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干旱脅迫下馬鈴薯根系A(chǔ)ux/IAA轉(zhuǎn)錄因子的挖掘

發(fā)布時(shí)間:2021-11-20 19:19
  受地球氣候變化的影響,全球農(nóng)業(yè)用地逐漸減少,且干旱土地面積日益增加,干旱已成為限制作物生長及產(chǎn)量提高的最嚴(yán)峻的非生物脅迫因子。馬鈴薯(Solanum tuberosum L.)作為我國的主要糧食作物,在解決未來糧食缺乏問題和提高食品安全方面具有非常大的潛力,但因其根系結(jié)構(gòu)狹窄,具有較低的深入土壤的能力,被認(rèn)為是干旱敏感作物。Aux/IAA轉(zhuǎn)錄因子可調(diào)控植物根系的向地性生長從而吸取更多水份提高耐旱性,但其調(diào)控馬鈴薯根系發(fā)育的研究未見報(bào)道。本研究以干旱脅迫下抗旱能力差異明顯的“大西洋”和“青薯9號(hào)”兩個(gè)馬鈴薯品種塊莖膨大期的基礎(chǔ)根尖、初生匍匐莖莖端和塊莖為材料,采用Illumina高通量測(cè)序技術(shù),構(gòu)建6個(gè)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫并對(duì)其結(jié)果進(jìn)行分析,篩選干旱脅迫下馬鈴薯根系不同組分間差異表達(dá)的Aux/IAA轉(zhuǎn)錄因子,并利用qRT-PCR技術(shù)解析不同馬鈴薯品種在正常灌水和干旱處理下的不同生長發(fā)育階段的基礎(chǔ)根尖、初生匍匐莖端和塊莖中Aux/IAA轉(zhuǎn)錄因子表達(dá)模式,挖掘關(guān)鍵基因。已取得以下結(jié)果:1.通過RNA-Seq技術(shù)分析,在轉(zhuǎn)錄水平上共獲得了59234個(gè)差異基因。以“青薯9號(hào)”為參照,在“大西洋”的基礎(chǔ)根... 

【文章來源】:甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)甘肅省

【文章頁數(shù)】:68 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

干旱脅迫下馬鈴薯根系A(chǔ)ux/IAA轉(zhuǎn)錄因子的挖掘


不同樣品基因表達(dá)的相關(guān)性Figure2.Correlationofgeneexpressionindifferentsamples2.2.2基因表達(dá)量分析

線圖,線圖,基因


干旱脅迫下馬鈴薯根系A(chǔ)ux/IAA轉(zhuǎn)錄因子的挖掘15圖3.各樣品FPKM箱線圖Figure3.FPKMboxdiagramofeachsample注:圖中橫坐標(biāo)代表不同的樣品;縱坐標(biāo)表示樣品表達(dá)量FPKM的對(duì)數(shù)值。表3.差異表達(dá)基因數(shù)目統(tǒng)計(jì)表Table3.Statisticsofthenumberofdifferentiallyexpressedgenes差異基因組DEG_Set所有差異基因數(shù)All_DEG上調(diào)表達(dá)基因up-regulated下調(diào)表達(dá)基因down-regulatedAtBR1_AtBR3_AtBR2_vs_AtPS2_AtPS3_AtPS122545021752AtBR1_AtBR3_AtBR2_vs_AtT1_AtT2_AtT31275643598397AtBR1_AtBR3_AtBR2_vs_QsBR1_QsBR2_QsBR3462020452575AtPS2_AtPS3_AtPS1_vs_AtT1_AtT2_AtT31011442595855AtPS2_AtPS3_AtPS1_vs_QsPS1_QsPS2_QsPS321861311875AtT1_AtT2_AtT3_vs_QsT1_QsT2_QsT3475931751584QsBR1_QsBR2_QsBR3_vs_QsPS1_QsPS2_QsPS323318201511QsBR1_QsBR2_QsBR3_vs_QsT1_QsT2_QsT3353212942238QsPS1_QsPS2_QsPS3_vs_QsT1_QsT2_QsT3315013571793

品種,大西洋,基因,馬鈴薯


甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)2020屆碩士學(xué)位論文16ABCDEF圖4.不同馬鈴薯品種根系不同組織的差異基因Figure4.Differentgenesindifferenttissuesofdifferentpotatoroots注:(A,C,E)分別為大西洋和青薯9號(hào)兩個(gè)品種之間通過干旱處理鑒定的上調(diào)差異表達(dá)基因;(B,D,F(xiàn))分別為大西洋和青薯9號(hào)兩個(gè)品種之間通過干旱處理鑒定的下調(diào)差異表達(dá)基因。G0:AtBR1_AtBR3_AtBR2_vs_AtPS2_AtPS3_AtPS1;G1:AtBR1_AtBR3_AtBR2_vs_AtT1_AtT2_AtT3;G2:AtBR1_AtBR3_AtBR2_vs_QsBR1_QsBR2_QsBR3;G3:AtPS2_AtPS3_AtPS1_vs_AtT1_AtT2_AtT3;G4:AtPS2_AtPS3_AtPS1_vs_QsPS1_QsPS2_QsPS3;G5:AtT1_AtT2_AtT3_vs_QsT1_QsT2_QsT3;G6:QsBR1_QsBR2_QsBR3_vs_QsPS1_QsPS2_QsPS3;G7:QsBR1_QsBR2_QsBR3_vs_QsT1_QsT2_QsT3;G8:QsPS1_QsPS2_QsPS3_vs_QsT1_QsT2_QsT3.

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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博士論文
[1]生長素和細(xì)胞分裂素調(diào)控馬鈴薯離體塊莖發(fā)育蛋白質(zhì)組研究[D]. 王東霞.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018



本文編號(hào):3507959

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