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蒺藜苜蓿轉(zhuǎn)錄因子SSR分子標(biāo)記的開發(fā)與應(yīng)用及LEA基因家族功能分析

發(fā)布時(shí)間:2021-03-13 16:30
  作為重要的豆科模式植物,蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)能夠?yàn)槠渌箍谱魑锖湍敛萏峁┲匾倪z傳信息。微衛(wèi)星分子標(biāo)記技術(shù)是目前最先進(jìn)的分子標(biāo)記之一,轉(zhuǎn)錄因子在調(diào)節(jié)動(dòng)植物生長發(fā)育以及響應(yīng)外界環(huán)境脅迫等方面發(fā)揮重要作用。截至目前,已對蒺藜苜蓿EST-SSR進(jìn)行了大量研究,但基于轉(zhuǎn)錄因子開發(fā)的SSR分子標(biāo)記尚未見報(bào)道。本研究利用在線工具開發(fā)蒺藜苜蓿轉(zhuǎn)錄因子SSR引物共142對,選取70對引物對蒺藜苜蓿,紫花苜蓿(Medicago sativa),煙草(Nicotiana tabacum),水稻(Oryza sativa),箭(?)豌豆(Vicia sativa)和擬南芥(Arabidopsis thaliana)種內(nèi)和種間通用性進(jìn)行了研究。研究結(jié)果顯示,187條蒺藜苜蓿轉(zhuǎn)錄因子家族的編碼序列中搜索得到213個(gè)SSRs位點(diǎn),SSR出現(xiàn)頻率為14.52%。通用性檢測發(fā)現(xiàn),轉(zhuǎn)錄因子引物在紫花苜蓿,煙草,水稻,箭(?)豌豆和擬南芥中的通用率分別為77.14%,25.71%,27.14%,38.57%和47.14%。由此可見,新開發(fā)的分子標(biāo)記在不同物種間遺傳連鎖圖譜構(gòu)建、基因組比較及Q... 

【文章來源】:蘭州大學(xué)甘肅省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:60 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

蒺藜苜蓿轉(zhuǎn)錄因子SSR分子標(biāo)記的開發(fā)與應(yīng)用及LEA基因家族功能分析


圖1蔡黎首猜轉(zhuǎn)錄因子家族??Fig.l?The?transcription?factor?fairdly?in?Me流:口各0?護(hù)W7C幻化/幻??

基因,紫花,實(shí)驗(yàn)要求,擬南芥


3.3?DNA提取??基因組DNA電泳結(jié)果可W反應(yīng)所提取DNA的質(zhì)量。如圖,是一條集中的??窄帶,無彌散和拖帶,表明DNA較為完整,符合實(shí)驗(yàn)要求(圖2);???1?2?3?4?5?6??■H??圖2基因組DNA提取??Fig.2?Genomic?DNA?extraction??注:1為蔡藝首猜;2為紫花首蒂;3為煙草;4為水稻;5為箭當(dāng)就豆;6為擬南芥。??Note:?1?is?i"epresented?fbr?Me成C幻go?/rw灼C幻成/幻,2?is?represented?for?M化//c口go?化說Va,3?is??represented?for?.Vico/i。炕们煽陟叮粱茫悖鳎,?4?is?represented?fbr?Ojz口?s如zV幻,5?is?represented?for??口??sativa,?6?is?represented?for?Arabidopsis?thaliana.??21??

條染,基因,染色體定位,染色體


植物全基因組數(shù)據(jù)庫獲得較為準(zhǔn)確的i:丘4基因起始位點(diǎn)信息。利用染色體定位??繪圖軟件Mapdiaxt,得到蔡黎首猜I么4基因家族染色體定位圖。??圖5中展示了王基因在蔡黎首稻8條染色體上的分布,定位結(jié)果可W明??顯地看出該類型基因在染色體上的分布極不均勻。23個(gè)王丘4基因廣泛分布于除??第6條染色體W外的其他7條染色體上。王基因在染色體上的具體分布如下:??第2、4和7條染色體上含有最多的Z色4基因,各有5個(gè)LEA成員定位在上面;??其次為第1和第3條染色體上各有3個(gè)基因分布;而第5和第8條染色體上分布??最少,僅有一個(gè)LEL4基因。??29??

【參考文獻(xiàn)】:
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本文編號:3080553

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