水稻紋枯病菌及稻曲病菌LAMP檢測體系的建立與應(yīng)用
發(fā)布時(shí)間:2021-04-20 23:45
水稻紋枯病和稻曲病是水稻生長過程中嚴(yán)重影響水稻產(chǎn)量和質(zhì)量的兩大重要病害,隨著施肥水平的提高和種植制度的多樣化,水稻紋枯病和稻曲病的發(fā)生日趨嚴(yán)重。本研究利用分子鑒定的方法明確了中國東北主要稻區(qū)水稻紋枯病病原菌種類及融合群的歸屬情況,并分別建立了水稻紋枯病優(yōu)勢致病菌茄絲核菌(Rhizoctomia solani AG1-IA)及稻曲病菌(Ustilaginoidea virens)的環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)檢測體系,實(shí)現(xiàn)了兩種病原菌的田間快速檢測。具體研究結(jié)果如下:東北三省水稻紋枯病原菌種類及融合群的分子鑒定:2015-2017年從黑龍江省、吉林省和遼寧省的17個水稻主產(chǎn)區(qū)采集水稻紋枯病病樣,分離得到水稻紋枯病菌214株,運(yùn)用不同病原菌及融合群的特異性引物對214株水稻紋枯病菌進(jìn)行病原菌種類和融合群鑒定,并利用r DNA內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(ITS)序列分析法,對供試水稻絲核菌的融合群歸屬進(jìn)行了分析。結(jié)果表明:供試214株水稻紋枯病菌分屬于茄絲核菌(Rhizoctonia solani)和水稻絲核菌(Rhizocton...
【文章來源】:沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】:86 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 水稻紋枯病菌和稻曲病菌檢測方法研究進(jìn)展
1.1 水稻紋枯病及其病原菌研究概況
1.1.1 水稻紋枯病的危害與癥狀
1.1.2 水稻紋枯病原菌特性及其分類
1.1.3 絲核菌融合群鑒定方法研究進(jìn)展
1.1.4 水稻紋枯病菌的侵染循環(huán)
1.2 水稻紋枯病菌(Rhizoctonia solani AG1-IA)檢測方法研究進(jìn)展
1.2.1 常規(guī)組織分離病原菌檢測
1.2.2 現(xiàn)代生物分子技術(shù)檢測方法研究進(jìn)展(Rhizoctonia solani AG1-IA)
1.3 稻曲病及其病原菌研究概況
1.3.1 稻曲病的危害與癥狀
1.3.2 稻曲病菌侵染循環(huán)
1.4 稻曲病菌(Ustilaginoidea virens)檢測方法研究進(jìn)展
1.4.1 常規(guī)組織分離病原菌檢測
1.4.2 現(xiàn)代生物分子技術(shù)檢測方法研究進(jìn)展(Ustilaginoidea virens)
1.5 環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)(LAMP)研究進(jìn)展
1.5.1 LAMP技術(shù)的原理和結(jié)果判定方法
1.5.2 LAMP技術(shù)的應(yīng)用
1.5.3 LAMP技術(shù)的優(yōu)點(diǎn)和不足
1.6 論文選題依據(jù)
第二章 東北三省水稻紋枯病原菌種類及融合群的分子鑒定
2.1 材料與方法
2.1.1 供試水稻紋枯病菌的采集和分離
2.1.2 供試培養(yǎng)基
2.1.3 供試試劑
2.1.4 供試儀器
2.1.5 供試水稻紋枯病菌DNA提取
2.1.6 供試菌株的PCR分子鑒定及ITS序列分析
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 東北三省水稻紋枯病病原菌種類鑒定
2.2.2 茄絲核菌融合群分子鑒定
2.2.3 水稻絲核菌融合群ITS序列分析
2.3 本章小結(jié)
第三章 水稻紋枯病菌LAMP檢測體系的建立及應(yīng)用
3.1 材料與方法
3.1.1 供試菌株
3.1.2 引物設(shè)計(jì)與篩選
3.1.3 LAMP反應(yīng)體系的建立及優(yōu)化
3.1.4 LAMP反應(yīng)擴(kuò)增結(jié)果判斷方法
3.1.5 RS-ITS-LAMP體系的特異性驗(yàn)證
3.1.6 RS-ITS-LAMP體系靈敏度檢測
3.1.7 RS-ITS-LAMP檢測技術(shù)的應(yīng)用
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 RS-ITS-LAMP體系的反應(yīng)時(shí)間和反應(yīng)溫度
3.2.2 RS-ITS-LAMP的反應(yīng)體系優(yōu)化
3.2.3 RS-ITS-LAMP體系的特異性驗(yàn)證
3.2.4 RS-ITS-LAMP體系靈敏度檢測
3.2.5 人工接種發(fā)病植株檢測
3.2.6 田間發(fā)病植株檢測
3.2.7 人工添加菌絲的土壤靈敏度檢測
3.2.8 田間土壤樣品檢測
3.3 本章小結(jié)
第四章 稻曲病菌LAMP檢測體系的建立及應(yīng)用
4.1 材料與方法
4.1.1 供試菌株
4.1.2 引物設(shè)計(jì)與篩選
4.1.3 LAMP反應(yīng)體系的建立及優(yōu)化
4.1.4 LAMP反應(yīng)擴(kuò)增結(jié)果判斷方法
4.1.5 UV-tef-LAMP體系的特異性驗(yàn)證和通用性驗(yàn)證
4.1.6 UV-tef-LAMP體系靈敏度檢測
4.1.7 UV-tef-LAMP檢測技術(shù)的應(yīng)用
4.2 結(jié)果與分析
4.2.1 UV-tef-LAMP體系的反應(yīng)時(shí)間和反應(yīng)溫度
4.2.2 稻曲病菌UV-tef-LAMP反應(yīng)體系單因素優(yōu)化
4.2.3 稻曲病菌UV-tef-LAMP引物的特異性驗(yàn)證及通用性驗(yàn)證
4.2.4 稻曲病菌UV-tef-LAMP體系靈敏度檢測
4.2.5 人工添加稻曲病菌分生孢子的土壤靈敏度檢測
4.2.6 人工添加稻曲病菌厚垣孢子的土壤靈敏度檢測
4.2.7 田間自然發(fā)病不同形態(tài)稻曲球的LAMP檢測
4.2.8 稻田土壤中稻曲病菌的LAMP檢測
4.3 本章小結(jié)
第五章 結(jié)論與討論
5.1 結(jié)論
5.1.1 東北三省水稻紋枯病原菌種類及融合群的鑒定
5.1.2 水稻紋枯病菌(Rhizoctonia solani AG1-IA)LAMP檢測體系的建立與應(yīng)用
5.1.3 稻曲病菌(Ustilaginoidea virens)LAMP檢測體系的建立與應(yīng)用
5.2 討論
5.2.1 東北三省稻區(qū)水稻紋枯病原菌種類及融合群鑒定
5.2.2 水稻紋枯病菌(Rhizoctonia solani AG1-IA)LAMP檢測體系
5.2.3 稻曲病菌(Ustilaginoidea virens)LAMP檢測體系
參考文獻(xiàn)
致謝
攻讀學(xué)位期間發(fā)表文章
本文編號:3150625
【文章來源】:沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】:86 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 水稻紋枯病菌和稻曲病菌檢測方法研究進(jìn)展
1.1 水稻紋枯病及其病原菌研究概況
1.1.1 水稻紋枯病的危害與癥狀
1.1.2 水稻紋枯病原菌特性及其分類
1.1.3 絲核菌融合群鑒定方法研究進(jìn)展
1.1.4 水稻紋枯病菌的侵染循環(huán)
1.2 水稻紋枯病菌(Rhizoctonia solani AG1-IA)檢測方法研究進(jìn)展
1.2.1 常規(guī)組織分離病原菌檢測
1.2.2 現(xiàn)代生物分子技術(shù)檢測方法研究進(jìn)展(Rhizoctonia solani AG1-IA)
1.3 稻曲病及其病原菌研究概況
1.3.1 稻曲病的危害與癥狀
1.3.2 稻曲病菌侵染循環(huán)
1.4 稻曲病菌(Ustilaginoidea virens)檢測方法研究進(jìn)展
1.4.1 常規(guī)組織分離病原菌檢測
1.4.2 現(xiàn)代生物分子技術(shù)檢測方法研究進(jìn)展(Ustilaginoidea virens)
1.5 環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)(LAMP)研究進(jìn)展
1.5.1 LAMP技術(shù)的原理和結(jié)果判定方法
1.5.2 LAMP技術(shù)的應(yīng)用
1.5.3 LAMP技術(shù)的優(yōu)點(diǎn)和不足
1.6 論文選題依據(jù)
第二章 東北三省水稻紋枯病原菌種類及融合群的分子鑒定
2.1 材料與方法
2.1.1 供試水稻紋枯病菌的采集和分離
2.1.2 供試培養(yǎng)基
2.1.3 供試試劑
2.1.4 供試儀器
2.1.5 供試水稻紋枯病菌DNA提取
2.1.6 供試菌株的PCR分子鑒定及ITS序列分析
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 東北三省水稻紋枯病病原菌種類鑒定
2.2.2 茄絲核菌融合群分子鑒定
2.2.3 水稻絲核菌融合群ITS序列分析
2.3 本章小結(jié)
第三章 水稻紋枯病菌LAMP檢測體系的建立及應(yīng)用
3.1 材料與方法
3.1.1 供試菌株
3.1.2 引物設(shè)計(jì)與篩選
3.1.3 LAMP反應(yīng)體系的建立及優(yōu)化
3.1.4 LAMP反應(yīng)擴(kuò)增結(jié)果判斷方法
3.1.5 RS-ITS-LAMP體系的特異性驗(yàn)證
3.1.6 RS-ITS-LAMP體系靈敏度檢測
3.1.7 RS-ITS-LAMP檢測技術(shù)的應(yīng)用
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 RS-ITS-LAMP體系的反應(yīng)時(shí)間和反應(yīng)溫度
3.2.2 RS-ITS-LAMP的反應(yīng)體系優(yōu)化
3.2.3 RS-ITS-LAMP體系的特異性驗(yàn)證
3.2.4 RS-ITS-LAMP體系靈敏度檢測
3.2.5 人工接種發(fā)病植株檢測
3.2.6 田間發(fā)病植株檢測
3.2.7 人工添加菌絲的土壤靈敏度檢測
3.2.8 田間土壤樣品檢測
3.3 本章小結(jié)
第四章 稻曲病菌LAMP檢測體系的建立及應(yīng)用
4.1 材料與方法
4.1.1 供試菌株
4.1.2 引物設(shè)計(jì)與篩選
4.1.3 LAMP反應(yīng)體系的建立及優(yōu)化
4.1.4 LAMP反應(yīng)擴(kuò)增結(jié)果判斷方法
4.1.5 UV-tef-LAMP體系的特異性驗(yàn)證和通用性驗(yàn)證
4.1.6 UV-tef-LAMP體系靈敏度檢測
4.1.7 UV-tef-LAMP檢測技術(shù)的應(yīng)用
4.2 結(jié)果與分析
4.2.1 UV-tef-LAMP體系的反應(yīng)時(shí)間和反應(yīng)溫度
4.2.2 稻曲病菌UV-tef-LAMP反應(yīng)體系單因素優(yōu)化
4.2.3 稻曲病菌UV-tef-LAMP引物的特異性驗(yàn)證及通用性驗(yàn)證
4.2.4 稻曲病菌UV-tef-LAMP體系靈敏度檢測
4.2.5 人工添加稻曲病菌分生孢子的土壤靈敏度檢測
4.2.6 人工添加稻曲病菌厚垣孢子的土壤靈敏度檢測
4.2.7 田間自然發(fā)病不同形態(tài)稻曲球的LAMP檢測
4.2.8 稻田土壤中稻曲病菌的LAMP檢測
4.3 本章小結(jié)
第五章 結(jié)論與討論
5.1 結(jié)論
5.1.1 東北三省水稻紋枯病原菌種類及融合群的鑒定
5.1.2 水稻紋枯病菌(Rhizoctonia solani AG1-IA)LAMP檢測體系的建立與應(yīng)用
5.1.3 稻曲病菌(Ustilaginoidea virens)LAMP檢測體系的建立與應(yīng)用
5.2 討論
5.2.1 東北三省稻區(qū)水稻紋枯病原菌種類及融合群鑒定
5.2.2 水稻紋枯病菌(Rhizoctonia solani AG1-IA)LAMP檢測體系
5.2.3 稻曲病菌(Ustilaginoidea virens)LAMP檢測體系
參考文獻(xiàn)
致謝
攻讀學(xué)位期間發(fā)表文章
本文編號:3150625
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