利用CRISPR/Cas9基因編輯技術(shù)創(chuàng)制水稻抽穗期突變體
發(fā)布時(shí)間:2021-02-16 01:51
水稻(Oryza sativa L)抽穗期是和水稻產(chǎn)量密切相關(guān)的農(nóng)藝性狀,由品種遺傳特性決定,是水稻生長發(fā)育過程中由營養(yǎng)生長過渡到生殖生長的關(guān)鍵時(shí)期,對環(huán)境變化(溫度、光照)的響應(yīng)十分敏感。近幾十年來關(guān)于抽穗的基因陸續(xù)被挖掘出來,然而在不同的遺傳背景下很難對比出這些基因的表型效應(yīng)。本研究利用CRISPR/Cas9基因編輯技術(shù)和分子標(biāo)記輔助選擇在野生型粳稻品種Sasanishiki的遺傳背景下編輯了14個(gè)抽穗期突變體。本研究調(diào)查了光周期敏感性,抽穗時(shí)間和產(chǎn)量相關(guān)性狀之間的關(guān)系。主要研究結(jié)果如下:(1)研究發(fā)現(xiàn)晚抽穗與長生育期有關(guān),而長生育期又與較大的生物量有關(guān),這可能會(huì)保證較高的產(chǎn)量。所有的早抽穗突變體都降低了產(chǎn)量,這與基本營養(yǎng)生長期不充足會(huì)顯著降低產(chǎn)量有關(guān)。產(chǎn)量隨著抽穗時(shí)間的增加而提高,但是一旦到達(dá)峰值,生物量隨著抽穗期的增加而增加,但是產(chǎn)量開始下降。(2)突變體對抽穗時(shí)間和產(chǎn)量相關(guān)性狀方面的影響有顯著差異,研究結(jié)果表明,感光性基因突變體由于縮短了營養(yǎng)生長期,嚴(yán)重影響了水稻的株高和生物量,進(jìn)而影響產(chǎn)量。雙突變體即使與單突變體抽穗期相似,但產(chǎn)量也有顯著降低。在實(shí)際應(yīng)用中可利用不同基因的不...
【文章來源】:沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】:57 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
Sasanishiki及相關(guān)品種的血緣關(guān)系
2利用CRISPR/Cas9基因編輯技術(shù)構(gòu)建抽穗期突變體24圖2-2Sasanishiki和Nipponbare的Hd1基因序列差異區(qū)域示意圖Fig.2-2TheschematicmapofthegenomicregionsofHd1inSasanishikiandNipponbare表2-110個(gè)抽穗期相關(guān)基因及其對水稻抽穗期的響應(yīng)特點(diǎn)Table2-1Detailsofthetargetgenesmodifiedinthisstudy基因分子功能突變效應(yīng)功能型參考文獻(xiàn)GenesMolecularfunctionMutanteffectFunctionReferencesSe13光敏色素合成酶失去感光性FYoshitakeetal.(2015)PhyB同光敏色素B功能類似失去感光性FIshikawaetal.(2011)Se14合成JMJC蛋白降低感光性FYokooetal.(2014)Hd3a成花素延遲抽穗并減少分蘗FKomiyaetal.(2003)Ef7擬南芥ELF3同源蛋白延長營養(yǎng)生長期FSaitoetal.(2012)RFT1成花素延遲抽穗FKomiyaetal.(2003)Ehd1B型反應(yīng)調(diào)節(jié)因子延長營養(yǎng)生長期FDoietal.(2004)Hd1擬南芥CONSTANS同源蛋白減弱感光性NYanoetal.(2000)Ghd7CCT結(jié)構(gòu)蛋白減弱感光性FXueetal.(2008)Dth8HAP3亞基減弱感光性FWeietal.(2010)注:F和N分別表示功能型(F)和非功能型(N)等位基因。Note:FandNrepresentfunctional(F)andnonfunctional(N)alleles,respectively.2.2.2利用CRISPR/Cas9技術(shù)編輯10個(gè)抽穗期基因突變體為了明確抽穗期基因?qū)λ旧诤彤a(chǎn)量構(gòu)成因素的作用,本研究利用CRISPR/Cas9基因編輯技術(shù)對10個(gè)抽穗期主要基因進(jìn)行了基因編輯(表2-1),并成功篩選到帶有突變基因的10個(gè)抽穗期純合突變體(Li等,2017)。為了研究T0代的基因突變效率,對每個(gè)突變體的20個(gè)單株進(jìn)行DNA提取,并利用Sanger測序法檢測序。測序結(jié)果中的單峰為純合突變,雙峰為雜合突變(附錄2)。結(jié)果顯示200株T0代植株中共有100個(gè)植株發(fā)生了突變,平均突變效率為50%,其中T0代植株突變效率最低為35%,最高可達(dá)到70%?
2利用CRISPR/Cas9基因編輯技術(shù)構(gòu)建抽穗期突變體26圖2-3CRISPR/cas9誘導(dǎo)的抽穗相關(guān)基因單突變體及其表型Fig.2-3CRISPR/Cas9-inducedsingleheadingtime-relatedmutantsandtheirphenotype圖像右側(cè)為抽穗期基因突變區(qū)域及向?qū)NA(sgRNA)靶位圖以及野生型(WT)與突變體的序列比對;箭頭表示抽出的穗;這些圖像是在每個(gè)突變體或WT抽穗時(shí)拍攝,比例尺為20cm
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]我國水稻育種發(fā)展現(xiàn)狀、展望及對策[J]. 周正平,占小登,沈希宏,曹立勇. 中國稻米. 2019(05)
[2]CRISPR/Cas植物基因組編輯技術(shù)研究進(jìn)展[J]. 劉耀光,李構(gòu)思,張雅玲,陳樂天. 華南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2019(05)
[3]水稻抽穗期分子調(diào)控研究進(jìn)展[J]. 蔣丹,洪廣成,陳倩,劉石鋒,秦小健. 分子植物育種. 2019(21)
[4]水稻開花光周期調(diào)控相關(guān)基因研究進(jìn)展[J]. 孔德艷,陳守俊,周立國,高歡,羅利軍,劉灶長. 遺傳. 2016(06)
[5]水稻開花期調(diào)控分子機(jī)理研究進(jìn)展[J]. 徐銓,奧本裕,王曉雪. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2014(01)
[6]水稻抽穗期遺傳與分子調(diào)控機(jī)理研究進(jìn)展[J]. 胡時(shí)開,蘇巖,葉衛(wèi)軍,郭龍彪. 中國水稻科學(xué). 2012(03)
[7]水稻重要農(nóng)藝性狀的兩年QTL剖析[J]. 郭龍彪,羅利軍,邢永忠,徐才國,梅捍衛(wèi),王一平,鐘代彬,錢前,應(yīng)存山,石春海. 中國水稻科學(xué). 2003(03)
[8]晚稻早穗原因及其防止措施[J]. 苗昌澤. 安徽農(nóng)業(yè). 2001(06)
博士論文
[1]水稻中調(diào)控抽穗期的關(guān)鍵基因OsCOL13的克隆與生化分析[D]. 盛培科.湖南大學(xué) 2016
本文編號:3035926
【文章來源】:沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】:57 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
Sasanishiki及相關(guān)品種的血緣關(guān)系
2利用CRISPR/Cas9基因編輯技術(shù)構(gòu)建抽穗期突變體24圖2-2Sasanishiki和Nipponbare的Hd1基因序列差異區(qū)域示意圖Fig.2-2TheschematicmapofthegenomicregionsofHd1inSasanishikiandNipponbare表2-110個(gè)抽穗期相關(guān)基因及其對水稻抽穗期的響應(yīng)特點(diǎn)Table2-1Detailsofthetargetgenesmodifiedinthisstudy基因分子功能突變效應(yīng)功能型參考文獻(xiàn)GenesMolecularfunctionMutanteffectFunctionReferencesSe13光敏色素合成酶失去感光性FYoshitakeetal.(2015)PhyB同光敏色素B功能類似失去感光性FIshikawaetal.(2011)Se14合成JMJC蛋白降低感光性FYokooetal.(2014)Hd3a成花素延遲抽穗并減少分蘗FKomiyaetal.(2003)Ef7擬南芥ELF3同源蛋白延長營養(yǎng)生長期FSaitoetal.(2012)RFT1成花素延遲抽穗FKomiyaetal.(2003)Ehd1B型反應(yīng)調(diào)節(jié)因子延長營養(yǎng)生長期FDoietal.(2004)Hd1擬南芥CONSTANS同源蛋白減弱感光性NYanoetal.(2000)Ghd7CCT結(jié)構(gòu)蛋白減弱感光性FXueetal.(2008)Dth8HAP3亞基減弱感光性FWeietal.(2010)注:F和N分別表示功能型(F)和非功能型(N)等位基因。Note:FandNrepresentfunctional(F)andnonfunctional(N)alleles,respectively.2.2.2利用CRISPR/Cas9技術(shù)編輯10個(gè)抽穗期基因突變體為了明確抽穗期基因?qū)λ旧诤彤a(chǎn)量構(gòu)成因素的作用,本研究利用CRISPR/Cas9基因編輯技術(shù)對10個(gè)抽穗期主要基因進(jìn)行了基因編輯(表2-1),并成功篩選到帶有突變基因的10個(gè)抽穗期純合突變體(Li等,2017)。為了研究T0代的基因突變效率,對每個(gè)突變體的20個(gè)單株進(jìn)行DNA提取,并利用Sanger測序法檢測序。測序結(jié)果中的單峰為純合突變,雙峰為雜合突變(附錄2)。結(jié)果顯示200株T0代植株中共有100個(gè)植株發(fā)生了突變,平均突變效率為50%,其中T0代植株突變效率最低為35%,最高可達(dá)到70%?
2利用CRISPR/Cas9基因編輯技術(shù)構(gòu)建抽穗期突變體26圖2-3CRISPR/cas9誘導(dǎo)的抽穗相關(guān)基因單突變體及其表型Fig.2-3CRISPR/Cas9-inducedsingleheadingtime-relatedmutantsandtheirphenotype圖像右側(cè)為抽穗期基因突變區(qū)域及向?qū)NA(sgRNA)靶位圖以及野生型(WT)與突變體的序列比對;箭頭表示抽出的穗;這些圖像是在每個(gè)突變體或WT抽穗時(shí)拍攝,比例尺為20cm
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]我國水稻育種發(fā)展現(xiàn)狀、展望及對策[J]. 周正平,占小登,沈希宏,曹立勇. 中國稻米. 2019(05)
[2]CRISPR/Cas植物基因組編輯技術(shù)研究進(jìn)展[J]. 劉耀光,李構(gòu)思,張雅玲,陳樂天. 華南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2019(05)
[3]水稻抽穗期分子調(diào)控研究進(jìn)展[J]. 蔣丹,洪廣成,陳倩,劉石鋒,秦小健. 分子植物育種. 2019(21)
[4]水稻開花光周期調(diào)控相關(guān)基因研究進(jìn)展[J]. 孔德艷,陳守俊,周立國,高歡,羅利軍,劉灶長. 遺傳. 2016(06)
[5]水稻開花期調(diào)控分子機(jī)理研究進(jìn)展[J]. 徐銓,奧本裕,王曉雪. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2014(01)
[6]水稻抽穗期遺傳與分子調(diào)控機(jī)理研究進(jìn)展[J]. 胡時(shí)開,蘇巖,葉衛(wèi)軍,郭龍彪. 中國水稻科學(xué). 2012(03)
[7]水稻重要農(nóng)藝性狀的兩年QTL剖析[J]. 郭龍彪,羅利軍,邢永忠,徐才國,梅捍衛(wèi),王一平,鐘代彬,錢前,應(yīng)存山,石春海. 中國水稻科學(xué). 2003(03)
[8]晚稻早穗原因及其防止措施[J]. 苗昌澤. 安徽農(nóng)業(yè). 2001(06)
博士論文
[1]水稻中調(diào)控抽穗期的關(guān)鍵基因OsCOL13的克隆與生化分析[D]. 盛培科.湖南大學(xué) 2016
本文編號:3035926
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