普通煙草（Nicotiana tabacum）是世界范圍內(nèi)重要的經(jīng)濟作物之一,是研究基礎(chǔ)生物學(xué)過程的模式植物。果糖-1,6-二磷酸醛縮酶（Fructose-1,6-bisphosphate aldolase,FBA）是參與植物糖酵解,糖異生和卡爾文循環(huán)的關(guān)鍵酶。它在生物和非生物應(yīng)激反應(yīng)以及調(diào)節(jié)生長和發(fā)育中起重要作用。本研究基于公共基因組平臺上的煙草基因組信息,對煙草FBA基因進行系統(tǒng)鑒定以及特征特性分析。對煙草FBA在煙草根莖葉中的表達、對光反應(yīng)的響應(yīng)以及在非生物脅迫中的表達進行研究。對于煙草FBA基因特征特性研究結(jié)果如下:（1）在煙草中鑒定出16個FBA均屬于I類FBA,具有保守的糖酵解結(jié)構(gòu)域,亞細胞定位發(fā)現(xiàn)NtFBA1-10定位于葉綠體,NtFBA11-16定位于細胞質(zhì)。對其理化性質(zhì)進行分析,包括蛋白ID、所在的基因ID、蛋白質(zhì)長度、蛋白質(zhì)分子量、氨基酸等電點和親水性平均系數(shù),NtFBAs基因的理化性質(zhì)存在很大的相似性,只有NtFBA6和NtFBA10與其他成員存在差異性。（2）NtFBAs和其他物種FBA基因進行系統(tǒng)發(fā)育分析表明,NtFBAs與II類FBA基因較大差異性,與I類F... 

【文章來源】：山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省

【文章頁數(shù)】：55 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

FBA基因的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系

煙草果糖-1,6-二磷酸醛縮酶基因的系統(tǒng)鑒定、特性分析及其非生物脅迫響應(yīng)研究22NtFBA11-NtFBA16只含有9個保守motif，分別為motif1-motif9，并不含有motif10。其中NtFBA6只含有motif1/2/4/9/10，NtFBA10只含有motif1/2/4/9（圖2）�？梢钥闯鰉otif1/2/4/9是所有煙草FBA基因家族成員所具有的的motif，是典型的糖酵解結(jié)構(gòu)域。S1和S2中的NtFBA具有相同的motif，表明這些成員的蛋白功能具有相似性。圖2煙草FBA基因的motif分布Fig.2distributionofconserveddomainofNtFBAs通過ClustalX2軟件對煙草FBA基因家族成員進行了多重序列比對，結(jié)果顯示每個NtFBA都具有高度保守性（圖3）。煙草FBA基因都含有保守的糖酵解結(jié)構(gòu)域，圖中所示的motif1/2/4/9都屬于糖酵解結(jié)構(gòu)域，它們在NtFBAs的功能調(diào)控過程中起到關(guān)鍵性作用。

山東農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士專業(yè)學(xué)位論文23圖3煙草FBA基因的多重序列比對和保守基序特征(A)煙草FBA基因的多重序列比對(B)煙草FBA基因的保守基序Fig.3MultiplesequencealignmentandconservedmotifcharacteristicsofN.tabacumFBAgenes(A)MultiplesequencealignmentandconservedmotifcharacteristicsofNtFBAs(B)ConservedmotifsintheNtFBAs*(A)紅色框中的氨基酸殘基代表4個motifTheaminoacidresiduesintheredboxrepresent4motifs3.4NtFBAs的基因結(jié)構(gòu)分析為了研究煙草FBA基因結(jié)構(gòu)的特異性和多樣性，通過在線軟件GSDS對煙草16個FBA基因結(jié)構(gòu)進行分析，主要對內(nèi)含子與外顯子的個數(shù)和位置進行分析。對煙草FBA基因組注釋文件進行處理，將得到的該家族基因的內(nèi)含子與外顯子的長度以及位置信息輸入在線軟GSDS得到基因結(jié)構(gòu)圖（圖4）。從圖中可以看出16個NtFBAs具有高度相似

【參考文獻】：
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