布魯氏菌快速核酸檢測方法的建立
發(fā)布時間:2021-11-13 17:06
布魯氏菌。˙rucellosis,簡稱“布病”)是由胞內(nèi)寄生菌——布魯氏菌(Brucella spp.)引起的一種人獸共患傳染病,該病嚴重影響我國的畜牧業(yè)的發(fā)展,造成重大經(jīng)濟損失。我國目前對布魯氏菌病的檢測主要以細菌學、血清學檢測方法為主,這些方法存在著費時費力、假陽性、以及無法區(qū)分死菌等缺點,同時不能對病原進行快速檢測和種間鑒定。因此,開發(fā)布魯氏菌病快速檢測方法對布病的防控與凈化具有重要意義。本課題致力于研究布魯氏菌的快速檢測方法,以核酸擴增技術為基礎,建立一系列檢測方法,為布魯氏菌病的科學研究、防控與凈化,提供切實有效的布魯氏菌檢測技術手段。1、通過將疊氮溴化丙錠(Propidium Monoazide,PMA)與熒光定量PCR(Fluorescence Quantitative PCR,qPCR)結合建立一種布魯氏菌活菌數(shù)的快速定量檢測方法。以布魯氏菌單拷貝BCSP31基因為檢測靶標,構建重組標準質粒,繪制標準曲線。優(yōu)化qPCR反應條件及PMA最佳應用濃度與曝光時間,對該方法的靈敏度、特異性、重復性等進行分析。結果顯示,CT值與標準質?截悢(shù)濃度對數(shù)值之間線性關系良好;靈敏度為...
【文章來源】:吉林大學吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:118 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
Bruce-ladder法對布魯氏菌進行種間鑒定[85]
第一篇文獻綜述第2章基于核酸擴增技術的檢測方法及其應用16基團,對整個擴增過程進行實時監(jiān)控,將每個擴增反應所產(chǎn)生的熒光信號進行檢測、收集,最終利用已知量的標準品構建標準曲線對未知樣本進行定量分析,實現(xiàn)了PCR從定性到定量的飛躍。該技術目前常用的熒光物質主要分為探針類和染料類兩大類。1)TaqMan探針TaqMan探針是一段能與目的片段特異結合的核酸序列,如圖2所示,該序列的5"標記熒光報告基團,3"端標記淬滅基團,探針處于完整狀態(tài)時,熒光基團所釋放的熒光信號被淬滅基團所吸收。當擴增反應開始時,引物與探針都與模板鏈特異性結合,隨著擴增反應的開始,探針鏈逐漸被鏈置換反應所替代,探針將會被DNA聚合酶的5"-3"外切酶活性所水解,此時熒光基團釋放的熒光信號就會隨著擴增反應的進行被儀器監(jiān)測。熒光信號的強度達到儀器所設置的某一閾值時,此時的循環(huán)次數(shù)(CT值)就被記錄下來,CT值與目的基因拷貝數(shù)的對數(shù)值成線性關系,從而對目標物達到定量的目的[98]。圖2TaqMan探針技術作用原理[99]Fig.2TheprincipleofTaqManProbetechnology2)雜交探針(HybProbe)雜交探針是由兩個寡核苷酸探針所組成,該探針率先由羅氏公司(Roche)所發(fā)明并應用于熒光定量PCR的檢測。如圖3所示,兩個寡核苷酸探針分別標記熒光供體和熒光受體,當PCR反應退火復性時,兩個探針同與一條模板鏈進行雜交,熒光供體與熒光受體相接近,熒光供體被外來光源激發(fā),其釋放的能量
第一篇文獻綜述第2章基于核酸擴增技術的檢測方法及其應用17通過熒光共振能量轉移(FRET)傳遞給熒光受體,而受體所釋放的熒光信號則被儀器檢測到,隨著擴增反應的進行,DNA產(chǎn)物越多,其釋放的熒光信號就越大,從而對目標物達到定量的目的圖3雜交探針技術作用原理(引自Roche公司)Fig.3TheprincipleofHybridizationProbetechnology3)分子信標探針(MulecularBeaconsProbe)分子信標探針為新型探針,該探針需要特定結構的序列,設計要求高。特點在于其為莖環(huán)狀的發(fā)卡結構,如圖4所示。該探針的莖環(huán)是由15~30個核苷酸組成,莖臂一般由5~7個核苷酸組成,其兩端序列互補配對,分別標記有熒光基團和淬滅集團。當無靶標時,探針成自由狀態(tài),形成穩(wěn)定的莖環(huán)發(fā)卡結構,熒光基團被激發(fā)產(chǎn)生的熒光信號被淬滅集團所淬滅,當探針與模板鏈成功雜交時,可形成線性結構,熒光基團與淬滅基團間隔較遠,淬滅基團失去作用,此時所激發(fā)的熒光信號可被儀器監(jiān)測到。圖4分子信標探針技術作用原理(引自Roche公司)Fig.4TheprincipleofMulecularBeaconsProbetechnology4)熒光染料熒光染料的工作原理較簡單,如圖5所示,當熒光染料與雙鏈擴增產(chǎn)物結合時,會產(chǎn)生較強的熒光信號,進而被儀器監(jiān)測到,熒光信號的強度與反應體系內(nèi)
【參考文獻】:
期刊論文
[1]羊布魯氏菌病的危害及防控[J]. 宋小會. 飼料博覽. 2019(01)
[2]布病防治知識[J]. 智艷麗. 四川畜牧獸醫(yī). 2018(12)
[3]我國人畜間布魯氏菌病流行狀況[J]. 陳禮朋,張淼,李新生,盧俊剛. 中國動物檢疫. 2018(10)
[4]規(guī)模化牛羊場布魯氏桿菌病凈化的注意環(huán)節(jié)[J]. 王寶菊. 養(yǎng)殖與飼料. 2018(06)
[5]2005-2016年全國布魯氏菌病監(jiān)測數(shù)據(jù)分析[J]. 崔步云,姜海. 疾病監(jiān)測. 2018(03)
[6]馬耳他布魯菌椎管內(nèi)感染性肉芽腫一例[J]. 杜川,胡超,朱筱,李錚,趙龍,唐曉平. 中華神經(jīng)外科雜志. 2017 (11)
[7]羊布魯氏菌病的特點及綜合防治[J]. 韓冬青. 甘肅畜牧獸醫(yī). 2017(06)
[8]家畜布魯氏菌病及其防控措施[J]. 普會玲. 中國畜牧獸醫(yī)文摘. 2017(04)
[9]有機消泡劑對棘孢木霉菌株Tr148c液體發(fā)酵分生孢子產(chǎn)量的影響[J]. 馬曉梅,王軍,曠文豐,褚凱,陳晨,毛偉力. 化學與生物工程. 2017(03)
[10]間接酶聯(lián)免疫吸附試驗在人布魯菌病診斷中的價值研究[J]. 何晶晶,劉景瑤,張雁,趙冬梅,鄭遵榮. 診斷學理論與實踐. 2017(01)
博士論文
[1]動物布魯氏菌快速檢測方法的研究[D]. 李建云.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2012
[2]吉林省布魯氏菌流行株種屬鑒定及其耐藥分子機制的研究[D]. 孫麗媛.吉林大學 2011
碩士論文
[1]非洲豬瘟病毒重組酶聚合酶擴增(RPA)方法的建立[D]. 哈登楚日亞.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2017
[2]牛布魯氏菌病熒光標記免疫層析試紙條檢測技術研究[D]. 吳彤.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2016
[3]基于PCR的天麻、Hg2+檢測方法及PCR結合DiSC2(5)的一步可視化檢測法的建立[D]. 王巍.成都中醫(yī)藥大學 2015
[4]牛羊豬犬種布魯氏菌多重PCR方法的建立及試劑盒研制[D]. 陳思.中國人民解放軍軍事醫(yī)學科學院 2014
[5]循環(huán)探針熒光定量PCR方法用于布魯氏菌分種的研究以及布魯氏菌LAMP可視化檢測方法的建立[D]. 許鄒亮.揚州大學 2011
[6]布魯氏菌熒光定量PCR快速檢測方法的建立及檢測試劑盒的組裝[D]. 李光輝.吉林大學 2006
本文編號:3493385
【文章來源】:吉林大學吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:118 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
Bruce-ladder法對布魯氏菌進行種間鑒定[85]
第一篇文獻綜述第2章基于核酸擴增技術的檢測方法及其應用16基團,對整個擴增過程進行實時監(jiān)控,將每個擴增反應所產(chǎn)生的熒光信號進行檢測、收集,最終利用已知量的標準品構建標準曲線對未知樣本進行定量分析,實現(xiàn)了PCR從定性到定量的飛躍。該技術目前常用的熒光物質主要分為探針類和染料類兩大類。1)TaqMan探針TaqMan探針是一段能與目的片段特異結合的核酸序列,如圖2所示,該序列的5"標記熒光報告基團,3"端標記淬滅基團,探針處于完整狀態(tài)時,熒光基團所釋放的熒光信號被淬滅基團所吸收。當擴增反應開始時,引物與探針都與模板鏈特異性結合,隨著擴增反應的開始,探針鏈逐漸被鏈置換反應所替代,探針將會被DNA聚合酶的5"-3"外切酶活性所水解,此時熒光基團釋放的熒光信號就會隨著擴增反應的進行被儀器監(jiān)測。熒光信號的強度達到儀器所設置的某一閾值時,此時的循環(huán)次數(shù)(CT值)就被記錄下來,CT值與目的基因拷貝數(shù)的對數(shù)值成線性關系,從而對目標物達到定量的目的[98]。圖2TaqMan探針技術作用原理[99]Fig.2TheprincipleofTaqManProbetechnology2)雜交探針(HybProbe)雜交探針是由兩個寡核苷酸探針所組成,該探針率先由羅氏公司(Roche)所發(fā)明并應用于熒光定量PCR的檢測。如圖3所示,兩個寡核苷酸探針分別標記熒光供體和熒光受體,當PCR反應退火復性時,兩個探針同與一條模板鏈進行雜交,熒光供體與熒光受體相接近,熒光供體被外來光源激發(fā),其釋放的能量
第一篇文獻綜述第2章基于核酸擴增技術的檢測方法及其應用17通過熒光共振能量轉移(FRET)傳遞給熒光受體,而受體所釋放的熒光信號則被儀器檢測到,隨著擴增反應的進行,DNA產(chǎn)物越多,其釋放的熒光信號就越大,從而對目標物達到定量的目的圖3雜交探針技術作用原理(引自Roche公司)Fig.3TheprincipleofHybridizationProbetechnology3)分子信標探針(MulecularBeaconsProbe)分子信標探針為新型探針,該探針需要特定結構的序列,設計要求高。特點在于其為莖環(huán)狀的發(fā)卡結構,如圖4所示。該探針的莖環(huán)是由15~30個核苷酸組成,莖臂一般由5~7個核苷酸組成,其兩端序列互補配對,分別標記有熒光基團和淬滅集團。當無靶標時,探針成自由狀態(tài),形成穩(wěn)定的莖環(huán)發(fā)卡結構,熒光基團被激發(fā)產(chǎn)生的熒光信號被淬滅集團所淬滅,當探針與模板鏈成功雜交時,可形成線性結構,熒光基團與淬滅基團間隔較遠,淬滅基團失去作用,此時所激發(fā)的熒光信號可被儀器監(jiān)測到。圖4分子信標探針技術作用原理(引自Roche公司)Fig.4TheprincipleofMulecularBeaconsProbetechnology4)熒光染料熒光染料的工作原理較簡單,如圖5所示,當熒光染料與雙鏈擴增產(chǎn)物結合時,會產(chǎn)生較強的熒光信號,進而被儀器監(jiān)測到,熒光信號的強度與反應體系內(nèi)
【參考文獻】:
期刊論文
[1]羊布魯氏菌病的危害及防控[J]. 宋小會. 飼料博覽. 2019(01)
[2]布病防治知識[J]. 智艷麗. 四川畜牧獸醫(yī). 2018(12)
[3]我國人畜間布魯氏菌病流行狀況[J]. 陳禮朋,張淼,李新生,盧俊剛. 中國動物檢疫. 2018(10)
[4]規(guī)模化牛羊場布魯氏桿菌病凈化的注意環(huán)節(jié)[J]. 王寶菊. 養(yǎng)殖與飼料. 2018(06)
[5]2005-2016年全國布魯氏菌病監(jiān)測數(shù)據(jù)分析[J]. 崔步云,姜海. 疾病監(jiān)測. 2018(03)
[6]馬耳他布魯菌椎管內(nèi)感染性肉芽腫一例[J]. 杜川,胡超,朱筱,李錚,趙龍,唐曉平. 中華神經(jīng)外科雜志. 2017 (11)
[7]羊布魯氏菌病的特點及綜合防治[J]. 韓冬青. 甘肅畜牧獸醫(yī). 2017(06)
[8]家畜布魯氏菌病及其防控措施[J]. 普會玲. 中國畜牧獸醫(yī)文摘. 2017(04)
[9]有機消泡劑對棘孢木霉菌株Tr148c液體發(fā)酵分生孢子產(chǎn)量的影響[J]. 馬曉梅,王軍,曠文豐,褚凱,陳晨,毛偉力. 化學與生物工程. 2017(03)
[10]間接酶聯(lián)免疫吸附試驗在人布魯菌病診斷中的價值研究[J]. 何晶晶,劉景瑤,張雁,趙冬梅,鄭遵榮. 診斷學理論與實踐. 2017(01)
博士論文
[1]動物布魯氏菌快速檢測方法的研究[D]. 李建云.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2012
[2]吉林省布魯氏菌流行株種屬鑒定及其耐藥分子機制的研究[D]. 孫麗媛.吉林大學 2011
碩士論文
[1]非洲豬瘟病毒重組酶聚合酶擴增(RPA)方法的建立[D]. 哈登楚日亞.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2017
[2]牛布魯氏菌病熒光標記免疫層析試紙條檢測技術研究[D]. 吳彤.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2016
[3]基于PCR的天麻、Hg2+檢測方法及PCR結合DiSC2(5)的一步可視化檢測法的建立[D]. 王巍.成都中醫(yī)藥大學 2015
[4]牛羊豬犬種布魯氏菌多重PCR方法的建立及試劑盒研制[D]. 陳思.中國人民解放軍軍事醫(yī)學科學院 2014
[5]循環(huán)探針熒光定量PCR方法用于布魯氏菌分種的研究以及布魯氏菌LAMP可視化檢測方法的建立[D]. 許鄒亮.揚州大學 2011
[6]布魯氏菌熒光定量PCR快速檢測方法的建立及檢測試劑盒的組裝[D]. 李光輝.吉林大學 2006
本文編號:3493385
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