達(dá)的相關(guān)性Figure2.Correlationofgeneexpressionindifferentsamples2.2.2基因表達(dá)量分析
干旱脅迫下馬鈴薯根系A(chǔ)ux/IAA轉(zhuǎn)錄因子的挖掘15圖3.各樣品FPKM箱線圖Figure3.FPKMboxdiagramofeachsample注:圖中橫坐標(biāo)代表不同的樣品;縱坐標(biāo)表示樣品表達(dá)量FPKM的對(duì)數(shù)值。表3.差異表達(dá)基因數(shù)目統(tǒng)計(jì)表Table3.Statisticsofthenumberofdifferentiallyexpressedgenes差異基因組DEG_Set所有差異基因數(shù)All_DEG上調(diào)表達(dá)基因up-regulated下調(diào)表達(dá)基因down-regulatedAtBR1_AtBR3_AtBR2_vs_AtPS2_AtPS3_AtPS122545021752AtBR1_AtBR3_AtBR2_vs_AtT1_AtT2_AtT31275643598397AtBR1_AtBR3_AtBR2_vs_QsBR1_QsBR2_QsBR3462020452575AtPS2_AtPS3_AtPS1_vs_AtT1_AtT2_AtT31011442595855AtPS2_AtPS3_AtPS1_vs_QsPS1_QsPS2_QsPS321861311875AtT1_AtT2_AtT3_vs_QsT1_QsT2_QsT3475931751584QsBR1_QsBR2_QsBR3_vs_QsPS1_QsPS2_QsPS323318201511QsBR1_QsBR2_QsBR3_vs_QsT1_QsT2_QsT3353212942238QsPS1_QsPS2_QsPS3_vs_QsT1_QsT2_QsT3315013571793
甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)2020屆碩士學(xué)位論文16ABCDEF圖4.不同馬鈴薯品種根系不同組織的差異基因Figure4.Differentgenesindifferenttissuesofdifferentpotatoroots注:(A,C,E)分別為大西洋和青薯9號(hào)兩個(gè)品種之間通過干旱處理鑒定的上調(diào)差異表達(dá)基因;(B,D,F(xiàn))分別為大西洋和青薯9號(hào)兩個(gè)品種之間通過干旱處理鑒定的下調(diào)差異表達(dá)基因。G0:AtBR1_AtBR3_AtBR2_vs_AtPS2_AtPS3_AtPS1;G1:AtBR1_AtBR3_AtBR2_vs_AtT1_AtT2_AtT3;G2:AtBR1_AtBR3_AtBR2_vs_QsBR1_QsBR2_QsBR3;G3:AtPS2_AtPS3_AtPS1_vs_AtT1_AtT2_AtT3;G4:AtPS2_AtPS3_AtPS1_vs_QsPS1_QsPS2_QsPS3;G5:AtT1_AtT2_AtT3_vs_QsT1_QsT2_QsT3;G6:QsBR1_QsBR2_QsBR3_vs_QsPS1_QsPS2_QsPS3;G7:QsBR1_QsBR2_QsBR3_vs_QsT1_QsT2_QsT3;G8:QsPS1_QsPS2_QsPS3_vs_QsT1_QsT2_QsT3.
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]作物抗旱基因研究進(jìn)展及在馬鈴薯抗旱種質(zhì)創(chuàng)新中的應(yīng)用[J]. 王曉斌,胡開明,范阿琪,趙鋒,張俊蓮,王蒂,白江平. 干旱地區(qū)農(nóng)業(yè)研究. 2017(01)
[2]定西市安定區(qū)馬鈴薯產(chǎn)業(yè)存在的問題及發(fā)展對(duì)策[J]. 武漢軍,李繼明. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2016(13)
[3]聚乙二醇模擬干旱對(duì)甜高粱幼苗生長及抗旱性的影響[J]. 馮曉東,王悅,王曉潔,王思思,鄧倩,惠小紅. 延安大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2015(01)
[4]植物干旱脅迫適應(yīng)機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 李潔. 廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(19)
[5]PEG模擬不同程度干旱脅迫對(duì)長豇豆種子萌發(fā)及幼苗生理特性的影響[J]. 張鳳銀,陳禪友,張萍,譚友波,李俊芳. 湖南師范大學(xué)自然科學(xué)學(xué)報(bào). 2014(02)
[6]Aux/IAA和ARF蛋白對(duì)植物側(cè)根形成的影響[J]. 何開平,吳楚. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2011(22)
[7]PEG-6000模擬干旱對(duì)水稻幼苗期根系的影響[J]. 馬廷臣,余蓉蓉,陳榮軍,曾漢來,張端品. 中國生態(tài)農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2010(06)
[8]黃瓜Aux/IAA基因家族的生物信息學(xué)分析[J]. 王壘,陳勁楓,賈利. 中國瓜菜. 2010(06)
[9]高粱全基因組生長素原初響應(yīng)基因Aux/IAA的序列特征分析[J]. 王益軍,呂燕萍,謝秦,鄧德祥,卞云龍. 作物學(xué)報(bào). 2010(04)
[10]植物抗非生物脅迫基因工程研究進(jìn)展[J]. 蘇杰,叢靖宇,劉國軍. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2009(25)
博士論文
[1]生長素和細(xì)胞分裂素調(diào)控馬鈴薯離體塊莖發(fā)育蛋白質(zhì)組研究[D]. 王東霞.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
本文編號(hào):3507959
【文章來源】:甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)甘肅省
【文章頁數(shù)】:68 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
不同樣品基因表達(dá)的相關(guān)性Figure2.Correlationofgeneexpressionindifferentsamples2.2.2基因表達(dá)量分析
干旱脅迫下馬鈴薯根系A(chǔ)ux/IAA轉(zhuǎn)錄因子的挖掘15圖3.各樣品FPKM箱線圖Figure3.FPKMboxdiagramofeachsample注:圖中橫坐標(biāo)代表不同的樣品;縱坐標(biāo)表示樣品表達(dá)量FPKM的對(duì)數(shù)值。表3.差異表達(dá)基因數(shù)目統(tǒng)計(jì)表Table3.Statisticsofthenumberofdifferentiallyexpressedgenes差異基因組DEG_Set所有差異基因數(shù)All_DEG上調(diào)表達(dá)基因up-regulated下調(diào)表達(dá)基因down-regulatedAtBR1_AtBR3_AtBR2_vs_AtPS2_AtPS3_AtPS122545021752AtBR1_AtBR3_AtBR2_vs_AtT1_AtT2_AtT31275643598397AtBR1_AtBR3_AtBR2_vs_QsBR1_QsBR2_QsBR3462020452575AtPS2_AtPS3_AtPS1_vs_AtT1_AtT2_AtT31011442595855AtPS2_AtPS3_AtPS1_vs_QsPS1_QsPS2_QsPS321861311875AtT1_AtT2_AtT3_vs_QsT1_QsT2_QsT3475931751584QsBR1_QsBR2_QsBR3_vs_QsPS1_QsPS2_QsPS323318201511QsBR1_QsBR2_QsBR3_vs_QsT1_QsT2_QsT3353212942238QsPS1_QsPS2_QsPS3_vs_QsT1_QsT2_QsT3315013571793
甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)2020屆碩士學(xué)位論文16ABCDEF圖4.不同馬鈴薯品種根系不同組織的差異基因Figure4.Differentgenesindifferenttissuesofdifferentpotatoroots注:(A,C,E)分別為大西洋和青薯9號(hào)兩個(gè)品種之間通過干旱處理鑒定的上調(diào)差異表達(dá)基因;(B,D,F(xiàn))分別為大西洋和青薯9號(hào)兩個(gè)品種之間通過干旱處理鑒定的下調(diào)差異表達(dá)基因。G0:AtBR1_AtBR3_AtBR2_vs_AtPS2_AtPS3_AtPS1;G1:AtBR1_AtBR3_AtBR2_vs_AtT1_AtT2_AtT3;G2:AtBR1_AtBR3_AtBR2_vs_QsBR1_QsBR2_QsBR3;G3:AtPS2_AtPS3_AtPS1_vs_AtT1_AtT2_AtT3;G4:AtPS2_AtPS3_AtPS1_vs_QsPS1_QsPS2_QsPS3;G5:AtT1_AtT2_AtT3_vs_QsT1_QsT2_QsT3;G6:QsBR1_QsBR2_QsBR3_vs_QsPS1_QsPS2_QsPS3;G7:QsBR1_QsBR2_QsBR3_vs_QsT1_QsT2_QsT3;G8:QsPS1_QsPS2_QsPS3_vs_QsT1_QsT2_QsT3.
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]作物抗旱基因研究進(jìn)展及在馬鈴薯抗旱種質(zhì)創(chuàng)新中的應(yīng)用[J]. 王曉斌,胡開明,范阿琪,趙鋒,張俊蓮,王蒂,白江平. 干旱地區(qū)農(nóng)業(yè)研究. 2017(01)
[2]定西市安定區(qū)馬鈴薯產(chǎn)業(yè)存在的問題及發(fā)展對(duì)策[J]. 武漢軍,李繼明. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2016(13)
[3]聚乙二醇模擬干旱對(duì)甜高粱幼苗生長及抗旱性的影響[J]. 馮曉東,王悅,王曉潔,王思思,鄧倩,惠小紅. 延安大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2015(01)
[4]植物干旱脅迫適應(yīng)機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 李潔. 廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(19)
[5]PEG模擬不同程度干旱脅迫對(duì)長豇豆種子萌發(fā)及幼苗生理特性的影響[J]. 張鳳銀,陳禪友,張萍,譚友波,李俊芳. 湖南師范大學(xué)自然科學(xué)學(xué)報(bào). 2014(02)
[6]Aux/IAA和ARF蛋白對(duì)植物側(cè)根形成的影響[J]. 何開平,吳楚. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2011(22)
[7]PEG-6000模擬干旱對(duì)水稻幼苗期根系的影響[J]. 馬廷臣,余蓉蓉,陳榮軍,曾漢來,張端品. 中國生態(tài)農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2010(06)
[8]黃瓜Aux/IAA基因家族的生物信息學(xué)分析[J]. 王壘,陳勁楓,賈利. 中國瓜菜. 2010(06)
[9]高粱全基因組生長素原初響應(yīng)基因Aux/IAA的序列特征分析[J]. 王益軍,呂燕萍,謝秦,鄧德祥,卞云龍. 作物學(xué)報(bào). 2010(04)
[10]植物抗非生物脅迫基因工程研究進(jìn)展[J]. 蘇杰,叢靖宇,劉國軍. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2009(25)
博士論文
[1]生長素和細(xì)胞分裂素調(diào)控馬鈴薯離體塊莖發(fā)育蛋白質(zhì)組研究[D]. 王東霞.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
本文編號(hào):3507959
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