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蕭喙扁蝽Brachyrhynchus hsiaoi(Bl(?)te,1965)不同地理種群遺傳多樣性研究及分歧時(shí)間估算

發(fā)布時(shí)間:2021-05-13 23:34
  蕭喙扁蝽(Brachyrhynchus hsiaoi)隸屬于昆蟲(chóng)綱(Insect)半翅目(Hemiptera)扁蝽總科(Aradoidea)扁蝽科(Aradidae)短喙扁蝽屬(Brachyrhynchus Laporte,1833)。本文對(duì)6個(gè)蕭喙扁蝽地理種群進(jìn)行遺傳多樣性分析,選取2個(gè)線(xiàn)粒體基因(COⅠ、16S rRNA)與2個(gè)核基因(18S rDNA、28S rDNA)為研究對(duì)象,利用種群的單倍型及其網(wǎng)絡(luò)圖、遺傳分化系數(shù)Fst、AMOVA、中性檢驗(yàn)(Tajima’D值和Fu’sFs值)和Mismatch錯(cuò)配分析其種群間的遺傳多樣性及其種群遺傳結(jié)構(gòu),從而進(jìn)一步揭示蕭喙扁蝽種群的進(jìn)化規(guī)律及歷史動(dòng)態(tài),為研究扁蝽科多樣性提供理論依據(jù)。此外,本文還測(cè)定6個(gè)地理種群的蕭喙扁蝽線(xiàn)粒體基因組,并利用線(xiàn)粒體基因組數(shù)據(jù)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)(ML,BI)和利用化石標(biāo)記估算不同地點(diǎn)蕭喙扁蝽的種群分歧時(shí)間。研究主要得出以下結(jié)果:(1)6個(gè)樣點(diǎn)蕭喙扁蝽的線(xiàn)粒體基因組大小介于15,009-15,247bp之間,是一個(gè)環(huán)狀閉合的DNA分子結(jié)構(gòu),由37個(gè)基因和1個(gè)AT富集構(gòu)成,37個(gè)基因包括13個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因、22個(gè)... 

【文章來(lái)源】:內(nèi)蒙古師范大學(xué)內(nèi)蒙古自治區(qū)

【文章頁(yè)數(shù)】:103 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【文章目錄】:
中文摘要
abstract
1 前言
    1.1 蕭喙扁蝽研究概述
        1.1.1 蕭喙扁蝽分類(lèi)地位
        1.1.2 蕭喙扁蝽形態(tài)學(xué)特征
        1.1.3 蕭喙扁蝽研究現(xiàn)狀
    1.2 遺傳多樣性研究概述
        1.2.1 遺傳多樣性
        1.2.2 遺傳多樣性研究方法
    1.3 線(xiàn)粒體基因組及分歧時(shí)間估算
        1.3.1 線(xiàn)粒體基因組特征
        1.3.2 半翅目昆蟲(chóng)線(xiàn)粒體基因組研究現(xiàn)狀
2 基于線(xiàn)粒體基因組對(duì)蕭喙扁蝽6個(gè)地理種群的進(jìn)化分析
    2.1 實(shí)驗(yàn)方法
        2.1.1 樣本采集與線(xiàn)粒體基因組測(cè)序
        2.1.2 測(cè)序方法
        2.1.3 基因注釋及分析方法
        2.1.4 基于蛋白質(zhì)編碼基因構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)
        2.1.5 分歧時(shí)間估算
    2.2 結(jié)果分析
        2.2.1 線(xiàn)粒體基因組結(jié)果分析
        2.2.2 基于PCGs系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系分析
3 蕭喙扁蝽不同地理種群多樣性研究
    3.1 實(shí)驗(yàn)材料及方法
        3.1.1 樣本采集
        3.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑
        3.1.3 實(shí)驗(yàn)方法
    3.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析
        3.2.1 序列組成分析
        3.2.2 遺傳多樣性分析
        3.2.3 單倍型結(jié)果分析
        3.2.4 種群遺傳結(jié)構(gòu)分析
        3.2.5 堿基錯(cuò)配分布
        3.2.6 不同蕭喙扁蝽地理種群系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)
4 討論
    4.1 蕭喙扁蝽線(xiàn)粒體基因組
    4.2 系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系
    4.3 分歧時(shí)間估算
    4.4 蕭喙扁蝽種群的遺傳多樣性
    4.5 蕭喙扁蝽種群的遺傳結(jié)構(gòu)
5 結(jié)論與展望
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
攻讀學(xué)位期間研究成果及獎(jiǎng)勵(lì)
論文資助項(xiàng)目


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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碩士論文
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[4]島嶼隔離對(duì)桔小實(shí)蠅種群遺傳多樣性的影響[D]. 易春燕.華南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[5]草履蚧不同寄主和地理種群分化及遺傳多樣性研究[D]. 劉全超.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[6]雙鉤異翅長(zhǎng)蠹不同地理種群遺傳多樣性研究[D]. 舒騫.西南林業(yè)大學(xué) 2010



本文編號(hào):3184901

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