蕭喙扁蝽Brachyrhynchus hsiaoi(Bl(?)te,1965)不同地理種群遺傳多樣性研究及分歧時間估算
發(fā)布時間:2021-05-13 23:34
蕭喙扁蝽(Brachyrhynchus hsiaoi)隸屬于昆蟲綱(Insect)半翅目(Hemiptera)扁蝽總科(Aradoidea)扁蝽科(Aradidae)短喙扁蝽屬(Brachyrhynchus Laporte,1833)。本文對6個蕭喙扁蝽地理種群進(jìn)行遺傳多樣性分析,選取2個線粒體基因(COⅠ、16S rRNA)與2個核基因(18S rDNA、28S rDNA)為研究對象,利用種群的單倍型及其網(wǎng)絡(luò)圖、遺傳分化系數(shù)Fst、AMOVA、中性檢驗(Tajima’D值和Fu’sFs值)和Mismatch錯配分析其種群間的遺傳多樣性及其種群遺傳結(jié)構(gòu),從而進(jìn)一步揭示蕭喙扁蝽種群的進(jìn)化規(guī)律及歷史動態(tài),為研究扁蝽科多樣性提供理論依據(jù)。此外,本文還測定6個地理種群的蕭喙扁蝽線粒體基因組,并利用線粒體基因組數(shù)據(jù)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(ML,BI)和利用化石標(biāo)記估算不同地點蕭喙扁蝽的種群分歧時間。研究主要得出以下結(jié)果:(1)6個樣點蕭喙扁蝽的線粒體基因組大小介于15,009-15,247bp之間,是一個環(huán)狀閉合的DNA分子結(jié)構(gòu),由37個基因和1個AT富集構(gòu)成,37個基因包括13個蛋白質(zhì)編碼基因、22個...
【文章來源】:內(nèi)蒙古師范大學(xué)內(nèi)蒙古自治區(qū)
【文章頁數(shù)】:103 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
abstract
1 前言
1.1 蕭喙扁蝽研究概述
1.1.1 蕭喙扁蝽分類地位
1.1.2 蕭喙扁蝽形態(tài)學(xué)特征
1.1.3 蕭喙扁蝽研究現(xiàn)狀
1.2 遺傳多樣性研究概述
1.2.1 遺傳多樣性
1.2.2 遺傳多樣性研究方法
1.3 線粒體基因組及分歧時間估算
1.3.1 線粒體基因組特征
1.3.2 半翅目昆蟲線粒體基因組研究現(xiàn)狀
2 基于線粒體基因組對蕭喙扁蝽6個地理種群的進(jìn)化分析
2.1 實驗方法
2.1.1 樣本采集與線粒體基因組測序
2.1.2 測序方法
2.1.3 基因注釋及分析方法
2.1.4 基于蛋白質(zhì)編碼基因構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹
2.1.5 分歧時間估算
2.2 結(jié)果分析
2.2.1 線粒體基因組結(jié)果分析
2.2.2 基于PCGs系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系分析
3 蕭喙扁蝽不同地理種群多樣性研究
3.1 實驗材料及方法
3.1.1 樣本采集
3.1.2 實驗試劑
3.1.3 實驗方法
3.2 實驗結(jié)果分析
3.2.1 序列組成分析
3.2.2 遺傳多樣性分析
3.2.3 單倍型結(jié)果分析
3.2.4 種群遺傳結(jié)構(gòu)分析
3.2.5 堿基錯配分布
3.2.6 不同蕭喙扁蝽地理種群系統(tǒng)發(fā)育樹
4 討論
4.1 蕭喙扁蝽線粒體基因組
4.2 系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系
4.3 分歧時間估算
4.4 蕭喙扁蝽種群的遺傳多樣性
4.5 蕭喙扁蝽種群的遺傳結(jié)構(gòu)
5 結(jié)論與展望
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
攻讀學(xué)位期間研究成果及獎勵
論文資助項目
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]蝎蝽次目線粒體基因組22個tRNA基因的比較研究(半翅目:異翅亞目)[J]. 張丹麗,張苗苗,田菁,李悅銳,張虎芳. 山西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2019(01)
[2]30種半翅目昆蟲線粒體COⅠ基因密碼子偏好性聚類分析[J]. 張玉波,周中艷,王廷慧,鄧娟. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(14)
[3]基于線粒體COI基因序列的大豆食心蟲不同地理種群遺傳分化[J]. 史樹森,崔娟,朱詩禹,徐偉,王小奇. 植物保護(hù)學(xué)報. 2018(02)
[4]不同地理種群白紋伊蚊線粒體基因COI的遺傳多樣性分析[J]. 張瑞玲,姚廣琴,潘曉倩,馬德珍,趙愛華,張忠. 中國人獸共患病學(xué)報. 2017(04)
[5]基于線粒體COI基因序列的內(nèi)蒙古沙蔥螢葉甲種群遺傳多樣性及遺傳分化[J]. 張鵬飛,周曉榕,龐保平,譚瑤,田帥. 環(huán)境昆蟲學(xué)報. 2017(02)
[6]鱗翅目昆蟲遺傳多樣性研究進(jìn)展[J]. 許濤,王鈺婷,李瑞雪,王偉. 中國市場. 2015(19)
[7]巨膜長蝽形態(tài)特征及生物學(xué)特征的初步研究[J]. 白曉拴,楊春旺,李陽梅,史曙光. 內(nèi)蒙古大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2013(04)
[8]巨膜長蝽形態(tài)結(jié)構(gòu)的研究[J]. 白曉拴,鞏寒月,能乃扎布. 內(nèi)蒙古師范大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)漢文版). 2013(01)
[9]不同氣候適應(yīng)類型果蠅體色黑化可塑性的適應(yīng)性變化(英文)[J]. Ravi PARKASH,Seema RAMNIWAS,Chanderkala LAMBHOD,Babita KAJLA. 昆蟲學(xué)報. 2011(10)
[10]中國桃蛀螟不同地理種群的遺傳多樣性[J]. 張穎,李菁,王振營,何康來. 昆蟲學(xué)報. 2010(09)
博士論文
[1]異翅亞目昆蟲比較線粒體基因組學(xué)及系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系研究[D]. 姜培.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]中國菜蝽屬DNA條形碼和線粒體基因組學(xué)研究(半翅目:蝽科)[D]. 趙婉清.山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[3]我國禾谷縊管蚜種群遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)及農(nóng)藥對其脅迫效應(yīng)研究[D]. 段辛樂.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2015
[4]基于線粒體基因?qū)μO果蠹蛾和梨小食心蟲不同地理種群遺傳結(jié)構(gòu)的研究[D]. 李亦松.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[5]我國桃樹桃蚜不同地理種群遺傳多樣性分析[D]. 李杰.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[6]不同地理種群二點委夜蛾遺傳多樣性以及不同世代寄主間轉(zhuǎn)移規(guī)律[D]. 陳方.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2015
[7]中國不同地理種群環(huán)棱螺遺傳多樣性和分類階元的研究[D]. 顧錢洪.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[8]中國麥紅吸漿蟲不同地理種群的遺傳結(jié)構(gòu)及遺傳多樣性研究[D]. 段云.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2013
[9]基于微衛(wèi)星分子標(biāo)記的中國疫區(qū)內(nèi)蘋果蠹蛾Cydia pomonella(L.)種群遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)研究[D]. 門秋雷.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2012
[10]沙棘木蠹蛾地理種群遺傳多樣性研究[D]. 馬超德.北京林業(yè)大學(xué) 2008
碩士論文
[1]基于mtDNA COI和ND5基因的香梨優(yōu)斑螟種群遺傳結(jié)構(gòu)研究[D]. 尚北晨.塔里木大學(xué) 2018
[2]新疆馬鈴薯甲蟲遺傳多樣性分析及SSR引物篩選[D]. 劉旸.石河子大學(xué) 2017
[3]基于線粒體基因的不同地理種群大豆蚜遺傳分化研究[D]. 李冉.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[4]島嶼隔離對桔小實蠅種群遺傳多樣性的影響[D]. 易春燕.華南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[5]草履蚧不同寄主和地理種群分化及遺傳多樣性研究[D]. 劉全超.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[6]雙鉤異翅長蠹不同地理種群遺傳多樣性研究[D]. 舒騫.西南林業(yè)大學(xué) 2010
本文編號:3184901
【文章來源】:內(nèi)蒙古師范大學(xué)內(nèi)蒙古自治區(qū)
【文章頁數(shù)】:103 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
abstract
1 前言
1.1 蕭喙扁蝽研究概述
1.1.1 蕭喙扁蝽分類地位
1.1.2 蕭喙扁蝽形態(tài)學(xué)特征
1.1.3 蕭喙扁蝽研究現(xiàn)狀
1.2 遺傳多樣性研究概述
1.2.1 遺傳多樣性
1.2.2 遺傳多樣性研究方法
1.3 線粒體基因組及分歧時間估算
1.3.1 線粒體基因組特征
1.3.2 半翅目昆蟲線粒體基因組研究現(xiàn)狀
2 基于線粒體基因組對蕭喙扁蝽6個地理種群的進(jìn)化分析
2.1 實驗方法
2.1.1 樣本采集與線粒體基因組測序
2.1.2 測序方法
2.1.3 基因注釋及分析方法
2.1.4 基于蛋白質(zhì)編碼基因構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹
2.1.5 分歧時間估算
2.2 結(jié)果分析
2.2.1 線粒體基因組結(jié)果分析
2.2.2 基于PCGs系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系分析
3 蕭喙扁蝽不同地理種群多樣性研究
3.1 實驗材料及方法
3.1.1 樣本采集
3.1.2 實驗試劑
3.1.3 實驗方法
3.2 實驗結(jié)果分析
3.2.1 序列組成分析
3.2.2 遺傳多樣性分析
3.2.3 單倍型結(jié)果分析
3.2.4 種群遺傳結(jié)構(gòu)分析
3.2.5 堿基錯配分布
3.2.6 不同蕭喙扁蝽地理種群系統(tǒng)發(fā)育樹
4 討論
4.1 蕭喙扁蝽線粒體基因組
4.2 系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系
4.3 分歧時間估算
4.4 蕭喙扁蝽種群的遺傳多樣性
4.5 蕭喙扁蝽種群的遺傳結(jié)構(gòu)
5 結(jié)論與展望
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
攻讀學(xué)位期間研究成果及獎勵
論文資助項目
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]蝎蝽次目線粒體基因組22個tRNA基因的比較研究(半翅目:異翅亞目)[J]. 張丹麗,張苗苗,田菁,李悅銳,張虎芳. 山西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2019(01)
[2]30種半翅目昆蟲線粒體COⅠ基因密碼子偏好性聚類分析[J]. 張玉波,周中艷,王廷慧,鄧娟. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(14)
[3]基于線粒體COI基因序列的大豆食心蟲不同地理種群遺傳分化[J]. 史樹森,崔娟,朱詩禹,徐偉,王小奇. 植物保護(hù)學(xué)報. 2018(02)
[4]不同地理種群白紋伊蚊線粒體基因COI的遺傳多樣性分析[J]. 張瑞玲,姚廣琴,潘曉倩,馬德珍,趙愛華,張忠. 中國人獸共患病學(xué)報. 2017(04)
[5]基于線粒體COI基因序列的內(nèi)蒙古沙蔥螢葉甲種群遺傳多樣性及遺傳分化[J]. 張鵬飛,周曉榕,龐保平,譚瑤,田帥. 環(huán)境昆蟲學(xué)報. 2017(02)
[6]鱗翅目昆蟲遺傳多樣性研究進(jìn)展[J]. 許濤,王鈺婷,李瑞雪,王偉. 中國市場. 2015(19)
[7]巨膜長蝽形態(tài)特征及生物學(xué)特征的初步研究[J]. 白曉拴,楊春旺,李陽梅,史曙光. 內(nèi)蒙古大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2013(04)
[8]巨膜長蝽形態(tài)結(jié)構(gòu)的研究[J]. 白曉拴,鞏寒月,能乃扎布. 內(nèi)蒙古師范大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)漢文版). 2013(01)
[9]不同氣候適應(yīng)類型果蠅體色黑化可塑性的適應(yīng)性變化(英文)[J]. Ravi PARKASH,Seema RAMNIWAS,Chanderkala LAMBHOD,Babita KAJLA. 昆蟲學(xué)報. 2011(10)
[10]中國桃蛀螟不同地理種群的遺傳多樣性[J]. 張穎,李菁,王振營,何康來. 昆蟲學(xué)報. 2010(09)
博士論文
[1]異翅亞目昆蟲比較線粒體基因組學(xué)及系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系研究[D]. 姜培.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]中國菜蝽屬DNA條形碼和線粒體基因組學(xué)研究(半翅目:蝽科)[D]. 趙婉清.山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[3]我國禾谷縊管蚜種群遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)及農(nóng)藥對其脅迫效應(yīng)研究[D]. 段辛樂.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2015
[4]基于線粒體基因?qū)μO果蠹蛾和梨小食心蟲不同地理種群遺傳結(jié)構(gòu)的研究[D]. 李亦松.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[5]我國桃樹桃蚜不同地理種群遺傳多樣性分析[D]. 李杰.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[6]不同地理種群二點委夜蛾遺傳多樣性以及不同世代寄主間轉(zhuǎn)移規(guī)律[D]. 陳方.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2015
[7]中國不同地理種群環(huán)棱螺遺傳多樣性和分類階元的研究[D]. 顧錢洪.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[8]中國麥紅吸漿蟲不同地理種群的遺傳結(jié)構(gòu)及遺傳多樣性研究[D]. 段云.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2013
[9]基于微衛(wèi)星分子標(biāo)記的中國疫區(qū)內(nèi)蘋果蠹蛾Cydia pomonella(L.)種群遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)研究[D]. 門秋雷.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2012
[10]沙棘木蠹蛾地理種群遺傳多樣性研究[D]. 馬超德.北京林業(yè)大學(xué) 2008
碩士論文
[1]基于mtDNA COI和ND5基因的香梨優(yōu)斑螟種群遺傳結(jié)構(gòu)研究[D]. 尚北晨.塔里木大學(xué) 2018
[2]新疆馬鈴薯甲蟲遺傳多樣性分析及SSR引物篩選[D]. 劉旸.石河子大學(xué) 2017
[3]基于線粒體基因的不同地理種群大豆蚜遺傳分化研究[D]. 李冉.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[4]島嶼隔離對桔小實蠅種群遺傳多樣性的影響[D]. 易春燕.華南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[5]草履蚧不同寄主和地理種群分化及遺傳多樣性研究[D]. 劉全超.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[6]雙鉤異翅長蠹不同地理種群遺傳多樣性研究[D]. 舒騫.西南林業(yè)大學(xué) 2010
本文編號:3184901
本文鏈接:http://sikaile.net/shoufeilunwen/zaizhiyanjiusheng/3184901.html
最近更新
教材專著