家畜的系譜記錄是選種選配以及群體遺傳參數(shù)評估的重要依據(jù)。但是目前我國在綿羊育種場中往往存在系譜記錄不全甚至缺失的現(xiàn)象,這對后續(xù)的遺傳力評估、育種值預(yù)測以及選種選配方案的制定產(chǎn)生重要的影響,因此應(yīng)用親子鑒定技術(shù)鑒別個(gè)體身份,修正錯(cuò)誤系譜信息有著極為重要的實(shí)踐意義。微衛(wèi)星分子標(biāo)記因具有共顯性遺傳、穩(wěn)定性好、多態(tài)性高等特點(diǎn),已經(jīng)在家畜遺傳圖譜構(gòu)建和家系管理等研究中廣泛應(yīng)用。目前綿羊微衛(wèi)星標(biāo)記重復(fù)單元均為2堿基重復(fù),因PCR擴(kuò)增易出現(xiàn)影子帶而使等位基因的準(zhǔn)確讀取比較困難,從而往往導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)結(jié)果不穩(wěn)定。本研究以小尾寒羊和杜泊羊?yàn)橹饕芯繉ο?擬從已有的綿羊參考基因組序列出發(fā),篩選四堿基重復(fù)高多態(tài)性微衛(wèi)星位點(diǎn),同時(shí)探討所獲得的微衛(wèi)星位點(diǎn)應(yīng)用于綿羊親子鑒定的可行性,旨在為下一步綿羊群體間遺傳多樣性分析、親緣關(guān)系的鑒定和家系分析等方面奠定基礎(chǔ)。主要研究結(jié)果如下:（1）在綿羊參考基因組中通過BLAST檢索,在26條常染色體上獲得138個(gè)含有四堿基重復(fù)（ATAG或CTAT）_n的微衛(wèi)星序列,并依據(jù)重復(fù)序列兩端側(cè)冀序列特征以及設(shè)計(jì)引物的基本條件,選取其中的53個(gè)位點(diǎn)設(shè)計(jì)引物。通過瓊脂糖凝膠... 

【文章來源】：吉林大學(xué)吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：67 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

綿羊血液基因組DNA提取結(jié)果

隨機(jī)選取2只小尾寒羊,對合成的53對引物進(jìn)行了擴(kuò)增特異性和擴(kuò)增效率的檢測。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)2.5％的瓊脂糖凝膠電泳分析,將沒有擴(kuò)增條帶、擴(kuò)增條帶不清晰以及有非特異性擴(kuò)增條帶的位點(diǎn)去除,本實(shí)驗(yàn)共獲得30對擴(kuò)增條帶清晰、大小與預(yù)期相符的引物,部分結(jié)果見圖1.2。將30個(gè)候選微衛(wèi)星位點(diǎn)的 PCR產(chǎn)物進(jìn)行克隆和測序,將獲得的序列進(jìn)行BLAST分析確定了30個(gè)位點(diǎn)的在綿羊染色體上的位置,重復(fù)大小范圍為6-26,擴(kuò)增長度范圍為127-468,30個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)的序列特征分析結(jié)果見表1.5。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
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碩士論文
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本文編號：3505244