中華烏塘鱧四個Caspase家族基因及在副溶血弧菌和病毒擬似物Poly(I:C)脅迫下的表達分析
發(fā)布時間:2021-05-07 21:33
細胞凋亡(Apoptosis)是一個主動、高度有序且由基因決定的自動使細胞生命終止的過程,在保證多細胞生物健康發(fā)育的過程中扮演者重要的角色。它對生物體進化、維持細胞內(nèi)環(huán)境穩(wěn)定和維持組織中細胞數(shù)量起著關(guān)鍵性作用。在生物免疫學(xué)領(lǐng)域,細胞凋亡的過程有同一系列的蛋白家族的參與。其中,半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶家族(Cysteine aspartic acid specific protease,Caspases)是可以直接觸發(fā)細胞凋亡被解體的蛋白酶體系,并在細胞凋亡的進程中發(fā)揮著重要的作用。本研究主要對中華烏塘鱧的Bscasp-1、Bscasp-7、Bscasp-8和Bscasp-9基因進行了序列鑒定、進化分析和表達分析。其中,Bscasp-1,Bscasp-7,Bscasp-8和Bscasp-9基因蛋白序列分別編碼390bp,314bp,478bp和435bp個氨基酸。Bscasp-1和Bscasp-9基因包含三個結(jié)構(gòu)域,一個caspase募集結(jié)構(gòu)域(CARD)和CASc結(jié)構(gòu)域,其中CASc結(jié)構(gòu)域包含一個P20大亞基結(jié)構(gòu)域和一個P10小亞基結(jié)構(gòu)域。Bscasp-8基因具有兩個死亡效應(yīng)域(Deat...
【文章來源】:浙江海洋大學(xué)浙江省
【文章頁數(shù)】:92 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻綜述
1.1 中華烏塘鱧簡介
1.1.1 生活習(xí)性
1.1.2 養(yǎng)殖現(xiàn)狀
1.2 細胞凋亡概述
1.2.1 細胞凋亡激活的方式
1.3 Caspase家族基因研究概述
1.3.1 Caspase家族結(jié)構(gòu)特征
1.3.2 Caspase家族分類
1.4 Caspase家族在哺乳類的研究
1.5 Caspase家族在魚類的研究
1.6 研究目的和意義
第二章 中華烏塘鱧Caspase家族細胞凋亡炎癥組基因的克隆與表達分析
2.1 實驗材料
2.1.1 實驗動物
2.1.2 菌種
2.1.3 引物
2.1.4 實驗試劑與配制方法
2.2 實驗方法
2.2.1 病原菌感染和病原刺激實驗
2.2.2 總RNA提取實驗
2.2.3 cDNA合成
2.2.4 中華烏塘鱧Caspase-1 基因的CDS序列克隆
2.2.5 中華烏塘鱧Caspase-1 基因的序列分析方法
2.2.6 實時熒光定量PCR實驗
2.3 實驗結(jié)果
2.3.1 中華烏塘鱧caspase-1 基因的ORF序列及推導(dǎo)氨基酸序列的特征
2.3.2 中華烏塘鱧與其他脊椎動物的caspase-1基因氨基酸序列同源性分析
2.3.3 中華烏塘鱧caspase-1 基因系統(tǒng)進化關(guān)系分析
2.4 中華烏塘鱧caspase-1 基因的組織表達分析
2.4.1 中華烏塘鱧caspase-1 基因在不同組織中的表達結(jié)果
2.4.2 感染副溶血弧菌后中華烏塘鱧caspase-1 基因的表達變化
2.4.3 Poly(I:C)刺激后中華烏塘鱧caspase-1 基因的表達變化
2.5 討論
第三章 中華烏塘鱧Caspase家族細胞凋亡起始組基因的克隆與表達分析
3.1 實驗材料
3.1.1 實驗動物
3.1.2 菌種
3.1.3 引物
3.1.4 實驗試劑與配制方法
3.2 實驗方法
3.2.1 病原菌感染和病原刺激實驗
3.2.2 總RNA提取實驗
3.2.3 cDNA合成
3.2.4 中華烏塘鱧Caspase-8,-9 基因的CDS序列克隆
3.2.5 中華烏塘鱧Caspase-8,-9 基因的序列分析方法
3.2.6 實時熒光定量PCR實驗
3.3 實驗結(jié)果
3.3.1 中華烏塘鱧caspase-8 基因的ORF序列及推導(dǎo)氨基酸序列的特征
3.3.2 中華烏塘鱧與其他脊椎動物的caspase-8 基因氨基酸序列同源性分析
3.3.3 中華烏塘鱧caspase-8 基因系統(tǒng)進化關(guān)系分析
3.3.4 中華烏塘鱧caspase-9 基因的ORF序列及推導(dǎo)氨基酸序列的特征
3.3.5 中華烏塘鱧與其他脊椎動物的caspase-9 基因氨基酸序列同源性分析
3.3.6 中華烏塘鱧caspase-9 基因系統(tǒng)進化關(guān)系分析
3.4 中華烏塘鱧caspase-8,-9 基因的組織表達分析
3.4.1 中華烏塘鱧caspase-8,-9 基因在不同組織中的表達結(jié)果
3.4.2 感染副溶血弧菌后中華烏塘鱧caspase-8,-9 基因的表達變化
3.4.3 Poly(I:C)刺激后中華烏塘鱧caspase-8,-9 基因的表達變化
3.5 討論
第四章 中華烏塘鱧Caspase家族細胞凋亡效應(yīng)組基因的克隆與表達分析
4.1 實驗材料
4.1.1 實驗動物
4.1.2 菌種
4.1.3 引物
4.1.4 實驗試劑與配制方法
4.2 實驗方法
4.2.1 病原菌感染和病原刺激實驗
4.2.2 總RNA提取實驗
4.2.3 cDNA合成
4.2.4 中華烏塘鱧Caspase-7 基因的CDS序列克隆
4.2.5 中華烏塘鱧Caspase-7 基因的序列分析方法
4.2.6 實時熒光定量PCR實驗
4.3 實驗結(jié)果
4.3.1 中華烏塘鱧caspase-7 基因的ORF序列及推導(dǎo)氨基酸序列的特征
4.3.2 中華烏塘鱧與其他脊椎動物的caspase-7 基因氨基酸序列同源性分析
4.3.3 中華烏塘鱧caspase-7 基因系統(tǒng)進化關(guān)系分析
4.4 中華烏塘鱧caspase-7 基因的組織表達分析
4.4.1 中華烏塘鱧caspase-7 基因在不同組織中的表達結(jié)果
4.4.2 感染副溶血弧菌后中華烏塘鱧caspase-7 基因的表達變化
4.4.3 Poly(I:C)刺激后中華烏塘鱧caspase-7 基因的表達變化
4.5 討論
結(jié)論
參考文獻
致謝
在讀期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文及研究成果
【參考文獻】:
期刊論文
[1]牙齦卟啉單胞菌感染通過激活NLRP3小體誘導(dǎo)牙周膜細胞炎癥反應(yīng)及凋亡效應(yīng)[J]. 蘇陽. 中國微生態(tài)學(xué)雜志. 2020(01)
[2]線粒體動力學(xué)與細胞凋亡[J]. 鄭凱,楊梅桂,閆朝君,湯明亮,宋質(zhì)銀. 中國細胞生物學(xué)學(xué)報. 2019(08)
[3]3種不同來源中華烏塘鱧成魚肉質(zhì)比較分析[J]. 陸宇哲,潘紅平,王帥,劉文光,喻亞麗,何力,閻冰. 南方農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2018(10)
[4]內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激中Caspase-12的核心作用[J]. 謝羽,孫警輝,伍春蓮. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2017(09)
[5]Responses of heat shock protein 70 and caspase-3/7 to dietary selenomethionine in juvenile white sturgeon[J]. Weifang Wang,Seunghyung Lee,Silas S.O.Hung. Animal Nutrition. 2016(01)
[6]中華烏塘鱧池塘養(yǎng)殖技術(shù)[J]. 鄭守專. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2012(18)
[7]半胱氨酰天冬氨酸特異性蛋白酶-3抑制劑早期干預(yù)在膿毒癥急性腎損傷中的作用[J]. 劉麗霞,李勇,胡振杰,蘇潔,霍焱,檀碧波. 中華實驗外科雜志. 2012 (09)
[8]中華烏塘鱧養(yǎng)殖方法[J]. 冼康強. 農(nóng)家科技. 2012(03)
[9]東部沿海貝類中副溶血弧菌的分布及特征[J]. 趙峰,周德慶,于維森,王偉棟,李毅財,劉帥帥. 食品與生物技術(shù)學(xué)報. 2011(05)
[10]Caspase-1在炎癥及程序性細胞死亡過程中的作用[J]. 鄔皓晨,陳勇軍,徐易塵,沈萍萍. 中國細胞生物學(xué)學(xué)報. 2011(02)
碩士論文
[1]大黃魚HSP及caspase家族部分基因?qū)囟让{迫的響應(yīng)[D]. 楊啟蓮.集美大學(xué) 2011
本文編號:3174093
【文章來源】:浙江海洋大學(xué)浙江省
【文章頁數(shù)】:92 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻綜述
1.1 中華烏塘鱧簡介
1.1.1 生活習(xí)性
1.1.2 養(yǎng)殖現(xiàn)狀
1.2 細胞凋亡概述
1.2.1 細胞凋亡激活的方式
1.3 Caspase家族基因研究概述
1.3.1 Caspase家族結(jié)構(gòu)特征
1.3.2 Caspase家族分類
1.4 Caspase家族在哺乳類的研究
1.5 Caspase家族在魚類的研究
1.6 研究目的和意義
第二章 中華烏塘鱧Caspase家族細胞凋亡炎癥組基因的克隆與表達分析
2.1 實驗材料
2.1.1 實驗動物
2.1.2 菌種
2.1.3 引物
2.1.4 實驗試劑與配制方法
2.2 實驗方法
2.2.1 病原菌感染和病原刺激實驗
2.2.2 總RNA提取實驗
2.2.3 cDNA合成
2.2.4 中華烏塘鱧Caspase-1 基因的CDS序列克隆
2.2.5 中華烏塘鱧Caspase-1 基因的序列分析方法
2.2.6 實時熒光定量PCR實驗
2.3 實驗結(jié)果
2.3.1 中華烏塘鱧caspase-1 基因的ORF序列及推導(dǎo)氨基酸序列的特征
2.3.2 中華烏塘鱧與其他脊椎動物的caspase-1基因氨基酸序列同源性分析
2.3.3 中華烏塘鱧caspase-1 基因系統(tǒng)進化關(guān)系分析
2.4 中華烏塘鱧caspase-1 基因的組織表達分析
2.4.1 中華烏塘鱧caspase-1 基因在不同組織中的表達結(jié)果
2.4.2 感染副溶血弧菌后中華烏塘鱧caspase-1 基因的表達變化
2.4.3 Poly(I:C)刺激后中華烏塘鱧caspase-1 基因的表達變化
2.5 討論
第三章 中華烏塘鱧Caspase家族細胞凋亡起始組基因的克隆與表達分析
3.1 實驗材料
3.1.1 實驗動物
3.1.2 菌種
3.1.3 引物
3.1.4 實驗試劑與配制方法
3.2 實驗方法
3.2.1 病原菌感染和病原刺激實驗
3.2.2 總RNA提取實驗
3.2.3 cDNA合成
3.2.4 中華烏塘鱧Caspase-8,-9 基因的CDS序列克隆
3.2.5 中華烏塘鱧Caspase-8,-9 基因的序列分析方法
3.2.6 實時熒光定量PCR實驗
3.3 實驗結(jié)果
3.3.1 中華烏塘鱧caspase-8 基因的ORF序列及推導(dǎo)氨基酸序列的特征
3.3.2 中華烏塘鱧與其他脊椎動物的caspase-8 基因氨基酸序列同源性分析
3.3.3 中華烏塘鱧caspase-8 基因系統(tǒng)進化關(guān)系分析
3.3.4 中華烏塘鱧caspase-9 基因的ORF序列及推導(dǎo)氨基酸序列的特征
3.3.5 中華烏塘鱧與其他脊椎動物的caspase-9 基因氨基酸序列同源性分析
3.3.6 中華烏塘鱧caspase-9 基因系統(tǒng)進化關(guān)系分析
3.4 中華烏塘鱧caspase-8,-9 基因的組織表達分析
3.4.1 中華烏塘鱧caspase-8,-9 基因在不同組織中的表達結(jié)果
3.4.2 感染副溶血弧菌后中華烏塘鱧caspase-8,-9 基因的表達變化
3.4.3 Poly(I:C)刺激后中華烏塘鱧caspase-8,-9 基因的表達變化
3.5 討論
第四章 中華烏塘鱧Caspase家族細胞凋亡效應(yīng)組基因的克隆與表達分析
4.1 實驗材料
4.1.1 實驗動物
4.1.2 菌種
4.1.3 引物
4.1.4 實驗試劑與配制方法
4.2 實驗方法
4.2.1 病原菌感染和病原刺激實驗
4.2.2 總RNA提取實驗
4.2.3 cDNA合成
4.2.4 中華烏塘鱧Caspase-7 基因的CDS序列克隆
4.2.5 中華烏塘鱧Caspase-7 基因的序列分析方法
4.2.6 實時熒光定量PCR實驗
4.3 實驗結(jié)果
4.3.1 中華烏塘鱧caspase-7 基因的ORF序列及推導(dǎo)氨基酸序列的特征
4.3.2 中華烏塘鱧與其他脊椎動物的caspase-7 基因氨基酸序列同源性分析
4.3.3 中華烏塘鱧caspase-7 基因系統(tǒng)進化關(guān)系分析
4.4 中華烏塘鱧caspase-7 基因的組織表達分析
4.4.1 中華烏塘鱧caspase-7 基因在不同組織中的表達結(jié)果
4.4.2 感染副溶血弧菌后中華烏塘鱧caspase-7 基因的表達變化
4.4.3 Poly(I:C)刺激后中華烏塘鱧caspase-7 基因的表達變化
4.5 討論
結(jié)論
參考文獻
致謝
在讀期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文及研究成果
【參考文獻】:
期刊論文
[1]牙齦卟啉單胞菌感染通過激活NLRP3小體誘導(dǎo)牙周膜細胞炎癥反應(yīng)及凋亡效應(yīng)[J]. 蘇陽. 中國微生態(tài)學(xué)雜志. 2020(01)
[2]線粒體動力學(xué)與細胞凋亡[J]. 鄭凱,楊梅桂,閆朝君,湯明亮,宋質(zhì)銀. 中國細胞生物學(xué)學(xué)報. 2019(08)
[3]3種不同來源中華烏塘鱧成魚肉質(zhì)比較分析[J]. 陸宇哲,潘紅平,王帥,劉文光,喻亞麗,何力,閻冰. 南方農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2018(10)
[4]內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激中Caspase-12的核心作用[J]. 謝羽,孫警輝,伍春蓮. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2017(09)
[5]Responses of heat shock protein 70 and caspase-3/7 to dietary selenomethionine in juvenile white sturgeon[J]. Weifang Wang,Seunghyung Lee,Silas S.O.Hung. Animal Nutrition. 2016(01)
[6]中華烏塘鱧池塘養(yǎng)殖技術(shù)[J]. 鄭守專. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2012(18)
[7]半胱氨酰天冬氨酸特異性蛋白酶-3抑制劑早期干預(yù)在膿毒癥急性腎損傷中的作用[J]. 劉麗霞,李勇,胡振杰,蘇潔,霍焱,檀碧波. 中華實驗外科雜志. 2012 (09)
[8]中華烏塘鱧養(yǎng)殖方法[J]. 冼康強. 農(nóng)家科技. 2012(03)
[9]東部沿海貝類中副溶血弧菌的分布及特征[J]. 趙峰,周德慶,于維森,王偉棟,李毅財,劉帥帥. 食品與生物技術(shù)學(xué)報. 2011(05)
[10]Caspase-1在炎癥及程序性細胞死亡過程中的作用[J]. 鄔皓晨,陳勇軍,徐易塵,沈萍萍. 中國細胞生物學(xué)學(xué)報. 2011(02)
碩士論文
[1]大黃魚HSP及caspase家族部分基因?qū)囟让{迫的響應(yīng)[D]. 楊啟蓮.集美大學(xué) 2011
本文編號:3174093
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