茭白黑粉菌交配型基因類型測定和功能分析
發(fā)布時間:2021-01-18 10:38
茭白黑粉菌(Ustilago esculenta)與菰草(Zizania latifolia)互作在其上部產(chǎn)生膨大結(jié)構(gòu),稱為茭白。茭白是一種重要的水生蔬菜。茭白黑粉菌以菌絲體的形式長期存活在寄主體內(nèi),通過寄主的無性繁殖轉(zhuǎn)移到新的植株中,具有獨(dú)特的生活史。有時,膨大的組織內(nèi)產(chǎn)生大量的冬孢子堆,稱為灰茭。雖然冬孢子可以萌發(fā)產(chǎn)生擔(dān)孢子,但大量的觀察認(rèn)為不同交配型的擔(dān)孢子不能融合產(chǎn)生雙核菌絲,因而不能侵染寄主。研究認(rèn)為,擔(dān)孢子可融合為雙核菌絲,但還沒有充分的證據(jù)證實。因此,本文通過大量的擔(dān)孢子株系交配基因的測定以及人工合成交配基因編碼的蛋白,評價其功能作用。1.茭白黑粉菌的交配型基因表達(dá)分析。利用local blast在對茭白黑粉菌6條MFA基因和3條PRA基因表達(dá)分析后,發(fā)現(xiàn)關(guān)于交配型的基因全部表達(dá),但在浙茭2號中,茭白黑粉菌只含有a2位點單倍體和a3位點單倍體,灰茭黑粉菌只含有a1位點和a3位點單倍體,PRA的基因類型可以作為浙茭2號交配型的鑒定依據(jù)。2.真菌分離及交配型基因的測定。通過浙茭2號灰茭組織分離,獲得6個株系。通過冬孢子萌發(fā)產(chǎn)生擔(dān)孢子及其單孢分離,獲得50個株系。同樣,通過浙茭...
【文章來源】:浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:70 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
灰茭黑粉菌雙核菌絲株系PRA1檢測
浙江大學(xué)碩士學(xué)位論文第三章茭白黑粉菌交配型的研究24以灰茭黑粉菌的6個雙核菌絲株系(DH1~6)的DNA為模板,以PRA2-F/PRA2-R為引物,進(jìn)行PCR檢測,發(fā)現(xiàn)6個株系的條帶都不亮,說明沒有PRA2基因。以灰茭黑粉菌的6個雙核菌絲株系(DH1~6)的DNA為模板,以PRA3-F/PRA3-R為引物,進(jìn)行PCR檢測,發(fā)現(xiàn)6個株系的條帶都亮,公司測序之后均與已知PRA3序列一致(圖3.2),說明說明DH1~6株系都含有PRA3基因。圖3.2灰茭黑粉菌雙核菌絲株系PRA3檢測。M:DL2000Marker,泳道1~6(DH1~6),顯示了2239bp的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物。Figure3.2DeterminationofPRA3ofdikaryotichyphaeofU.esculentafromhuijiaoplants.M:2000bpMarker,Lane1-6(DH1~6)showtheamplificationproductof2239bp.根據(jù)PCR結(jié)果及測序序列比對分析,DH1~6包含交配型基因a1位點和a3位點(表3.3)。表3.3灰茭黑粉菌雙核菌絲株系a位點測定Table3.3DeterminationoflocusaofdikaryotichyphaeinU.esculentafromhuijiaoplantsa位點類型a1a2a3PRA1MFA1.2MFA1.3PRA2MFA2.1MFA2.3PRA3MFA3.1MFA3.2DH1+++---+++DH2+++---+++DH3+++---+++DH4+++---+++DH5+++---+++DH6+++---+++*+表示檢測到基因片段;—表示未檢測到基因片段。3.2.2.2灰茭黑粉菌單孢株系a位點類型PCR檢測以灰茭黑粉菌的50個單孢株系(H1~50)的DNA為模板,以PRA1-F/PRA1-
浙江大學(xué)碩士學(xué)位論文第三章茭白黑粉菌交配型的研究25R為引物,進(jìn)行PCR檢測,發(fā)現(xiàn)只有H9、H14、H23、H36和H43條帶亮,將條帶亮的樣本送去測序,公司測序結(jié)果均與已知PRA1序列一致(圖3.3),說明含有PRA1基因。圖3.3灰茭黑粉菌單孢株系PRA1檢測。M:DL2000Marker,泳道1-50(H1-50),泳道(9,14,23,36,43)顯示了1277bp的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物。Figure3.3DeterminationofPRA1genesfromsingle-sporeisolatesofU.esculentafromhuijiaoplants.M:2000bpMarker,Lane1-50(H1-50),Lane(9,14,23,36,43)showtheamplificationproductof1127bp.以灰茭黑粉菌的50個單孢株系(H1~50)DNA為模板,以PRA2-F/PRA2-R為引物,進(jìn)行PCR檢測,沒有亮的條帶,說明沒有PRA2基因。以灰茭黑粉菌的50個單孢株系(H1~50)的DNA為模板,以PRA3-F/PRA3-R為引物,進(jìn)行PCR檢測,發(fā)現(xiàn)只有H9、H14、H23、H36和H43條帶不亮,其余條帶都亮,將條帶亮的樣本送去測序,公司測序結(jié)果均與已知PRA3序列一致,說明含有PRA3基因(圖3.4)。圖3.4灰茭黑粉菌單孢株系PRA3檢測。M:DL2000Marker,泳道1-50(H1-50),泳道(1~8,10~13,15~22,24~35,37~42,44~50)顯示了2239bp的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物。Figure3.4DeterminationofPRA3genesfromsingle-sporeisolatesofU.esculentafromhuijiaoplants.M:2000bpMarker,Lane1-50(H1-50),Lane(1~8,10~13,15~22,24~35,37~42,44~50)showtheamplificationproductof2239bp.
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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碩士論文
[1]茭白黑粉菌二型態(tài)轉(zhuǎn)換的影響因素分析及乙醛酸循環(huán)關(guān)鍵基因功能初探[D]. 劉俊平.中國計量學(xué)院 2014
[2]茭白黑粉菌cAMP及MAPK途徑關(guān)鍵基因的克隆及表達(dá)分析[D]. 應(yīng)榮.中國計量學(xué)院 2014
本文編號:2984804
【文章來源】:浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:70 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
灰茭黑粉菌雙核菌絲株系PRA1檢測
浙江大學(xué)碩士學(xué)位論文第三章茭白黑粉菌交配型的研究24以灰茭黑粉菌的6個雙核菌絲株系(DH1~6)的DNA為模板,以PRA2-F/PRA2-R為引物,進(jìn)行PCR檢測,發(fā)現(xiàn)6個株系的條帶都不亮,說明沒有PRA2基因。以灰茭黑粉菌的6個雙核菌絲株系(DH1~6)的DNA為模板,以PRA3-F/PRA3-R為引物,進(jìn)行PCR檢測,發(fā)現(xiàn)6個株系的條帶都亮,公司測序之后均與已知PRA3序列一致(圖3.2),說明說明DH1~6株系都含有PRA3基因。圖3.2灰茭黑粉菌雙核菌絲株系PRA3檢測。M:DL2000Marker,泳道1~6(DH1~6),顯示了2239bp的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物。Figure3.2DeterminationofPRA3ofdikaryotichyphaeofU.esculentafromhuijiaoplants.M:2000bpMarker,Lane1-6(DH1~6)showtheamplificationproductof2239bp.根據(jù)PCR結(jié)果及測序序列比對分析,DH1~6包含交配型基因a1位點和a3位點(表3.3)。表3.3灰茭黑粉菌雙核菌絲株系a位點測定Table3.3DeterminationoflocusaofdikaryotichyphaeinU.esculentafromhuijiaoplantsa位點類型a1a2a3PRA1MFA1.2MFA1.3PRA2MFA2.1MFA2.3PRA3MFA3.1MFA3.2DH1+++---+++DH2+++---+++DH3+++---+++DH4+++---+++DH5+++---+++DH6+++---+++*+表示檢測到基因片段;—表示未檢測到基因片段。3.2.2.2灰茭黑粉菌單孢株系a位點類型PCR檢測以灰茭黑粉菌的50個單孢株系(H1~50)的DNA為模板,以PRA1-F/PRA1-
浙江大學(xué)碩士學(xué)位論文第三章茭白黑粉菌交配型的研究25R為引物,進(jìn)行PCR檢測,發(fā)現(xiàn)只有H9、H14、H23、H36和H43條帶亮,將條帶亮的樣本送去測序,公司測序結(jié)果均與已知PRA1序列一致(圖3.3),說明含有PRA1基因。圖3.3灰茭黑粉菌單孢株系PRA1檢測。M:DL2000Marker,泳道1-50(H1-50),泳道(9,14,23,36,43)顯示了1277bp的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物。Figure3.3DeterminationofPRA1genesfromsingle-sporeisolatesofU.esculentafromhuijiaoplants.M:2000bpMarker,Lane1-50(H1-50),Lane(9,14,23,36,43)showtheamplificationproductof1127bp.以灰茭黑粉菌的50個單孢株系(H1~50)DNA為模板,以PRA2-F/PRA2-R為引物,進(jìn)行PCR檢測,沒有亮的條帶,說明沒有PRA2基因。以灰茭黑粉菌的50個單孢株系(H1~50)的DNA為模板,以PRA3-F/PRA3-R為引物,進(jìn)行PCR檢測,發(fā)現(xiàn)只有H9、H14、H23、H36和H43條帶不亮,其余條帶都亮,將條帶亮的樣本送去測序,公司測序結(jié)果均與已知PRA3序列一致,說明含有PRA3基因(圖3.4)。圖3.4灰茭黑粉菌單孢株系PRA3檢測。M:DL2000Marker,泳道1-50(H1-50),泳道(1~8,10~13,15~22,24~35,37~42,44~50)顯示了2239bp的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物。Figure3.4DeterminationofPRA3genesfromsingle-sporeisolatesofU.esculentafromhuijiaoplants.M:2000bpMarker,Lane1-50(H1-50),Lane(1~8,10~13,15~22,24~35,37~42,44~50)showtheamplificationproductof2239bp.
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[2]茭白黑粉菌cAMP及MAPK途徑關(guān)鍵基因的克隆及表達(dá)分析[D]. 應(yīng)榮.中國計量學(xué)院 2014
本文編號:2984804
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